297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02805 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  41.88 
 
 		 994 aa  743    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1125  TonB-dependent receptor plug  44.89 
 
 		 944 aa  748    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1603  TonB-dependent receptor  45.28 
 
 		 990 aa  810    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1144  TonB-dependent receptor  45.75 
 
 		 998 aa  785    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.503724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  41.15 
 
 		 986 aa  700    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1213  TonB-dependent receptor plug  44.97 
 
 		 998 aa  765    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0027404  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2831  TonB-dependent receptor  40.24 
 
 		 1017 aa  674    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312768  hitchhiker  0.00196838 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1180  TonB-dependent receptor plug  45.08 
 
 		 998 aa  767    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103368  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0914  TonB-dependent receptor  42.49 
 
 		 987 aa  690    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4286  TonB-dependent receptor  40.63 
 
 		 1013 aa  677    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00048068  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02805  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 984 aa  2003    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3177  TonB-dependent receptor plug  44.97 
 
 		 998 aa  765    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0554366  normal  0.201208 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  44.97 
 
 		 978 aa  791    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3698  TonB-dependent receptor  37.44 
 
 		 961 aa  578  1.0000000000000001e-163  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3278  TonB-dependent receptor  37.6 
 
 		 1006 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000542759  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  37.34 
 
 		 967 aa  560  1e-158  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1101  TonB-dependent receptor  37.08 
 
 		 1011 aa  559  1e-158  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000197247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2610  TonB-dependent receptor  36.81 
 
 		 990 aa  552  1e-155  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03790  TonB-dependent receptor  35.7 
 
 		 982 aa  545  1e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03792  TonB-dependent receptor  35.7 
 
 		 982 aa  545  1e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02198  TonB-dependent receptor  35.88 
 
 		 1048 aa  540  9.999999999999999e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  35.34 
 
 		 998 aa  520  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  36.68 
 
 		 920 aa  522  1e-146  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  35.98 
 
 		 924 aa  516  1e-144  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1397  TonB-dependent receptor  36.7 
 
 		 1008 aa  511  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0795822  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  34.88 
 
 		 1035 aa  506  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2694  TonB-dependent receptor  35.91 
 
 		 945 aa  499  1e-140  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00189695  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1264  TonB-dependent receptor  35.96 
 
 		 923 aa  489  1e-136  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000254862  unclonable  0.0000000223641 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  35.5 
 
 		 914 aa  472  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  32.14 
 
 		 958 aa  412  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  31.81 
 
 		 1109 aa  402  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  31.3 
 
 		 943 aa  393  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  31.82 
 
 		 919 aa  372  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03903  TonB-dependent receptor  29.72 
 
 		 1074 aa  332  2e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 		 961 aa  270  1e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 915 aa  252  3e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  38.82 
 
 		 1097 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1773  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 1047 aa  239  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.133871  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 892 aa  234  5e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 927 aa  230  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 951 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 951 aa  215  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 951 aa  213  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 931 aa  209  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 948 aa  206  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  24.95 
 
 		 934 aa  204  8e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 859 aa  201  6e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0952  ribosomal protein L17  27.02 
 
 		 906 aa  196  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000237948  hitchhiker  0.00000537684 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2407  TonB-dependent receptor  31.72 
 
 		 984 aa  184  6e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000117567  normal  0.325532 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 1036 aa  184  9.000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  24.39 
 
 		 959 aa  177  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12613  normal  0.0122478 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  24.12 
 
 		 908 aa  172  4e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2502  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  24.38 
 
 		 968 aa  166  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0144507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 922 aa  165  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2063  TonB-dependent receptor  23.53 
 
 		 945 aa  163  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2720  TonB-dependent receptor  22.81 
 
 		 1009 aa  162  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.000000258905  normal  0.119134 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2111  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 917 aa  160  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 881 aa  159  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 		 908 aa  156  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  35.48 
 
 		 918 aa  155  2.9999999999999998e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3520  TonB-dependent receptor  42.53 
 
 		 957 aa  154  5.9999999999999996e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  23.87 
 
 		 976 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  33.64 
 
 		 878 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0993  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 946 aa  147  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.609458  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  36.01 
 
 		 875 aa  147  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0321  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 934 aa  146  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0815676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 878 aa  146  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 878 aa  146  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 878 aa  146  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 908 aa  146  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  37.07 
 
 		 887 aa  145  5e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  25.06 
 
 		 908 aa  144  8e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  36.53 
 
 		 882 aa  144  9e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  30.35 
 
 		 964 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  25.55 
 
 		 908 aa  144  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  36.59 
 
 		 887 aa  144  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2995  TonB-dependent receptor  34.67 
 
 		 933 aa  140  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3818  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 974 aa  140  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.003378  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  35.04 
 
 		 900 aa  139  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  32.27 
 
 		 894 aa  139  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  36.82 
 
 		 881 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0696  hypothetical protein  23.13 
 
 		 970 aa  139  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000664901  unclonable  0.0000000149874 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 		 869 aa  139  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  40.78 
 
 		 929 aa  138  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  32.57 
 
 		 875 aa  136  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  32.48 
 
 		 964 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  33.95 
 
 		 888 aa  134  6e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1787  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 906 aa  134  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 870 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3426  TonB-dependent receptor  31.51 
 
 		 902 aa  132  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0666258  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  30.88 
 
 		 874 aa  132  4.0000000000000003e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  33.49 
 
 		 874 aa  132  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 872 aa  131  6e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01579  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 889 aa  130  8.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.419044  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 1007 aa  130  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  32.85 
 
 		 868 aa  130  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 936 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4006  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 984 aa  129  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000010552  normal  0.168301 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 936 aa  129  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  33.96 
 
 		 874 aa  128  6e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>