More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1773 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  58.61 
 
 		 1036 aa  1204    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1773  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1047 aa  2163    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.133871  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  36.32 
 
 		 964 aa  611  1e-173  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  36.13 
 
 		 964 aa  601  1e-170  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 859 aa  352  3e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 875 aa  324  6e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 892 aa  319  1e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 927 aa  316  9.999999999999999e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 875 aa  300  1e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 869 aa  297  9e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3426  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 902 aa  289  2e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0666258  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 894 aa  281  3e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 926 aa  280  1e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 882 aa  278  3e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 881 aa  276  2.0000000000000002e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 951 aa  275  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 951 aa  275  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 951 aa  274  6e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02805  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 984 aa  247  8e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 931 aa  233  2e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 919 aa  231  8e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2502  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  25.48 
 
 		 968 aa  218  7e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0144507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 918 aa  212  3e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0321  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 934 aa  208  5e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0815676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 888 aa  206  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  45.16 
 
 		 870 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 904 aa  185  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01579  TonB-dependent receptor  35.46 
 
 		 889 aa  185  4.0000000000000006e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.419044  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  37.28 
 
 		 878 aa  184  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  44.29 
 
 		 887 aa  183  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  46.11 
 
 		 874 aa  183  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  36.98 
 
 		 878 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  36.98 
 
 		 878 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  36.98 
 
 		 878 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  34.86 
 
 		 900 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  44.29 
 
 		 887 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 885 aa  180  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  43.5 
 
 		 874 aa  179  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2288  peptidase M24A  24.17 
 
 		 927 aa  177  7e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000032845  unclonable  0.0000000380326 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  40.91 
 
 		 868 aa  177  7e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  45.28 
 
 		 845 aa  177  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  45.41 
 
 		 872 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  40 
 
 		 868 aa  174  5.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  31.95 
 
 		 880 aa  173  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  32.02 
 
 		 948 aa  171  7e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  43.24 
 
 		 874 aa  170  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  32.93 
 
 		 967 aa  169  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  31.89 
 
 		 1035 aa  168  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2694  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 		 945 aa  168  5e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00189695  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  32.49 
 
 		 914 aa  166  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  33.05 
 
 		 994 aa  166  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1136  TonB-dependent receptor  46.34 
 
 		 892 aa  165  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2831  TonB-dependent receptor  32.48 
 
 		 1017 aa  165  5.0000000000000005e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312768  hitchhiker  0.00196838 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1072  TonB-dependent receptor, plug  46.34 
 
 		 271 aa  164  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3698  TonB-dependent receptor  33.01 
 
 		 961 aa  164  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3278  TonB-dependent receptor  31.67 
 
 		 1006 aa  162  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000542759  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1144  TonB-dependent receptor  33.52 
 
 		 998 aa  162  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.503724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  32.66 
 
 		 978 aa  162  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2610  TonB-dependent receptor  31.37 
 
 		 990 aa  161  5e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  31.61 
 
 		 934 aa  161  6e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  32.1 
 
 		 1109 aa  160  9e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1397  TonB-dependent receptor  30.9 
 
 		 1008 aa  159  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0795822  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1180  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 998 aa  157  9e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103368  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1213  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 998 aa  157  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0027404  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1603  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 990 aa  156  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  32.44 
 
 		 924 aa  156  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4286  TonB-dependent receptor  32.54 
 
 		 1013 aa  156  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00048068  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3177  TonB-dependent receptor plug  33.05 
 
 		 998 aa  156  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0554366  normal  0.201208 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  30.65 
 
 		 998 aa  154  8.999999999999999e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  30.72 
 
 		 961 aa  153  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  29.76 
 
 		 958 aa  152  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03792  TonB-dependent receptor  29.57 
 
 		 982 aa  152  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03790  TonB-dependent receptor  29.57 
 
 		 982 aa  152  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  30.41 
 
 		 943 aa  152  4e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 1097 aa  151  7e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02198  TonB-dependent receptor  30.03 
 
 		 1048 aa  150  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  31.83 
 
 		 986 aa  150  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3520  TonB-dependent receptor  36.84 
 
 		 957 aa  149  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  32.81 
 
 		 920 aa  148  5e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0914  TonB-dependent receptor  30.17 
 
 		 987 aa  148  5e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2242  TonB-dependent receptor  22.75 
 
 		 950 aa  145  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1101  TonB-dependent receptor  31.04 
 
 		 1011 aa  145  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000197247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 880 aa  142  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  28.54 
 
 		 915 aa  142  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1264  TonB-dependent receptor  32.13 
 
 		 923 aa  142  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000254862  unclonable  0.0000000223641 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2137  TonB-dependent receptor  31.11 
 
 		 1013 aa  141  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255977  normal  0.143212 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1125  TonB-dependent receptor plug  34.02 
 
 		 944 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0952  ribosomal protein L17  38.27 
 
 		 906 aa  139  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000237948  hitchhiker  0.00000537684 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2995  TonB-dependent receptor  30.73 
 
 		 933 aa  135  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03903  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 1074 aa  134  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  38.92 
 
 		 888 aa  132  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3939  TonB-dependent receptor  35.32 
 
 		 1017 aa  131  8.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.719926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 		 908 aa  130  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1838  TonB-dependent receptor  34.02 
 
 		 979 aa  130  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.534381  hitchhiker  0.00298176 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  40.22 
 
 		 929 aa  129  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1843  TonB-dependent receptor  29.87 
 
 		 1083 aa  129  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  unclonable  0.0000000198025  decreased coverage  0.000327731 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03867  TonB-dependent receptor  36.71 
 
 		 977 aa  128  6e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  36.41 
 
 		 922 aa  128  6e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2063  TonB-dependent receptor  35.94 
 
 		 945 aa  127  8.000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1018  outer membrane insertion C-terminal signal  36.28 
 
 		 918 aa  127  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>