More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0914 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  41.01 
 
 		 978 aa  649    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  39.44 
 
 		 994 aa  662    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1603  TonB-dependent receptor  60.06 
 
 		 990 aa  1191    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  40.34 
 
 		 986 aa  678    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1144  TonB-dependent receptor  40.65 
 
 		 998 aa  672    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.503724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0914  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 987 aa  2004    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02805  TonB-dependent receptor  42.7 
 
 		 984 aa  702    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1213  TonB-dependent receptor plug  40.27 
 
 		 998 aa  651    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0027404  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1180  TonB-dependent receptor plug  40.18 
 
 		 998 aa  649    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103368  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3177  TonB-dependent receptor plug  40.27 
 
 		 998 aa  650    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0554366  normal  0.201208 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1125  TonB-dependent receptor plug  40.1 
 
 		 944 aa  620  1e-176  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2831  TonB-dependent receptor  37.61 
 
 		 1017 aa  606  9.999999999999999e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312768  hitchhiker  0.00196838 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  36.98 
 
 		 967 aa  566  1e-160  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4286  TonB-dependent receptor  37.39 
 
 		 1013 aa  561  1e-158  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00048068  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  36.71 
 
 		 1035 aa  527  1e-148  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3698  TonB-dependent receptor  36.39 
 
 		 961 aa  521  1e-146  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3278  TonB-dependent receptor  34.15 
 
 		 1006 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000542759  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02198  TonB-dependent receptor  34.7 
 
 		 1048 aa  511  1e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1101  TonB-dependent receptor  34.72 
 
 		 1011 aa  482  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000197247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  35.66 
 
 		 920 aa  473  1e-132  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2610  TonB-dependent receptor  32.85 
 
 		 990 aa  474  1e-132  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1397  TonB-dependent receptor  35.03 
 
 		 1008 aa  475  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0795822  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03792  TonB-dependent receptor  34.88 
 
 		 982 aa  473  1.0000000000000001e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03790  TonB-dependent receptor  34.88 
 
 		 982 aa  473  1.0000000000000001e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 998 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1264  TonB-dependent receptor  33.7 
 
 		 923 aa  461  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000254862  unclonable  0.0000000223641 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  34.47 
 
 		 924 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  33.57 
 
 		 914 aa  410  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  32.04 
 
 		 958 aa  382  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  31.57 
 
 		 943 aa  375  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  30.56 
 
 		 919 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03903  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 1074 aa  344  5e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2407  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 984 aa  314  5.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000117567  normal  0.325532 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 961 aa  279  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2694  TonB-dependent receptor  40.29 
 
 		 945 aa  268  4e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00189695  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 948 aa  266  2e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 934 aa  243  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 915 aa  237  8e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 894 aa  235  3e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  36.95 
 
 		 1097 aa  233  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 927 aa  223  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  35.43 
 
 		 1109 aa  222  3e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 951 aa  213  1e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 951 aa  211  5e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 929 aa  209  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 951 aa  208  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2995  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 933 aa  202  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  23.75 
 
 		 880 aa  201  6e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1838  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 979 aa  191  5e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.534381  hitchhiker  0.00298176 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2137  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 1013 aa  186  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255977  normal  0.143212 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 881 aa  185  4.0000000000000006e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 874 aa  180  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0741  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 918 aa  177  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0701962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 922 aa  172  4e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 845 aa  169  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2288  peptidase M24A  25.1 
 
 		 927 aa  167  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000032845  unclonable  0.0000000380326 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 945 aa  167  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1843  TonB-dependent receptor  24.28 
 
 		 1083 aa  165  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  unclonable  0.0000000198025  decreased coverage  0.000327731 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3520  TonB-dependent receptor  38.33 
 
 		 957 aa  164  7e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  23.02 
 
 		 908 aa  164  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04315  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 838 aa  163  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2048  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 944 aa  162  4e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00100179  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0952  ribosomal protein L17  34.47 
 
 		 906 aa  158  5.0000000000000005e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000237948  hitchhiker  0.00000537684 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  23.85 
 
 		 943 aa  157  7e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1888  TonB-dependent receptor  23.93 
 
 		 906 aa  156  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0505133  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4091  outer membrane insertion C-terminal signal  24.62 
 
 		 919 aa  157  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4006  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 984 aa  156  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000010552  normal  0.168301 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  33.43 
 
 		 918 aa  155  2.9999999999999998e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2063  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 945 aa  155  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  35.58 
 
 		 931 aa  154  5.9999999999999996e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  32.6 
 
 		 878 aa  150  8e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  32.6 
 
 		 878 aa  149  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  32.6 
 
 		 878 aa  149  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  32.6 
 
 		 878 aa  149  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0181  TonB-dependent receptor  24 
 
 		 911 aa  148  4.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  32.09 
 
 		 892 aa  148  5e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  34.69 
 
 		 875 aa  147  7.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  32.78 
 
 		 926 aa  147  7.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  31.58 
 
 		 900 aa  144  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  34.11 
 
 		 882 aa  144  7e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1773  TonB-dependent receptor  30.92 
 
 		 1047 aa  144  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.133871  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  32.81 
 
 		 887 aa  143  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 964 aa  143  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  32.3 
 
 		 964 aa  143  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  32.2 
 
 		 868 aa  142  3e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  32.49 
 
 		 887 aa  141  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  31.89 
 
 		 868 aa  141  7e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 904 aa  141  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  33.44 
 
 		 1036 aa  138  5e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02398  putative tonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 901 aa  136  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.835744  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1136  TonB-dependent receptor  32.49 
 
 		 892 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2991  hypothetical protein  23.06 
 
 		 1013 aa  135  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000283322  hitchhiker  0.000000325565 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  30.7 
 
 		 869 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  32.78 
 
 		 881 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  23.72 
 
 		 838 aa  134  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 936 aa  134  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  31.76 
 
 		 874 aa  134  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2111  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 917 aa  134  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2652  3-dehydroquinate synthase  29.69 
 
 		 1210 aa  133  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000360118  normal  0.0199769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 		 936 aa  134  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>