More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_2261 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  98.73 
 
 		 868 aa  1764    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  41.87 
 
 		 926 aa  648    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 868 aa  1781    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  67.78 
 
 		 875 aa  1204    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  34.54 
 
 		 927 aa  467  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01579  TonB-dependent receptor  35.45 
 
 		 889 aa  465  1e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.419044  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  33.18 
 
 		 859 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  31.74 
 
 		 892 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  32.49 
 
 		 870 aa  380  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  30.66 
 
 		 875 aa  380  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  31.97 
 
 		 869 aa  381  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3426  TonB-dependent receptor  31.64 
 
 		 902 aa  363  1e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0666258  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  32.4 
 
 		 878 aa  361  4e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  32.19 
 
 		 878 aa  359  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  32.19 
 
 		 878 aa  358  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  32.08 
 
 		 878 aa  356  1e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  31.8 
 
 		 874 aa  355  2e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  30.84 
 
 		 874 aa  355  2.9999999999999997e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  32.23 
 
 		 872 aa  352  2e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  31.36 
 
 		 888 aa  350  5e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  31.55 
 
 		 874 aa  349  1e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  31.22 
 
 		 882 aa  347  4e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  29.98 
 
 		 887 aa  336  9e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  30.07 
 
 		 887 aa  335  2e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 		 915 aa  333  1e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  29.72 
 
 		 881 aa  332  1e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 900 aa  327  5e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 		 880 aa  325  3e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1136  TonB-dependent receptor  31.88 
 
 		 892 aa  320  5e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  30.4 
 
 		 845 aa  318  3e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 894 aa  316  9e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 964 aa  307  6e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 964 aa  301  3e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 1036 aa  292  2e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 934 aa  272  2e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 948 aa  260  7e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 919 aa  258  4e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 918 aa  256  1.0000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 888 aa  254  6e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2995  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 933 aa  245  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 961 aa  232  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1862  TonB-dependent receptor plug  27.06 
 
 		 947 aa  232  3e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.248067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3520  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 957 aa  230  8e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 920 aa  228  4e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 904 aa  228  4e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 885 aa  226  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4091  outer membrane insertion C-terminal signal  26.41 
 
 		 919 aa  224  7e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 922 aa  220  7e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 881 aa  220  7.999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 921 aa  219  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4064  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 836 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 912 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 929 aa  212  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 1035 aa  210  9e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 931 aa  210  1e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1018  outer membrane insertion C-terminal signal  27.1 
 
 		 918 aa  209  3e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1264  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 923 aa  208  3e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000254862  unclonable  0.0000000223641 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 945 aa  205  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0321  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 934 aa  202  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0815676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1557  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 853 aa  200  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 908 aa  198  4.0000000000000005e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3988  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 945 aa  197  8.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2126  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 986 aa  194  6e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.593846  normal  0.258054 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  24.55 
 
 		 908 aa  193  9e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 943 aa  192  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0993  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 946 aa  191  4e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.609458  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2048  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 944 aa  191  5e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00100179  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02398  putative tonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 901 aa  191  5e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.835744  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0532  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 936 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0904706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1787  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 906 aa  188  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04315  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 838 aa  188  5e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 936 aa  187  8e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 936 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1075  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 601 aa  185  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  24.89 
 
 		 838 aa  184  7e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  24.36 
 
 		 908 aa  181  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  24.36 
 
 		 908 aa  181  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 908 aa  181  7e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2735  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 921 aa  178  3e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.692321  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01879  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 938 aa  177  8e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 939 aa  177  9e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 939 aa  177  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  25.75 
 
 		 941 aa  175  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02628  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 967 aa  174  9e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0181  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 911 aa  174  9e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1773  TonB-dependent receptor  44.74 
 
 		 1047 aa  172  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.133871  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  34.75 
 
 		 951 aa  172  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  34.75 
 
 		 951 aa  172  3e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2111  TonB-dependent receptor  23.85 
 
 		 917 aa  171  4e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  34.75 
 
 		 951 aa  171  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2288  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 940 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  25.21 
 
 		 940 aa  170  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1888  TonB-dependent receptor, plug  25.3 
 
 		 942 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 946 aa  164  7e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04960  TonB-dependent receptor  22.6 
 
 		 842 aa  164  8.000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143885  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3318  Outer membrane receptor proteins mostly Fe transport-like  24.79 
 
 		 954 aa  162  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0120017  decreased coverage  0.00000382692 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1938  TonB-dependent receptor  25.05 
 
 		 971 aa  162  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0886775  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  35.82 
 
 		 914 aa  159  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2523  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 		 943 aa  159  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2162  tonB dependent receptor-related protein  26.08 
 
 		 836 aa  157  7e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>