More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1401 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 878 aa  1802    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  99.54 
 
 		 878 aa  1793    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  99.43 
 
 		 878 aa  1792    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  99.32 
 
 		 878 aa  1791    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1136  TonB-dependent receptor  37.57 
 
 		 892 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  35.08 
 
 		 845 aa  462  9.999999999999999e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  35.74 
 
 		 859 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  34.31 
 
 		 887 aa  413  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  34.19 
 
 		 888 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  34.62 
 
 		 869 aa  414  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  33.3 
 
 		 874 aa  411  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  32.59 
 
 		 875 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  34.79 
 
 		 887 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  33.78 
 
 		 874 aa  404  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  34.15 
 
 		 872 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  34.26 
 
 		 874 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  34.62 
 
 		 881 aa  399  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  33.44 
 
 		 880 aa  393  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  33.59 
 
 		 870 aa  395  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  33.51 
 
 		 900 aa  392  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  32.79 
 
 		 892 aa  388  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  33.52 
 
 		 882 aa  387  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 		 927 aa  355  1e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  32.4 
 
 		 868 aa  353  5.9999999999999994e-96  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  31.64 
 
 		 894 aa  353  5.9999999999999994e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  32.19 
 
 		 868 aa  346  1e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  30.44 
 
 		 964 aa  328  3e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  30.86 
 
 		 875 aa  327  7e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 		 964 aa  320  6e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  30.66 
 
 		 926 aa  318  3e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 915 aa  296  1e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01579  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 		 889 aa  294  6e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.419044  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 951 aa  291  5.0000000000000004e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 951 aa  291  5.0000000000000004e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 951 aa  290  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  28.6 
 
 		 885 aa  284  5.000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 958 aa  283  1e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 1036 aa  280  7e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 948 aa  277  7e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1075  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 601 aa  274  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 961 aa  272  2e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 880 aa  266  8.999999999999999e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 918 aa  264  6.999999999999999e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 919 aa  261  4e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1508  TonB-dependent receptor  27.29 
 
 		 958 aa  256  2.0000000000000002e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000651564  unclonable  0.0000000259897 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 931 aa  255  3e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 934 aa  245  3e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3638  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 993 aa  242  2e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000344146  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2079  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 994 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000280363  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2288  peptidase M24A  27.38 
 
 		 927 aa  231  4e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000032845  unclonable  0.0000000380326 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  27.12 
 
 		 908 aa  230  8e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 908 aa  228  5.0000000000000005e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 908 aa  226  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 908 aa  223  9e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  27.46 
 
 		 908 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  27.25 
 
 		 908 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01879  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 938 aa  220  1e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 939 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 939 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1888  TonB-dependent receptor, plug  26.94 
 
 		 942 aa  218  5e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02628  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 967 aa  215  2.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  26.42 
 
 		 940 aa  213  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3988  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 945 aa  211  5e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2288  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 940 aa  208  3e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0993  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 946 aa  208  4e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.609458  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1072  TonB-dependent receptor, plug  54.13 
 
 		 271 aa  205  4e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 936 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2063  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 945 aa  202  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04315  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 838 aa  198  5.000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 936 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 945 aa  196  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2048  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 944 aa  194  7e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00100179  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2162  tonB dependent receptor-related protein  26.22 
 
 		 836 aa  185  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  24.52 
 
 		 959 aa  185  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12613  normal  0.0122478 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2111  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 917 aa  185  3e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1938  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 971 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0886775  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 1007 aa  184  5.0000000000000004e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3818  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 974 aa  183  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.003378  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  33.11 
 
 		 921 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 1035 aa  180  8e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  32.88 
 
 		 912 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04960  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 842 aa  179  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143885  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  25.87 
 
 		 838 aa  178  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  31.39 
 
 		 888 aa  178  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2207  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 944 aa  177  8e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1773  TonB-dependent receptor  37.05 
 
 		 1047 aa  174  6.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.133871  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3426  TonB-dependent receptor  34.93 
 
 		 902 aa  166  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0666258  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1862  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 947 aa  164  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.248067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  37.72 
 
 		 1097 aa  164  9e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2991  hypothetical protein  22.89 
 
 		 1013 aa  164  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000283322  hitchhiker  0.000000325565 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  36.75 
 
 		 924 aa  163  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  35.43 
 
 		 967 aa  162  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  36.23 
 
 		 920 aa  158  5.0000000000000005e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1101  TonB-dependent receptor  32.1 
 
 		 1011 aa  157  7e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000197247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  35.28 
 
 		 1109 aa  157  7e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1397  TonB-dependent receptor  34.22 
 
 		 1008 aa  157  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0795822  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  35.06 
 
 		 943 aa  155  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4286  TonB-dependent receptor  36.01 
 
 		 1013 aa  154  5e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00048068  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  31.62 
 
 		 986 aa  154  5.9999999999999996e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  34.81 
 
 		 978 aa  154  8e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>