276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0993 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0993  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 946 aa  1926    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.609458  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  40.79 
 
 		 908 aa  644    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  41.13 
 
 		 908 aa  673    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  40.5 
 
 		 908 aa  645    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1938  TonB-dependent receptor  42.16 
 
 		 971 aa  734    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0886775  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02628  TonB-dependent receptor  42.6 
 
 		 967 aa  745    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3818  TonB-dependent receptor  41.57 
 
 		 974 aa  722    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.003378  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01879  TonB-dependent receptor  62.62 
 
 		 938 aa  1233    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  40.89 
 
 		 908 aa  642    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1787  TonB-dependent receptor  40.48 
 
 		 906 aa  638    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  40.89 
 
 		 908 aa  642    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4091  outer membrane insertion C-terminal signal  38.16 
 
 		 919 aa  566  1e-160  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2735  TonB-dependent receptor  35.77 
 
 		 921 aa  518  1.0000000000000001e-145  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.692321  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0866  TonB-dependent receptor  33.52 
 
 		 924 aa  484  1e-135  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1888  TonB-dependent receptor  33.09 
 
 		 906 aa  450  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0505133  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0181  TonB-dependent receptor  32.73 
 
 		 911 aa  430  1e-119  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  30.24 
 
 		 943 aa  389  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2063  TonB-dependent receptor  30.28 
 
 		 945 aa  383  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1018  outer membrane insertion C-terminal signal  31.37 
 
 		 918 aa  380  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1888  TonB-dependent receptor, plug  29.26 
 
 		 942 aa  338  3.9999999999999995e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 939 aa  337  5.999999999999999e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 939 aa  337  7e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  29.2 
 
 		 941 aa  336  1e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  29.2 
 
 		 940 aa  331  3e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2288  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 940 aa  327  6e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 1007 aa  319  2e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0559  TonB dependent receptor-related protein  27.53 
 
 		 960 aa  301  4e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  28.03 
 
 		 959 aa  301  5e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12613  normal  0.0122478 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 885 aa  300  7e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3075  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 988 aa  295  4e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179572 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1315  TonB-dependent receptor  28.6 
 
 		 988 aa  294  6e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243965 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2162  tonB dependent receptor-related protein  28.7 
 
 		 836 aa  291  3e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01881  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 1016 aa  283  1e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.529383  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 976 aa  283  1e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 921 aa  279  2e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 912 aa  272  2e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 908 aa  265  2e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 904 aa  259  1e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1940  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 1010 aa  252  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 961 aa  250  9e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 894 aa  246  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3880  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 901 aa  245  3e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000233231  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 1097 aa  243  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  26.8 
 
 		 1109 aa  242  2.9999999999999997e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 943 aa  239  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 915 aa  228  4e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 958 aa  227  8e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 948 aa  226  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  26.8 
 
 		 878 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  26.49 
 
 		 878 aa  221  6e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  26.67 
 
 		 878 aa  220  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  26.1 
 
 		 878 aa  220  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 934 aa  219  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 875 aa  211  5e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 951 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 951 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1136  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 892 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1213  TonB-dependent receptor plug  26.34 
 
 		 998 aa  202  3e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0027404  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1180  TonB-dependent receptor plug  26.34 
 
 		 998 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103368  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 951 aa  201  7e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 994 aa  200  9e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3177  TonB-dependent receptor plug  26.15 
 
 		 998 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0554366  normal  0.201208 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 868 aa  196  1e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 868 aa  195  4e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4482  hypothetical protein  37.14 
 
 		 312 aa  194  8e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 		 919 aa  191  5.999999999999999e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03903  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 1074 aa  187  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2079  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 994 aa  187  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000280363  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1397  TonB-dependent receptor  24.83 
 
 		 1008 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0795822  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1264  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 923 aa  185  4.0000000000000006e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000254862  unclonable  0.0000000223641 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2991  hypothetical protein  23.56 
 
 		 1013 aa  185  4.0000000000000006e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000283322  hitchhiker  0.000000325565 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 875 aa  183  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 920 aa  183  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1144  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 998 aa  183  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.503724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2995  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 933 aa  182  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 926 aa  177  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 		 881 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  23.48 
 
 		 900 aa  171  4e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0741  TonB-dependent receptor  23.28 
 
 		 918 aa  171  5e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0701962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 964 aa  169  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 927 aa  167  8e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1125  TonB-dependent receptor plug  25.25 
 
 		 944 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 887 aa  165  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  24.35 
 
 		 887 aa  164  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01579  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 889 aa  160  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.419044  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3318  Outer membrane receptor proteins mostly Fe transport-like  23.34 
 
 		 954 aa  158  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0120017  decreased coverage  0.00000382692 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 1035 aa  158  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03790  TonB-dependent receptor  30.12 
 
 		 982 aa  154  5.9999999999999996e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03792  TonB-dependent receptor  30.12 
 
 		 982 aa  154  5.9999999999999996e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02805  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 984 aa  152  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  22.52 
 
 		 945 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  30.29 
 
 		 998 aa  150  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0321  TonB-dependent receptor  23.18 
 
 		 934 aa  146  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0815676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4286  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 1013 aa  140  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00048068  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  37.5 
 
 		 978 aa  134  6.999999999999999e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2610  TonB-dependent receptor  30.1 
 
 		 990 aa  132  4.0000000000000003e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 918 aa  131  6e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  31.42 
 
 		 967 aa  131  7.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  31.09 
 
 		 914 aa  130  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  29.68 
 
 		 986 aa  129  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>