More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1136 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  43.01 
 
 		 887 aa  649    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  44.58 
 
 		 869 aa  677    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  45.17 
 
 		 874 aa  680    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  45.41 
 
 		 872 aa  672    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  40.85 
 
 		 900 aa  637    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  43.89 
 
 		 874 aa  669    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  43.85 
 
 		 870 aa  676    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  46.46 
 
 		 888 aa  723    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1075  TonB-dependent receptor  99.16 
 
 		 601 aa  1216    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  42.6 
 
 		 880 aa  651    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  43.56 
 
 		 887 aa  652    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1136  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 892 aa  1831    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  45.3 
 
 		 874 aa  677    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  42.09 
 
 		 881 aa  634  1e-180  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  40.24 
 
 		 882 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1072  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 271 aa  528  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  39.68 
 
 		 845 aa  511  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  37.76 
 
 		 878 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  37.87 
 
 		 878 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  38.01 
 
 		 878 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  37.76 
 
 		 878 aa  492  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  36.46 
 
 		 859 aa  479  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  35.77 
 
 		 892 aa  446  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  33.04 
 
 		 875 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  32.69 
 
 		 875 aa  371  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  32.25 
 
 		 964 aa  357  5e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  31.02 
 
 		 927 aa  353  7e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  31.54 
 
 		 868 aa  333  7.000000000000001e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  31.51 
 
 		 868 aa  332  2e-89  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  31.17 
 
 		 964 aa  331  4e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  30.64 
 
 		 915 aa  309  1.0000000000000001e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3426  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 902 aa  308  4.0000000000000004e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0666258  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  29.88 
 
 		 926 aa  307  5.0000000000000004e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  30.14 
 
 		 894 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01579  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 		 889 aa  284  4.0000000000000003e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.419044  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 		 1036 aa  283  9e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  30.01 
 
 		 948 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 		 951 aa  267  8e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 951 aa  266  1e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 951 aa  262  3e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 934 aa  258  3e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 888 aa  249  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 881 aa  241  4e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1213  TonB-dependent receptor plug  27.77 
 
 		 998 aa  238  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0027404  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3177  TonB-dependent receptor plug  27.77 
 
 		 998 aa  237  7e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0554366  normal  0.201208 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1180  TonB-dependent receptor plug  27.46 
 
 		 998 aa  237  9e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103368  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4064  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 836 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200466  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 994 aa  235  3e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 924 aa  234  7.000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 908 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1787  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 906 aa  218  5e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0993  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 946 aa  212  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.609458  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3880  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 901 aa  212  3e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000233231  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1603  TonB-dependent receptor  26.31 
 
 		 990 aa  211  6e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0952  ribosomal protein L17  24.59 
 
 		 906 aa  211  7e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000237948  hitchhiker  0.00000537684 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04315  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 838 aa  208  3e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04960  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 842 aa  206  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143885  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2735  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 921 aa  206  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.692321  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4091  outer membrane insertion C-terminal signal  27.35 
 
 		 919 aa  205  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  26.13 
 
 		 838 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  25.05 
 
 		 885 aa  202  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1125  TonB-dependent receptor plug  26.49 
 
 		 944 aa  202  3e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2063  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 945 aa  193  9e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3939  TonB-dependent receptor  43.18 
 
 		 1017 aa  191  7e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.719926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2502  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  25.67 
 
 		 968 aa  187  9e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0144507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  38.18 
 
 		 1109 aa  187  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 943 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1773  TonB-dependent receptor  46.34 
 
 		 1047 aa  184  6e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.133871  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3818  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 974 aa  183  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.003378  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  38.41 
 
 		 958 aa  182  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  37.11 
 
 		 943 aa  178  4e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1018  outer membrane insertion C-terminal signal  25.83 
 
 		 918 aa  178  4e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0741  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 918 aa  175  2.9999999999999996e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0701962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4000  hypothetical protein  25.8 
 
 		 972 aa  174  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.463681 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4286  TonB-dependent receptor  34.12 
 
 		 1013 aa  173  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00048068  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  34.53 
 
 		 1097 aa  170  9e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2610  TonB-dependent receptor  33.64 
 
 		 990 aa  170  9e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  31.91 
 
 		 967 aa  170  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  33.62 
 
 		 978 aa  169  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1144  TonB-dependent receptor  34.11 
 
 		 998 aa  168  5e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.503724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1397  TonB-dependent receptor  41.7 
 
 		 1008 aa  167  9e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0795822  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  41.63 
 
 		 998 aa  166  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03790  TonB-dependent receptor  40.76 
 
 		 982 aa  163  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03792  TonB-dependent receptor  40.76 
 
 		 982 aa  163  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3278  TonB-dependent receptor  34.23 
 
 		 1006 aa  161  5e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000542759  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  37.41 
 
 		 914 aa  159  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  29.86 
 
 		 880 aa  159  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 936 aa  159  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 945 aa  159  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 936 aa  158  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  34.43 
 
 		 919 aa  157  6e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2048  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 944 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00100179  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1101  TonB-dependent receptor  35.42 
 
 		 1011 aa  153  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000197247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0914  TonB-dependent receptor  32.49 
 
 		 987 aa  152  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  40.77 
 
 		 986 aa  151  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  38.52 
 
 		 931 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1264  TonB-dependent receptor  39.29 
 
 		 923 aa  148  4.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000254862  unclonable  0.0000000223641 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 		 921 aa  148  5e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  40 
 
 		 1035 aa  147  6e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2694  TonB-dependent receptor  33.22 
 
 		 945 aa  147  9e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00189695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>