More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00017 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1036 aa  2129    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1773  TonB-dependent receptor  58.91 
 
 		 1047 aa  1199    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.133871  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  36.81 
 
 		 964 aa  598  1e-169  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  35.96 
 
 		 964 aa  568  1e-160  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 		 892 aa  322  1.9999999999999998e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 927 aa  313  9e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  28.6 
 
 		 875 aa  306  2.0000000000000002e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 875 aa  304  6.000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 887 aa  288  5e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  27.96 
 
 		 878 aa  287  7e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  27.96 
 
 		 878 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  27.86 
 
 		 878 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 887 aa  285  4.0000000000000003e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  27.86 
 
 		 878 aa  285  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 868 aa  283  1e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 845 aa  282  2e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 900 aa  281  4e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 868 aa  280  7e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 881 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 882 aa  270  1e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1136  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 892 aa  261  4e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3426  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 902 aa  261  5.0000000000000005e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0666258  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  26.66 
 
 		 926 aa  260  1e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 915 aa  234  8.000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  36.01 
 
 		 859 aa  221  7.999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 922 aa  193  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1940  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 1010 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  24.95 
 
 		 904 aa  188  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02805  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 984 aa  187  9e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3278  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 1006 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000542759  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  33.07 
 
 		 948 aa  179  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  34.46 
 
 		 869 aa  177  6e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  33.23 
 
 		 1109 aa  175  3.9999999999999995e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  34.21 
 
 		 888 aa  175  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  34.4 
 
 		 874 aa  175  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  32.88 
 
 		 951 aa  175  5e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  32.88 
 
 		 951 aa  174  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  32.88 
 
 		 951 aa  173  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  34.56 
 
 		 870 aa  172  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  34.88 
 
 		 872 aa  171  8e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  31.44 
 
 		 880 aa  171  9e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  31.87 
 
 		 874 aa  171  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  31.32 
 
 		 961 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  39.74 
 
 		 874 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1397  TonB-dependent receptor  35.12 
 
 		 1008 aa  166  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0795822  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  23.76 
 
 		 945 aa  162  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1072  TonB-dependent receptor, plug  42.69 
 
 		 271 aa  162  4e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3520  TonB-dependent receptor  33.24 
 
 		 957 aa  162  4e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  34.08 
 
 		 967 aa  158  6e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  29.72 
 
 		 914 aa  157  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  31.91 
 
 		 1097 aa  157  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  32.36 
 
 		 958 aa  156  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  33.06 
 
 		 1035 aa  155  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3650  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 		 1012 aa  155  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000400327  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  33.23 
 
 		 920 aa  154  7e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  30.7 
 
 		 931 aa  153  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 943 aa  152  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  31.59 
 
 		 994 aa  152  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1101  TonB-dependent receptor  30.5 
 
 		 1011 aa  151  7e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000197247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01579  TonB-dependent receptor  41.86 
 
 		 889 aa  151  7e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.419044  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02198  TonB-dependent receptor  33.77 
 
 		 1048 aa  150  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  37.24 
 
 		 894 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03790  TonB-dependent receptor  30.15 
 
 		 982 aa  147  8.000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03792  TonB-dependent receptor  30.15 
 
 		 982 aa  147  8.000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3698  TonB-dependent receptor  32.88 
 
 		 961 aa  147  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2610  TonB-dependent receptor  32.76 
 
 		 990 aa  147  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2694  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 945 aa  145  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00189695  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  31.21 
 
 		 924 aa  145  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03903  TonB-dependent receptor  30.24 
 
 		 1074 aa  144  9e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  29.15 
 
 		 934 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1603  TonB-dependent receptor  33.72 
 
 		 990 aa  142  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4286  TonB-dependent receptor  32.44 
 
 		 1013 aa  142  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00048068  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1264  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 		 923 aa  142  4.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000254862  unclonable  0.0000000223641 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  29.79 
 
 		 998 aa  141  4.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2831  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 1017 aa  141  6e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312768  hitchhiker  0.00196838 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1180  TonB-dependent receptor plug  31.97 
 
 		 998 aa  141  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103368  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3177  TonB-dependent receptor plug  31.97 
 
 		 998 aa  141  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0554366  normal  0.201208 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1213  TonB-dependent receptor plug  31.97 
 
 		 998 aa  141  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0027404  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  32.21 
 
 		 908 aa  139  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  32.93 
 
 		 986 aa  139  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0914  TonB-dependent receptor  33.44 
 
 		 987 aa  138  7.000000000000001e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1144  TonB-dependent receptor  32.25 
 
 		 998 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.503724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  30.82 
 
 		 919 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  32.1 
 
 		 1007 aa  135  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  31.77 
 
 		 929 aa  135  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  29.81 
 
 		 978 aa  134  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  30.47 
 
 		 918 aa  134  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3939  TonB-dependent receptor  30.97 
 
 		 1017 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.719926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2137  TonB-dependent receptor  30.45 
 
 		 1013 aa  133  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255977  normal  0.143212 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1838  TonB-dependent receptor  34.16 
 
 		 979 aa  132  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.534381  hitchhiker  0.00298176 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 880 aa  132  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2142  TonB-dependent receptor  31.07 
 
 		 1034 aa  132  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.0000142845  normal  0.0159239 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03867  TonB-dependent receptor  36.6 
 
 		 977 aa  131  6e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2995  TonB-dependent receptor  37.89 
 
 		 933 aa  131  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1888  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 		 906 aa  130  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0505133  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1018  outer membrane insertion C-terminal signal  29.74 
 
 		 918 aa  130  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2065  TonB-dependent receptor  30.03 
 
 		 963 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2079  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 994 aa  130  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000280363  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  30.5 
 
 		 881 aa  129  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0952  ribosomal protein L17  35.93 
 
 		 906 aa  128  6e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000237948  hitchhiker  0.00000537684 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>