288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1018 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1018  outer membrane insertion C-terminal signal  100 
 
 		 918 aa  1869    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2063  TonB-dependent receptor  40.15 
 
 		 945 aa  594  1e-168  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1787  TonB-dependent receptor  38.59 
 
 		 906 aa  558  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  38.12 
 
 		 908 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  38.97 
 
 		 908 aa  549  1e-155  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  38.12 
 
 		 908 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  38.01 
 
 		 908 aa  547  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4091  outer membrane insertion C-terminal signal  37.54 
 
 		 919 aa  545  1e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  37.92 
 
 		 908 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  38.9 
 
 		 943 aa  536  1e-151  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2735  TonB-dependent receptor  38.14 
 
 		 921 aa  530  1e-149  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.692321  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0866  TonB-dependent receptor  38.55 
 
 		 924 aa  525  1e-147  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0181  TonB-dependent receptor  37.35 
 
 		 911 aa  521  1e-146  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1888  TonB-dependent receptor  35.36 
 
 		 906 aa  481  1e-134  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0505133  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01879  TonB-dependent receptor  31.71 
 
 		 938 aa  406  1.0000000000000001e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1938  TonB-dependent receptor  33.67 
 
 		 971 aa  390  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0886775  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02628  TonB-dependent receptor  33.04 
 
 		 967 aa  388  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0993  TonB-dependent receptor  31.23 
 
 		 946 aa  385  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.609458  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  32.06 
 
 		 976 aa  386  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3075  TonB-dependent receptor  31.41 
 
 		 988 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179572 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1315  TonB-dependent receptor  31.4 
 
 		 988 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243965 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  31.98 
 
 		 940 aa  375  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  31.04 
 
 		 939 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  31.22 
 
 		 939 aa  375  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  30.89 
 
 		 941 aa  372  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2288  TonB-dependent receptor  30.48 
 
 		 940 aa  369  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3818  TonB-dependent receptor  31.57 
 
 		 974 aa  367  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.003378  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1888  TonB-dependent receptor, plug  30.26 
 
 		 942 aa  363  6e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 		 1007 aa  340  9.999999999999999e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0559  TonB dependent receptor-related protein  28.73 
 
 		 960 aa  336  2e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 885 aa  326  1e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1940  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 1010 aa  326  1e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 921 aa  319  1e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 912 aa  319  2e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2162  tonB dependent receptor-related protein  30.72 
 
 		 836 aa  307  6e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01881  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 1016 aa  296  1e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.529383  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 904 aa  270  7e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3880  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 901 aa  268  5e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000233231  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 915 aa  251  5e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 918 aa  236  1.0000000000000001e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0696  hypothetical protein  26.8 
 
 		 970 aa  231  7e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000664901  unclonable  0.0000000149874 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 951 aa  226  1e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 948 aa  226  1e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 951 aa  225  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 961 aa  226  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 951 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 1097 aa  224  7e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 926 aa  209  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  34.57 
 
 		 908 aa  204  6e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 934 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 922 aa  194  5e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4482  hypothetical protein  35.5 
 
 		 312 aa  191  4e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 		 920 aa  190  9e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03903  TonB-dependent receptor  23.89 
 
 		 1074 aa  190  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1893  TonB-dependent receptor  23.62 
 
 		 941 aa  189  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.175561 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  23.21 
 
 		 967 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 945 aa  184  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1264  TonB-dependent receptor  24.11 
 
 		 923 aa  184  8.000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000254862  unclonable  0.0000000223641 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0253  TonB-dependent receptor  23.79 
 
 		 1011 aa  182  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0016718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 936 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 936 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  34.29 
 
 		 959 aa  171  8e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12613  normal  0.0122478 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1136  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 892 aa  168  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2991  hypothetical protein  28.27 
 
 		 1013 aa  161  5e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000283322  hitchhiker  0.000000325565 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  32.51 
 
 		 931 aa  152  4e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2065  TonB-dependent receptor  34.46 
 
 		 963 aa  151  6e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  30.68 
 
 		 1109 aa  148  4.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  31.54 
 
 		 888 aa  144  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 958 aa  144  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0321  TonB-dependent receptor  24.23 
 
 		 934 aa  142  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0815676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 894 aa  142  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1386  hypothetical protein  28.19 
 
 		 1046 aa  141  6e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000408374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 880 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  35.91 
 
 		 914 aa  140  8.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  33.02 
 
 		 986 aa  140  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  32.54 
 
 		 929 aa  140  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  29.3 
 
 		 878 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  29.3 
 
 		 878 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4006  TonB-dependent receptor  31.21 
 
 		 984 aa  139  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000010552  normal  0.168301 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  29.3 
 
 		 878 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  30.28 
 
 		 924 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  29.3 
 
 		 878 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 875 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  31.18 
 
 		 859 aa  135  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 943 aa  134  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 875 aa  134  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 919 aa  132  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 964 aa  132  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2137  TonB-dependent receptor  30.14 
 
 		 1013 aa  130  8.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255977  normal  0.143212 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03792  TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 982 aa  130  9.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03790  TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 982 aa  130  9.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  30.03 
 
 		 1036 aa  130  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1101  TonB-dependent receptor  33.92 
 
 		 1011 aa  130  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000197247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2995  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 933 aa  128  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  31.96 
 
 		 998 aa  128  6e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  34.32 
 
 		 994 aa  126  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1843  TonB-dependent receptor  29.16 
 
 		 1083 aa  125  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  unclonable  0.0000000198025  decreased coverage  0.000327731 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4286  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 1013 aa  126  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00048068  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  29.87 
 
 		 964 aa  125  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1289  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 978 aa  125  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.384181  normal  0.0181603 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>