More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2995 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2995  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 933 aa  1914    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  30.9 
 
 		 918 aa  408  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  31.38 
 
 		 929 aa  377  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  30.05 
 
 		 931 aa  352  2e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3520  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 		 957 aa  338  2.9999999999999997e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0952  ribosomal protein L17  28.92 
 
 		 906 aa  331  4e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000237948  hitchhiker  0.00000537684 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 894 aa  266  1e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 958 aa  242  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 915 aa  240  1e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 875 aa  239  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 948 aa  232  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 888 aa  224  4.9999999999999996e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 870 aa  220  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0559  TonB dependent receptor-related protein  25.71 
 
 		 960 aa  219  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 892 aa  219  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  26.43 
 
 		 878 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 869 aa  218  5e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2694  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 945 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00189695  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 919 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  25.68 
 
 		 978 aa  212  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 912 aa  212  3e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 921 aa  212  3e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 924 aa  210  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 976 aa  209  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 922 aa  209  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 967 aa  206  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0741  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 918 aa  205  3e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0701962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 885 aa  205  3e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 1035 aa  202  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1862  TonB-dependent receptor plug  25.47 
 
 		 947 aa  202  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.248067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 881 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 936 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  25.87 
 
 		 941 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0914  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 987 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1213  TonB-dependent receptor plug  26.6 
 
 		 998 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0027404  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1180  TonB-dependent receptor plug  26.6 
 
 		 998 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103368  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 936 aa  199  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2288  peptidase M24A  25.35 
 
 		 927 aa  197  5.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000032845  unclonable  0.0000000380326 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 939 aa  198  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3177  TonB-dependent receptor plug  26.48 
 
 		 998 aa  197  6e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0554366  normal  0.201208 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 939 aa  197  9e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1508  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 958 aa  197  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000651564  unclonable  0.0000000259897 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3698  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 961 aa  196  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3278  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 1006 aa  196  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000542759  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  24.98 
 
 		 940 aa  195  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1144  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 998 aa  194  9e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.503724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3638  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 993 aa  194  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000344146  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 908 aa  189  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1315  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 988 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243965 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1125  TonB-dependent receptor plug  26.44 
 
 		 944 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1888  TonB-dependent receptor, plug  24.28 
 
 		 942 aa  185  4.0000000000000006e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02198  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 1048 aa  184  6e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3075  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 988 aa  184  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179572 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1603  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 990 aa  182  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2082  TonB-dependent receptor  24 
 
 		 942 aa  177  9e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2079  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 994 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000280363  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0993  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 946 aa  174  5e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.609458  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2207  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 		 944 aa  174  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1838  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 		 979 aa  174  6.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.534381  hitchhiker  0.00298176 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2162  tonB dependent receptor-related protein  25.54 
 
 		 836 aa  170  9e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1893  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 941 aa  170  9e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.175561 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4064  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 836 aa  169  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1557  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 		 853 aa  169  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3818  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 974 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.003378  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  35.76 
 
 		 914 aa  165  5.0000000000000005e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2123  TonB-dependent receptor  34.69 
 
 		 925 aa  159  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.154655 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0696  hypothetical protein  23.97 
 
 		 970 aa  159  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000664901  unclonable  0.0000000149874 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2831  TonB-dependent receptor  33.02 
 
 		 1017 aa  155  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312768  hitchhiker  0.00196838 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  32.38 
 
 		 1097 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  32.16 
 
 		 1109 aa  151  6e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4286  TonB-dependent receptor  35.91 
 
 		 1013 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00048068  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  32.31 
 
 		 943 aa  149  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  35.69 
 
 		 927 aa  149  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  32.22 
 
 		 880 aa  148  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  31.22 
 
 		 986 aa  147  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1101  TonB-dependent receptor  33.24 
 
 		 1011 aa  145  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000197247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0253  TonB-dependent receptor  22.71 
 
 		 1011 aa  143  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0016718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  32.89 
 
 		 951 aa  142  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  32.89 
 
 		 951 aa  141  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  32.89 
 
 		 951 aa  141  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2610  TonB-dependent receptor  31.41 
 
 		 990 aa  141  6e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  34.73 
 
 		 964 aa  141  7e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02805  TonB-dependent receptor  34.67 
 
 		 984 aa  140  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 		 994 aa  140  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  31.38 
 
 		 868 aa  139  2e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1093  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 1158 aa  138  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000168671  normal  0.12204 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  31.01 
 
 		 934 aa  138  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  22.66 
 
 		 938 aa  138  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03792  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 982 aa  137  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  30.75 
 
 		 878 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03790  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 982 aa  137  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2137  TonB-dependent receptor  34.1 
 
 		 1013 aa  137  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255977  normal  0.143212 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  33.67 
 
 		 926 aa  135  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  31.04 
 
 		 878 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  31.04 
 
 		 878 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  30.46 
 
 		 868 aa  135  3.9999999999999996e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  33.54 
 
 		 859 aa  134  6.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1264  TonB-dependent receptor  36.59 
 
 		 923 aa  134  9e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000254862  unclonable  0.0000000223641 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  31.1 
 
 		 964 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03867  TonB-dependent receptor  32.41 
 
 		 977 aa  131  7.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>