235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0741 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0741  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 918 aa  1863    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0701962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  29.5 
 
 		 922 aa  360  8e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  32.75 
 
 		 881 aa  351  4e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2288  peptidase M24A  30.46 
 
 		 927 aa  340  9e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000032845  unclonable  0.0000000380326 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  29.99 
 
 		 936 aa  338  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  30.48 
 
 		 936 aa  338  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 945 aa  330  8e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2048  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 944 aa  328  3e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00100179  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2242  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 		 950 aa  323  6e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3318  Outer membrane receptor proteins mostly Fe transport-like  29.12 
 
 		 954 aa  302  2e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0120017  decreased coverage  0.00000382692 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2502  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  28.85 
 
 		 968 aa  289  1e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0144507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 880 aa  284  7.000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1289  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 978 aa  271  5.9999999999999995e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.384181  normal  0.0181603 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 934 aa  241  4e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2720  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 1009 aa  240  6.999999999999999e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.000000258905  normal  0.119134 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 951 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 951 aa  234  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 951 aa  233  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0181  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 911 aa  232  3e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 894 aa  228  3e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2079  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 994 aa  225  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000280363  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 948 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 921 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1508  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 958 aa  222  3e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000651564  unclonable  0.0000000259897 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 912 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 875 aa  213  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1888  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 906 aa  211  7e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0505133  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 885 aa  211  7e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  27.47 
 
 		 908 aa  209  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2995  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 933 aa  205  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1315  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 988 aa  204  9e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243965 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3075  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 988 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179572 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 874 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 976 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  24.45 
 
 		 859 aa  200  9e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 904 aa  200  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 939 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 939 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 961 aa  199  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  24.33 
 
 		 940 aa  199  3e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 875 aa  195  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1888  TonB-dependent receptor, plug  24.58 
 
 		 942 aa  195  4e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 919 aa  195  4e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2288  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 940 aa  194  5e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  24.27 
 
 		 941 aa  194  6e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 929 aa  193  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 874 aa  191  5e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 		 924 aa  191  8e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  23.08 
 
 		 915 aa  190  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3426  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 902 aa  190  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0666258  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2735  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 921 aa  189  3e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.692321  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0559  TonB dependent receptor-related protein  24.44 
 
 		 960 aa  188  5e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 914 aa  187  6e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1938  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 971 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0886775  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  23.38 
 
 		 1007 aa  184  5.0000000000000004e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 926 aa  184  7e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3520  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 957 aa  183  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1940  TonB-dependent receptor  24.18 
 
 		 1010 aa  182  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02628  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 967 aa  182  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1787  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 906 aa  180  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01879  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 		 938 aa  179  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  24.1 
 
 		 892 aa  178  4e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2162  tonB dependent receptor-related protein  24.18 
 
 		 836 aa  177  6e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0914  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 987 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 		 918 aa  174  6.999999999999999e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3880  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 901 aa  172  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000233231  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0532  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 936 aa  172  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0904706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3638  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 993 aa  171  5e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000344146  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0993  TonB-dependent receptor  23.34 
 
 		 946 aa  166  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.609458  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2082  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 942 aa  160  9e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4091  outer membrane insertion C-terminal signal  22.81 
 
 		 919 aa  160  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  23.45 
 
 		 920 aa  159  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01881  TonB-dependent receptor  22.46 
 
 		 1016 aa  159  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.529383  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1893  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 941 aa  159  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.175561 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1136  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 892 aa  158  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3818  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 974 aa  157  7e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.003378  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2207  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 944 aa  157  9e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  30.75 
 
 		 888 aa  154  7e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1603  TonB-dependent receptor  23.12 
 
 		 990 aa  154  8e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2523  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 943 aa  147  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1862  TonB-dependent receptor plug  30.32 
 
 		 947 aa  141  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.248067  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  31.19 
 
 		 943 aa  135  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  31.6 
 
 		 927 aa  134  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3110  TonB-dependent receptor  22.57 
 
 		 943 aa  133  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.183565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1838  TonB-dependent receptor  36.49 
 
 		 979 aa  130  8.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.534381  hitchhiker  0.00298176 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1843  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 1083 aa  129  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  unclonable  0.0000000198025  decreased coverage  0.000327731 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2137  TonB-dependent receptor  36.8 
 
 		 1013 aa  128  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255977  normal  0.143212 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  31.56 
 
 		 964 aa  127  9e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 1035 aa  127  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1093  TonB-dependent receptor  30.8 
 
 		 1158 aa  127  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000168671  normal  0.12204 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 868 aa  126  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  29.94 
 
 		 868 aa  125  3e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  30.79 
 
 		 1097 aa  124  8e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 908 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  28.78 
 
 		 943 aa  122  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  34.84 
 
 		 869 aa  122  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 		 888 aa  122  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 958 aa  121  6e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  27.45 
 
 		 908 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  27.45 
 
 		 908 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>