More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02398 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3988  TonB-dependent receptor  48.4 
 
 		 945 aa  880    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02398  putative tonB-dependent receptor  100 
 
 		 901 aa  1831    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.835744  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2082  TonB-dependent receptor  38.58 
 
 		 942 aa  619  1e-176  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2207  TonB-dependent receptor  37.99 
 
 		 944 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1893  TonB-dependent receptor  38.47 
 
 		 941 aa  615  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.175561 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2111  TonB-dependent receptor  37.75 
 
 		 917 aa  609  1e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2523  TonB-dependent receptor  37.55 
 
 		 943 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4000  hypothetical protein  38.45 
 
 		 972 aa  601  1e-170  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.463681 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0532  TonB-dependent receptor  38.11 
 
 		 936 aa  590  1e-167  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0904706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4064  TonB-dependent receptor  41.82 
 
 		 836 aa  589  1e-167  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200466  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  39.29 
 
 		 838 aa  566  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04960  TonB-dependent receptor  40.79 
 
 		 842 aa  561  1e-158  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143885  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1557  TonB-dependent receptor  35.84 
 
 		 853 aa  461  9.999999999999999e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2369  TonB-dependent receptor  33.66 
 
 		 935 aa  454  1.0000000000000001e-126  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.415062 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  31.7 
 
 		 946 aa  388  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  30.24 
 
 		 938 aa  356  8.999999999999999e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1121  TonB-dependent receptor plug  29.54 
 
 		 919 aa  351  5e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00302  TonB-dependent receptor  33.25 
 
 		 746 aa  341  2.9999999999999998e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0777336  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1535  TonB-dependent receptor  30.31 
 
 		 972 aa  339  9.999999999999999e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.39302  normal  0.5632 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 962 aa  299  1e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0889  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  27.04 
 
 		 992 aa  280  7e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000114339  unclonable  0.0000000138215 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3110  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 943 aa  256  9e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.183565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 894 aa  250  6e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4146  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 961 aa  241  2.9999999999999997e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960595  normal  0.432652 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 859 aa  229  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 1004 aa  224  4.9999999999999996e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2444  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 1001 aa  223  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 875 aa  219  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2398  TonB-dependent receptor plug  24.64 
 
 		 932 aa  202  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 961 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 927 aa  201  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4721  TonB-dependent receptor  24.24 
 
 		 917 aa  202  3e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 882 aa  201  7e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02336  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 889 aa  200  7.999999999999999e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0825116  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 900 aa  199  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 880 aa  195  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 		 888 aa  194  5e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1070  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 991 aa  194  9e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 875 aa  192  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6376  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 920 aa  190  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 885 aa  190  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 926 aa  186  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 869 aa  184  6e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 868 aa  182  2e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 868 aa  182  2.9999999999999997e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 872 aa  181  7e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 931 aa  180  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 870 aa  179  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 845 aa  179  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 		 943 aa  176  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 888 aa  174  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1862  TonB-dependent receptor plug  24.97 
 
 		 947 aa  172  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.248067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 874 aa  172  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3520  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 957 aa  172  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 1007 aa  166  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 908 aa  166  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0830  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 933 aa  166  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.926876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1888  TonB-dependent receptor  23.18 
 
 		 906 aa  164  8.000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0505133  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 929 aa  162  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 918 aa  161  6e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3638  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 993 aa  160  7e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000344146  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  24.34 
 
 		 940 aa  160  7e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 892 aa  160  9e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  23.65 
 
 		 874 aa  158  4e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 915 aa  153  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2735  TonB-dependent receptor  23.63 
 
 		 921 aa  153  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.692321  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1940  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 		 1010 aa  151  6e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 948 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0321  TonB-dependent receptor  22.73 
 
 		 934 aa  149  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0815676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04315  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 838 aa  147  8.000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  23.16 
 
 		 951 aa  146  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 		 945 aa  145  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2048  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 944 aa  143  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00100179  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  22.84 
 
 		 951 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  22.84 
 
 		 951 aa  142  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1603  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 990 aa  140  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 936 aa  139  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 936 aa  139  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2126  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 986 aa  138  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.593846  normal  0.258054 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4228  TonB-dependent receptor plug  24.39 
 
 		 931 aa  137  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0914  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 987 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 922 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 		 1097 aa  131  7.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1289  TonB-dependent receptor  21.68 
 
 		 978 aa  130  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.384181  normal  0.0181603 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 		 881 aa  127  6e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 958 aa  127  6e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1136  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 892 aa  125  5e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04688  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 918 aa  124  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1075  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 601 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  26.72 
 
 		 908 aa  122  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  32.75 
 
 		 914 aa  122  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3075  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 988 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179572 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  30.65 
 
 		 921 aa  121  6e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  28.61 
 
 		 1109 aa  120  7.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  31.28 
 
 		 887 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  30.65 
 
 		 912 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  31.28 
 
 		 887 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  28.61 
 
 		 878 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1315  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 		 988 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243965 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 		 976 aa  119  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>