232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02198 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3698  TonB-dependent receptor  41.03 
 
 		 961 aa  685    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02198  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1048 aa  2140    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  40.84 
 
 		 1035 aa  663    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3278  TonB-dependent receptor  41.7 
 
 		 1006 aa  726    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000542759  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02805  TonB-dependent receptor  35.92 
 
 		 984 aa  549  1e-155  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  35.66 
 
 		 978 aa  551  1e-155  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  34.44 
 
 		 994 aa  519  1.0000000000000001e-145  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  34.12 
 
 		 986 aa  514  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1180  TonB-dependent receptor plug  33.58 
 
 		 998 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103368  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3177  TonB-dependent receptor plug  33.67 
 
 		 998 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0554366  normal  0.201208 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1213  TonB-dependent receptor plug  33.58 
 
 		 998 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0027404  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1144  TonB-dependent receptor  32.88 
 
 		 998 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.503724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  34.63 
 
 		 967 aa  503  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2831  TonB-dependent receptor  34.65 
 
 		 1017 aa  503  1e-141  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312768  hitchhiker  0.00196838 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0914  TonB-dependent receptor  34.14 
 
 		 987 aa  499  1e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1603  TonB-dependent receptor  34.2 
 
 		 990 aa  491  1e-137  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1125  TonB-dependent receptor plug  33.97 
 
 		 944 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4286  TonB-dependent receptor  33.99 
 
 		 1013 aa  482  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00048068  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2610  TonB-dependent receptor  32.83 
 
 		 990 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03790  TonB-dependent receptor  31.72 
 
 		 982 aa  447  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03792  TonB-dependent receptor  31.72 
 
 		 982 aa  447  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2694  TonB-dependent receptor  33.14 
 
 		 945 aa  430  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00189695  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  32.5 
 
 		 920 aa  422  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  30.8 
 
 		 998 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  31.65 
 
 		 1109 aa  390  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  32.46 
 
 		 924 aa  343  1e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  32.25 
 
 		 914 aa  313  1e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  32.31 
 
 		 943 aa  295  3e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1264  TonB-dependent receptor  39.9 
 
 		 923 aa  241  4e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000254862  unclonable  0.0000000223641 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1397  TonB-dependent receptor  36.43 
 
 		 1008 aa  240  1e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0795822  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1101  TonB-dependent receptor  37.85 
 
 		 1011 aa  230  9e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000197247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  37 
 
 		 1097 aa  230  9e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  35.76 
 
 		 958 aa  212  4e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 875 aa  196  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2995  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 933 aa  191  5e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  33.92 
 
 		 919 aa  184  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 964 aa  181  8e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03903  TonB-dependent receptor  35.13 
 
 		 1074 aa  180  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 915 aa  172  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 961 aa  172  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3520  TonB-dependent receptor  36.56 
 
 		 957 aa  172  4e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4091  outer membrane insertion C-terminal signal  25.06 
 
 		 919 aa  171  8e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  31.87 
 
 		 918 aa  163  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  31.33 
 
 		 951 aa  163  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  31.55 
 
 		 948 aa  162  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  37.5 
 
 		 927 aa  161  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  31.97 
 
 		 951 aa  160  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  31.88 
 
 		 951 aa  159  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0952  ribosomal protein L17  32.82 
 
 		 906 aa  159  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000237948  hitchhiker  0.00000537684 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2137  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 1013 aa  158  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255977  normal  0.143212 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  34.39 
 
 		 1036 aa  157  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  34.98 
 
 		 892 aa  153  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  33.9 
 
 		 964 aa  152  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01879  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 938 aa  151  6e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  31.49 
 
 		 929 aa  151  7e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  31.9 
 
 		 931 aa  150  8e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  33.54 
 
 		 934 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1773  TonB-dependent receptor  30.03 
 
 		 1047 aa  150  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.133871  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2407  TonB-dependent receptor  33.44 
 
 		 984 aa  146  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000117567  normal  0.325532 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  31.99 
 
 		 878 aa  146  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  31.99 
 
 		 878 aa  145  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  31.99 
 
 		 878 aa  145  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  31.99 
 
 		 878 aa  145  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  31.61 
 
 		 894 aa  144  7e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3075  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 988 aa  142  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179572 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1315  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 988 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243965 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  38.1 
 
 		 875 aa  139  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  34.55 
 
 		 868 aa  139  4e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  33.57 
 
 		 868 aa  136  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  33.77 
 
 		 926 aa  136  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 976 aa  135  6e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  22.33 
 
 		 921 aa  134  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1966  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 1240 aa  134  7.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00321927  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  32.62 
 
 		 859 aa  134  7.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 943 aa  134  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3426  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 902 aa  134  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0666258  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  22.33 
 
 		 912 aa  134  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 908 aa  132  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  31.76 
 
 		 880 aa  132  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  38.96 
 
 		 888 aa  131  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01579  TonB-dependent receptor  33.22 
 
 		 889 aa  129  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.419044  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  32.62 
 
 		 845 aa  129  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  32.5 
 
 		 869 aa  128  5e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  36.14 
 
 		 887 aa  128  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  34.87 
 
 		 900 aa  127  7e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  37.69 
 
 		 874 aa  127  9e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  35.64 
 
 		 887 aa  127  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1862  TonB-dependent receptor plug  30.94 
 
 		 947 aa  126  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.248067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  33.05 
 
 		 881 aa  126  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2123  TonB-dependent receptor  23.18 
 
 		 925 aa  125  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.154655 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 882 aa  125  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2720  TonB-dependent receptor  22.75 
 
 		 1009 aa  122  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.000000258905  normal  0.119134 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  31.07 
 
 		 870 aa  122  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1136  TonB-dependent receptor  34.64 
 
 		 892 aa  121  7e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2652  3-dehydroquinate synthase  28.38 
 
 		 1210 aa  121  7e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000360118  normal  0.0199769 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  34.65 
 
 		 888 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1940  TonB-dependent receptor  23.45 
 
 		 1010 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1787  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 906 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1072  TonB-dependent receptor, plug  38.92 
 
 		 271 aa  119  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 874 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>