296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2410 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 926 aa  1883    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  41.1 
 
 		 868 aa  638    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  42.39 
 
 		 875 aa  654    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  40.9 
 
 		 868 aa  632  1e-180  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  32.78 
 
 		 927 aa  434  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  31.92 
 
 		 859 aa  410  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01579  TonB-dependent receptor  33.23 
 
 		 889 aa  405  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.419044  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  31.52 
 
 		 869 aa  357  6.999999999999999e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 875 aa  353  8e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  31.41 
 
 		 892 aa  351  5e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  30.55 
 
 		 870 aa  348  4e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  31.55 
 
 		 874 aa  345  2e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  30.5 
 
 		 888 aa  332  2e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  30.53 
 
 		 878 aa  327  8.000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  30.53 
 
 		 878 aa  326  2e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  30.17 
 
 		 878 aa  324  4e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  30.53 
 
 		 878 aa  324  5e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  28.78 
 
 		 880 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  29.91 
 
 		 872 aa  322  3e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  29.71 
 
 		 874 aa  320  7.999999999999999e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  29.85 
 
 		 915 aa  314  3.9999999999999997e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 874 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3426  TonB-dependent receptor  29.97 
 
 		 902 aa  311  4e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0666258  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 845 aa  299  2e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 894 aa  294  6e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 887 aa  293  1e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1136  TonB-dependent receptor  29.6 
 
 		 892 aa  293  1e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 887 aa  293  1e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 882 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 964 aa  287  8e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 900 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 881 aa  286  2.0000000000000002e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1773  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 1047 aa  277  5e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.133871  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 		 951 aa  274  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 964 aa  274  7e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 951 aa  268  4e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 951 aa  266  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 948 aa  263  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 914 aa  262  2e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 1036 aa  262  2e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 904 aa  234  5e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 934 aa  229  1e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 908 aa  214  5.999999999999999e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 908 aa  208  4e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1018  outer membrane insertion C-terminal signal  26.36 
 
 		 918 aa  207  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  27.26 
 
 		 908 aa  206  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2610  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 990 aa  204  6e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  27.01 
 
 		 908 aa  198  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 936 aa  196  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 936 aa  196  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4091  outer membrane insertion C-terminal signal  26.08 
 
 		 919 aa  196  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 945 aa  192  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0741  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 918 aa  190  1e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0701962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 908 aa  188  3e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0321  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 934 aa  187  6e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0815676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 967 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02398  putative tonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 901 aa  186  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.835744  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  35.5 
 
 		 888 aa  184  7e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2048  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 944 aa  182  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00100179  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 921 aa  183  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 912 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3988  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 945 aa  181  5.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01879  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 938 aa  179  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0181  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 911 aa  179  3e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331528  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0993  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 946 aa  176  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.609458  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 976 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 943 aa  169  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3318  Outer membrane receptor proteins mostly Fe transport-like  25.92 
 
 		 954 aa  167  9e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0120017  decreased coverage  0.00000382692 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1075  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 601 aa  163  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1315  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 988 aa  163  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243965 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04315  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 838 aa  162  4e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3075  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 988 aa  160  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179572 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4064  TonB-dependent receptor  23.42 
 
 		 836 aa  155  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  31.19 
 
 		 1109 aa  153  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0914  TonB-dependent receptor  31.97 
 
 		 987 aa  153  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  31.96 
 
 		 1035 aa  150  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3520  TonB-dependent receptor  33.66 
 
 		 957 aa  150  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 1007 aa  149  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1072  TonB-dependent receptor, plug  44.28 
 
 		 271 aa  150  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03790  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 982 aa  149  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03792  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 982 aa  149  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04960  TonB-dependent receptor  23.17 
 
 		 842 aa  148  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143885  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  30.48 
 
 		 931 aa  147  6e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  34.6 
 
 		 943 aa  147  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 918 aa  147  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1862  TonB-dependent receptor plug  31.14 
 
 		 947 aa  145  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.248067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  31.83 
 
 		 880 aa  145  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2995  TonB-dependent receptor  33.64 
 
 		 933 aa  143  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4286  TonB-dependent receptor  31.5 
 
 		 1013 aa  143  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00048068  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  31.79 
 
 		 881 aa  140  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1101  TonB-dependent receptor  32.93 
 
 		 1011 aa  139  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000197247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3880  TonB-dependent receptor  31.94 
 
 		 901 aa  139  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000233231  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3698  TonB-dependent receptor  33.45 
 
 		 961 aa  139  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2123  TonB-dependent receptor  31.34 
 
 		 925 aa  137  8e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.154655 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1603  TonB-dependent receptor  32.89 
 
 		 990 aa  137  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1264  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 923 aa  137  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000254862  unclonable  0.0000000223641 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  33.65 
 
 		 961 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 		 1097 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4000  hypothetical protein  23.35 
 
 		 972 aa  136  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.463681 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02198  TonB-dependent receptor  33.9 
 
 		 1048 aa  135  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>