More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0938 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  49.89 
 
 		 869 aa  836    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  82.98 
 
 		 887 aa  1525    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  48.16 
 
 		 874 aa  801    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  49.72 
 
 		 872 aa  816    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  49.5 
 
 		 888 aa  817    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  45.21 
 
 		 880 aa  764    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  81.41 
 
 		 882 aa  1514    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  49.27 
 
 		 870 aa  844    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  81.36 
 
 		 900 aa  1513    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 881 aa  1799    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  49.5 
 
 		 874 aa  827    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  83.09 
 
 		 887 aa  1526    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  49.39 
 
 		 874 aa  821    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1136  TonB-dependent receptor  41.85 
 
 		 892 aa  599  1e-170  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  34.1 
 
 		 845 aa  417  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  34.84 
 
 		 878 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  33.58 
 
 		 859 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  34.73 
 
 		 878 aa  403  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  34.73 
 
 		 878 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  34.62 
 
 		 878 aa  399  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  32.56 
 
 		 892 aa  399  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  31.52 
 
 		 964 aa  366  1e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  30.52 
 
 		 875 aa  358  2.9999999999999997e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  32.64 
 
 		 964 aa  354  5e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  30.67 
 
 		 927 aa  343  7e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1075  TonB-dependent receptor  35.62 
 
 		 601 aa  325  3e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 		 875 aa  320  6e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  30.06 
 
 		 868 aa  319  1e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  29.83 
 
 		 868 aa  316  9.999999999999999e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 894 aa  293  7e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  28.56 
 
 		 926 aa  281  3e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3426  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 902 aa  280  6e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0666258  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01579  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 		 889 aa  278  3e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.419044  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 1036 aa  272  2e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2694  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 945 aa  270  8e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00189695  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1072  TonB-dependent receptor, plug  61.63 
 
 		 271 aa  267  5e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  28.54 
 
 		 951 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  28.54 
 
 		 951 aa  266  1e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1773  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 1047 aa  266  1e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.133871  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 951 aa  264  6e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 961 aa  251  6e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 931 aa  216  1.9999999999999998e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1888  TonB-dependent receptor, plug  27.14 
 
 		 942 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 921 aa  213  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 918 aa  213  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 912 aa  209  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  26.32 
 
 		 940 aa  208  4e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2123  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 925 aa  204  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.154655 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2288  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 940 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 939 aa  201  3e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 939 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0952  ribosomal protein L17  26.62 
 
 		 906 aa  198  4.0000000000000005e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000237948  hitchhiker  0.00000537684 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 885 aa  196  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 922 aa  196  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1289  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 978 aa  196  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.384181  normal  0.0181603 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2162  tonB dependent receptor-related protein  27 
 
 		 836 aa  195  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  24.83 
 
 		 929 aa  194  5e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  25.58 
 
 		 941 aa  192  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01879  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 938 aa  185  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 945 aa  180  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 943 aa  179  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  24.92 
 
 		 959 aa  179  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12613  normal  0.0122478 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04315  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 838 aa  177  6e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  27.12 
 
 		 908 aa  177  8e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1787  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 906 aa  172  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0993  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 946 aa  171  6e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.609458  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02628  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 967 aa  171  6e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4064  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 836 aa  169  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3939  TonB-dependent receptor  44.89 
 
 		 1017 aa  169  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.719926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  36.36 
 
 		 967 aa  160  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 		 943 aa  158  5.0000000000000005e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4286  TonB-dependent receptor  34.9 
 
 		 1013 aa  157  8e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00048068  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  39.24 
 
 		 880 aa  157  9e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  31.65 
 
 		 1109 aa  157  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  36.84 
 
 		 934 aa  156  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  36.93 
 
 		 978 aa  155  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03792  TonB-dependent receptor  30.23 
 
 		 982 aa  154  5e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03790  TonB-dependent receptor  30.23 
 
 		 982 aa  154  5e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  38.03 
 
 		 998 aa  154  7e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  34.25 
 
 		 1035 aa  152  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1397  TonB-dependent receptor  37.96 
 
 		 1008 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0795822  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  38.89 
 
 		 915 aa  150  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  36.36 
 
 		 986 aa  150  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  37.4 
 
 		 914 aa  149  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3278  TonB-dependent receptor  36.82 
 
 		 1006 aa  149  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000542759  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  33 
 
 		 919 aa  148  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  31.67 
 
 		 1097 aa  148  6e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  36.97 
 
 		 920 aa  147  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1264  TonB-dependent receptor  35.17 
 
 		 923 aa  147  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000254862  unclonable  0.0000000223641 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1180  TonB-dependent receptor plug  39.39 
 
 		 998 aa  146  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103368  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1213  TonB-dependent receptor plug  39.39 
 
 		 998 aa  146  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0027404  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  32.52 
 
 		 958 aa  146  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  36.91 
 
 		 994 aa  145  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3177  TonB-dependent receptor plug  39.39 
 
 		 998 aa  145  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0554366  normal  0.201208 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  35.27 
 
 		 924 aa  145  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2610  TonB-dependent receptor  36.21 
 
 		 990 aa  144  9e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1144  TonB-dependent receptor  33.87 
 
 		 998 aa  144  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.503724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02805  TonB-dependent receptor  36.82 
 
 		 984 aa  139  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2831  TonB-dependent receptor  36.21 
 
 		 1017 aa  139  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312768  hitchhiker  0.00196838 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03903  TonB-dependent receptor  31.75 
 
 		 1074 aa  138  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>