234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1693 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1007 aa  2051    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  47.05 
 
 		 940 aa  870    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2162  tonB dependent receptor-related protein  46.11 
 
 		 836 aa  746    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1315  TonB-dependent receptor  60.68 
 
 		 988 aa  1207    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243965 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3075  TonB-dependent receptor  60.68 
 
 		 988 aa  1206    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179572 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0559  TonB dependent receptor-related protein  59.03 
 
 		 960 aa  1197    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1888  TonB-dependent receptor, plug  47.99 
 
 		 942 aa  871    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2288  TonB-dependent receptor  47.89 
 
 		 940 aa  878    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  61.67 
 
 		 976 aa  1223    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01881  TonB-dependent receptor  59.06 
 
 		 1016 aa  1192    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.529383  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1940  TonB-dependent receptor  60.39 
 
 		 1010 aa  1235    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  48.08 
 
 		 939 aa  890    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  48.08 
 
 		 939 aa  889    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  47.89 
 
 		 941 aa  885    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  35.54 
 
 		 959 aa  539  9.999999999999999e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12613  normal  0.0122478 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  32.67 
 
 		 908 aa  426  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  32.5 
 
 		 908 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  32.01 
 
 		 908 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1787  TonB-dependent receptor  31.81 
 
 		 906 aa  404  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  31.97 
 
 		 908 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  31.91 
 
 		 908 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  32.79 
 
 		 908 aa  391  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  31.58 
 
 		 912 aa  386  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  31.58 
 
 		 921 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  30.94 
 
 		 885 aa  372  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4482  hypothetical protein  56.83 
 
 		 312 aa  355  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2735  TonB-dependent receptor  31.07 
 
 		 921 aa  351  5e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.692321  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4091  outer membrane insertion C-terminal signal  30.42 
 
 		 919 aa  339  1.9999999999999998e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1018  outer membrane insertion C-terminal signal  28.88 
 
 		 918 aa  330  1.0000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 915 aa  312  2.9999999999999997e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 943 aa  310  5.9999999999999995e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2063  TonB-dependent receptor  28.86 
 
 		 945 aa  310  1.0000000000000001e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154815  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0993  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 946 aa  304  6.000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.609458  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0181  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 911 aa  302  2e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1888  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 906 aa  296  1e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0505133  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01879  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 938 aa  293  8e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 904 aa  273  9e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0866  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 924 aa  272  2.9999999999999997e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 961 aa  270  8e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0696  hypothetical protein  28.02 
 
 		 970 aa  266  2e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000664901  unclonable  0.0000000149874 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1938  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 971 aa  263  1e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0886775  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02628  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 967 aa  260  1e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3880  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 901 aa  255  4.0000000000000004e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000233231  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 951 aa  252  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 894 aa  252  3e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 951 aa  249  2e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 951 aa  249  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3818  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 974 aa  247  6.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.003378  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2991  hypothetical protein  24.86 
 
 		 1013 aa  239  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000283322  hitchhiker  0.000000325565 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2065  TonB-dependent receptor  24.24 
 
 		 963 aa  235  3e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 918 aa  235  4.0000000000000004e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2502  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  26.62 
 
 		 968 aa  228  4e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0144507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3638  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 993 aa  224  4e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000344146  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1508  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 958 aa  224  6e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000651564  unclonable  0.0000000259897 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0253  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 1011 aa  222  1.9999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0016718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 1097 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 934 aa  212  4e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 948 aa  207  6e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 859 aa  207  7e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0321  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 934 aa  207  9e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0815676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1386  hypothetical protein  25.96 
 
 		 1046 aa  206  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000408374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2079  TonB-dependent receptor  24.83 
 
 		 994 aa  204  5e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000280363  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0952  ribosomal protein L17  25.05 
 
 		 906 aa  202  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000237948  hitchhiker  0.00000537684 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  23.49 
 
 		 875 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 919 aa  196  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 922 aa  195  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1289  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 978 aa  194  6e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.384181  normal  0.0181603 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 845 aa  192  4e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  23.34 
 
 		 927 aa  189  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2123  TonB-dependent receptor  23.12 
 
 		 925 aa  186  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.154655 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  24.61 
 
 		 878 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0741  TonB-dependent receptor  23.38 
 
 		 918 aa  184  6e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0701962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  24.56 
 
 		 878 aa  183  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  24.56 
 
 		 878 aa  183  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  24.51 
 
 		 878 aa  183  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 958 aa  182  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2720  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 1009 aa  177  8e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.000000258905  normal  0.119134 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 936 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 881 aa  175  3.9999999999999995e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 936 aa  175  5e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 		 994 aa  174  7.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1843  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 1083 aa  174  7.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  unclonable  0.0000000198025  decreased coverage  0.000327731 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  22.51 
 
 		 967 aa  173  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4286  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 		 1013 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00048068  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02398  putative tonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 901 aa  166  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.835744  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  24.9 
 
 		 986 aa  164  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2048  TonB-dependent receptor  23.48 
 
 		 944 aa  162  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00100179  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  23.54 
 
 		 892 aa  162  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  23.69 
 
 		 882 aa  160  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1557  TonB-dependent receptor  23.16 
 
 		 853 aa  159  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2137  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 1013 aa  159  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255977  normal  0.143212 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  22.67 
 
 		 998 aa  157  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1144  TonB-dependent receptor  23.74 
 
 		 998 aa  154  7e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.503724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  24.02 
 
 		 978 aa  153  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  23.39 
 
 		 945 aa  153  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3318  Outer membrane receptor proteins mostly Fe transport-like  23.9 
 
 		 954 aa  152  4e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0120017  decreased coverage  0.00000382692 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1397  TonB-dependent receptor  22.91 
 
 		 1008 aa  151  6e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0795822  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04315  TonB-dependent receptor  23.23 
 
 		 838 aa  150  8e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1279  rhodanese-like protein  24.33 
 
 		 990 aa  150  9e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000246729  normal  0.344193 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 926 aa  148  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>