More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3024 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  50.95 
 
 		 887 aa  852    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  88.44 
 
 		 874 aa  1583    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  49.39 
 
 		 881 aa  836    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  94.28 
 
 		 888 aa  1686    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  71.43 
 
 		 870 aa  1268    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  78.49 
 
 		 874 aa  1415    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  91.53 
 
 		 872 aa  1628    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1136  TonB-dependent receptor  45.04 
 
 		 892 aa  657    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  63.43 
 
 		 880 aa  1114    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  48.61 
 
 		 882 aa  830    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  71.2 
 
 		 869 aa  1258    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  48.72 
 
 		 900 aa  842    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  51.5 
 
 		 887 aa  852    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 874 aa  1788    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  36.03 
 
 		 845 aa  457  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  35.27 
 
 		 892 aa  457  1e-127  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  34.23 
 
 		 878 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  34.23 
 
 		 878 aa  415  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  34.23 
 
 		 878 aa  415  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  34.23 
 
 		 878 aa  416  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  33.79 
 
 		 859 aa  410  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  31.61 
 
 		 927 aa  379  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1075  TonB-dependent receptor  38.27 
 
 		 601 aa  360  9e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  31.26 
 
 		 875 aa  353  1e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  30.67 
 
 		 875 aa  347  7e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  31.83 
 
 		 868 aa  346  1e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  31.6 
 
 		 868 aa  344  5e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  30.94 
 
 		 964 aa  330  8e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  30.47 
 
 		 964 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  30.81 
 
 		 894 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  29.71 
 
 		 926 aa  320  1e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01579  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 889 aa  303  9e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.419044  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 		 915 aa  303  1e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3426  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 902 aa  302  2e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0666258  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1072  TonB-dependent receptor, plug  65.98 
 
 		 271 aa  281  3e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2694  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 945 aa  261  3e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00189695  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 919 aa  257  6e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 918 aa  252  2e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 961 aa  242  2.9999999999999997e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 924 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 921 aa  231  4e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03792  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 982 aa  229  1e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03790  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 982 aa  229  1e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1508  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 958 aa  228  5.0000000000000005e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000651564  unclonable  0.0000000259897 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 912 aa  227  6e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  26.65 
 
 		 986 aa  227  7e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1862  TonB-dependent receptor plug  26.17 
 
 		 947 aa  213  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.248067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 881 aa  211  6e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1773  TonB-dependent receptor  24.83 
 
 		 1047 aa  206  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.133871  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0952  ribosomal protein L17  26.76 
 
 		 906 aa  206  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000237948  hitchhiker  0.00000537684 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0741  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 918 aa  204  7e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0701962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 		 885 aa  199  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2063  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 945 aa  187  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 936 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 936 aa  185  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04315  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 838 aa  184  9.000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  24.61 
 
 		 959 aa  180  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12613  normal  0.0122478 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  26.31 
 
 		 908 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3638  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 993 aa  178  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000344146  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 908 aa  178  4e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1787  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 906 aa  178  4e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  34.42 
 
 		 1036 aa  178  5e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2242  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 950 aa  177  7e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1888  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 906 aa  176  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0505133  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02398  putative tonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 901 aa  176  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.835744  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  26.1 
 
 		 908 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  35.8 
 
 		 1109 aa  173  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  32.37 
 
 		 967 aa  172  4e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  33.92 
 
 		 943 aa  171  4e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  37.25 
 
 		 934 aa  170  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3939  TonB-dependent receptor  42.61 
 
 		 1017 aa  163  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.719926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  35.49 
 
 		 1097 aa  163  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4064  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 836 aa  160  9e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  31.03 
 
 		 958 aa  159  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4286  TonB-dependent receptor  32.82 
 
 		 1013 aa  159  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00048068  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  33.23 
 
 		 998 aa  156  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2610  TonB-dependent receptor  33 
 
 		 990 aa  156  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  38.29 
 
 		 914 aa  155  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  36.97 
 
 		 951 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 994 aa  155  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1180  TonB-dependent receptor plug  32.52 
 
 		 998 aa  155  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103368  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1213  TonB-dependent receptor plug  32.52 
 
 		 998 aa  155  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0027404  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1557  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 853 aa  154  5.9999999999999996e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3177  TonB-dependent receptor plug  32.52 
 
 		 998 aa  154  7e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0554366  normal  0.201208 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2126  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 986 aa  153  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.593846  normal  0.258054 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04960  TonB-dependent receptor  25.09 
 
 		 842 aa  153  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143885  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  36.67 
 
 		 951 aa  153  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  36.67 
 
 		 951 aa  152  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03903  TonB-dependent receptor  31.78 
 
 		 1074 aa  151  4e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1264  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 923 aa  150  7e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000254862  unclonable  0.0000000223641 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1397  TonB-dependent receptor  36.18 
 
 		 1008 aa  150  7e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0795822  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1144  TonB-dependent receptor  31.4 
 
 		 998 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.503724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3278  TonB-dependent receptor  39.06 
 
 		 1006 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000542759  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 1035 aa  148  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  33.23 
 
 		 978 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2111  TonB-dependent receptor  23.09 
 
 		 917 aa  144  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  23.17 
 
 		 838 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  33.02 
 
 		 948 aa  144  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1603  TonB-dependent receptor  33.77 
 
 		 990 aa  141  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  36.67 
 
 		 920 aa  140  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>