269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2160 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  48.53 
 
 		 945 aa  811    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2242  TonB-dependent receptor  44.44 
 
 		 950 aa  734    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2288  peptidase M24A  50.11 
 
 		 927 aa  858    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000032845  unclonable  0.0000000380326 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3318  Outer membrane receptor proteins mostly Fe transport-like  44.51 
 
 		 954 aa  757    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0120017  decreased coverage  0.00000382692 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2048  TonB-dependent receptor  46.8 
 
 		 944 aa  801    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00100179  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 922 aa  1873    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  46.59 
 
 		 936 aa  783    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  46.59 
 
 		 936 aa  783    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  32.54 
 
 		 881 aa  363  1e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0741  TonB-dependent receptor  29.5 
 
 		 918 aa  360  8e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0701962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 		 880 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2502  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  28.02 
 
 		 968 aa  314  4.999999999999999e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0144507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1289  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 978 aa  296  2e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.384181  normal  0.0181603 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 951 aa  295  2e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 951 aa  295  4e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 951 aa  292  2e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 894 aa  278  4e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 948 aa  257  8e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1508  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 958 aa  254  6e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000651564  unclonable  0.0000000259897 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2079  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 994 aa  251  5e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000280363  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 1097 aa  248  3e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 934 aa  247  9e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 943 aa  246  9.999999999999999e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3638  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 993 aa  244  7e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000344146  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2137  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 1013 aa  237  6e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255977  normal  0.143212 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 859 aa  237  8e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 915 aa  234  7.000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 875 aa  229  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 875 aa  229  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 918 aa  229  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 967 aa  227  8e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2720  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 1009 aa  226  1e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.000000258905  normal  0.119134 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 868 aa  220  8.999999999999998e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1315  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 988 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243965 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 927 aa  220  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3075  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 988 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179572 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 976 aa  218  5.9999999999999996e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 868 aa  217  7e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  25.48 
 
 		 908 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3177  TonB-dependent receptor plug  27.83 
 
 		 998 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0554366  normal  0.201208 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1838  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 979 aa  215  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.534381  hitchhiker  0.00298176 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  26.97 
 
 		 940 aa  215  3.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1213  TonB-dependent receptor plug  27.83 
 
 		 998 aa  215  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0027404  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1180  TonB-dependent receptor plug  27.92 
 
 		 998 aa  214  7e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103368  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  25.9 
 
 		 941 aa  212  3e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 885 aa  211  4e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 888 aa  210  9e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 908 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  25.73 
 
 		 908 aa  209  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2995  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 933 aa  209  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 904 aa  208  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 964 aa  207  5e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3650  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 1012 aa  208  5e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000400327  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 931 aa  206  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  25.58 
 
 		 908 aa  207  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0559  TonB dependent receptor-related protein  24.98 
 
 		 960 aa  206  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 939 aa  205  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 939 aa  205  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0696  hypothetical protein  25.32 
 
 		 970 aa  204  8e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000664901  unclonable  0.0000000149874 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1888  TonB-dependent receptor, plug  26.34 
 
 		 942 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1862  TonB-dependent receptor plug  25.46 
 
 		 947 aa  197  9e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.248067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3520  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 957 aa  196  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 920 aa  196  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 881 aa  196  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 1007 aa  195  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 908 aa  193  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2288  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 940 aa  193  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  24.9 
 
 		 986 aa  192  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3426  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 902 aa  192  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0666258  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 1036 aa  192  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0952  ribosomal protein L17  26.38 
 
 		 906 aa  191  4e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000237948  hitchhiker  0.00000537684 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1018  outer membrane insertion C-terminal signal  26.28 
 
 		 918 aa  191  4e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2162  tonB dependent receptor-related protein  26.13 
 
 		 836 aa  191  7e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 914 aa  190  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 964 aa  187  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 943 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0321  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 934 aa  185  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0815676  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 994 aa  184  9.000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03867  TonB-dependent receptor  23.45 
 
 		 977 aa  182  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 924 aa  182  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 929 aa  182  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2065  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 963 aa  181  5.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1125  TonB-dependent receptor plug  27.31 
 
 		 944 aa  181  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1940  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 1010 aa  180  9e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01579  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 889 aa  180  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.419044  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1888  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 906 aa  177  8e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0505133  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01879  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 938 aa  177  9e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  23.92 
 
 		 998 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1557  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 853 aa  174  5.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3880  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 901 aa  173  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000233231  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  24.28 
 
 		 892 aa  173  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0181  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 		 911 aa  173  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01881  TonB-dependent receptor  23.4 
 
 		 1016 aa  173  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.529383  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0914  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 987 aa  172  3e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2063  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 945 aa  169  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2831  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 1017 aa  167  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312768  hitchhiker  0.00196838 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02805  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 984 aa  165  3e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1603  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 990 aa  162  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  24.02 
 
 		 959 aa  162  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12613  normal  0.0122478 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1093  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 1158 aa  157  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000168671  normal  0.12204 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>