More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1125 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3177  TonB-dependent receptor plug  99.68 
 
 		 998 aa  1922    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0554366  normal  0.201208 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  41.19 
 
 		 994 aa  661    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1213  TonB-dependent receptor plug  99.79 
 
 		 998 aa  1924    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0027404  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1125  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 944 aa  1925    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1603  TonB-dependent receptor  41.21 
 
 		 990 aa  667    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1101  TonB-dependent receptor  40.9 
 
 		 1011 aa  662    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000197247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1180  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 998 aa  1927    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103368  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2831  TonB-dependent receptor  41.3 
 
 		 1017 aa  693    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312768  hitchhiker  0.00196838 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1144  TonB-dependent receptor  84.85 
 
 		 998 aa  1683    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.503724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4286  TonB-dependent receptor  49.95 
 
 		 1013 aa  888    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00048068  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02805  TonB-dependent receptor  44.89 
 
 		 984 aa  759    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  67.58 
 
 		 978 aa  1293    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0914  TonB-dependent receptor  40 
 
 		 987 aa  619  1e-175  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  38.91 
 
 		 986 aa  602  1.0000000000000001e-171  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3698  TonB-dependent receptor  38.38 
 
 		 961 aa  571  1e-161  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3278  TonB-dependent receptor  36.99 
 
 		 1006 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000542759  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  36.69 
 
 		 967 aa  521  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03790  TonB-dependent receptor  36.2 
 
 		 982 aa  512  1e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03792  TonB-dependent receptor  36.2 
 
 		 982 aa  512  1e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2610  TonB-dependent receptor  36.65 
 
 		 990 aa  500  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02198  TonB-dependent receptor  33.85 
 
 		 1048 aa  498  1e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  35.28 
 
 		 998 aa  484  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  35.02 
 
 		 920 aa  482  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1397  TonB-dependent receptor  34.76 
 
 		 1008 aa  474  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0795822  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  35.3 
 
 		 924 aa  473  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2694  TonB-dependent receptor  35.56 
 
 		 945 aa  469  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00189695  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1264  TonB-dependent receptor  34.43 
 
 		 923 aa  459  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000254862  unclonable  0.0000000223641 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  33.43 
 
 		 1035 aa  456  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  34.51 
 
 		 914 aa  427  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  33.1 
 
 		 1097 aa  420  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  32.7 
 
 		 958 aa  394  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2407  TonB-dependent receptor  30.21 
 
 		 984 aa  341  4e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000117567  normal  0.325532 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  30.56 
 
 		 919 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03903  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 1074 aa  335  2e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 961 aa  279  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  41.07 
 
 		 1109 aa  239  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 948 aa  237  8e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 894 aa  233  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  40.66 
 
 		 943 aa  223  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 964 aa  217  8e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 915 aa  214  3.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 918 aa  204  5e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 927 aa  194  6e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2995  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 933 aa  189  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 922 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 908 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2048  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 944 aa  174  7.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00100179  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1862  TonB-dependent receptor plug  25.59 
 
 		 947 aa  172  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.248067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 875 aa  171  7e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2502  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  24.25 
 
 		 968 aa  171  8e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0144507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01879  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 938 aa  170  9e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3426  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 902 aa  170  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0666258  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  24.85 
 
 		 908 aa  168  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0696  hypothetical protein  24.04 
 
 		 970 aa  168  5e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000664901  unclonable  0.0000000149874 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0993  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 946 aa  167  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.609458  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 881 aa  162  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2079  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 		 994 aa  159  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000280363  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3318  Outer membrane receptor proteins mostly Fe transport-like  26.04 
 
 		 954 aa  159  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0120017  decreased coverage  0.00000382692 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4091  outer membrane insertion C-terminal signal  23.76 
 
 		 919 aa  158  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3880  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 901 aa  158  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000233231  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2720  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 1009 aa  157  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.000000258905  normal  0.119134 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02628  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 967 aa  154  7e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3638  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 993 aa  154  8e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000344146  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  36.03 
 
 		 934 aa  151  6e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  33.66 
 
 		 951 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  33.66 
 
 		 951 aa  149  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 951 aa  147  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 943 aa  140  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1773  TonB-dependent receptor  34.02 
 
 		 1047 aa  139  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.133871  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  22.55 
 
 		 976 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1315  TonB-dependent receptor  22.57 
 
 		 988 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243965 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3075  TonB-dependent receptor  22.57 
 
 		 988 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179572 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  21.73 
 
 		 959 aa  135  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12613  normal  0.0122478 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  28.06 
 
 		 878 aa  135  5e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  38.55 
 
 		 859 aa  134  6e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  28.29 
 
 		 878 aa  134  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  28.29 
 
 		 878 aa  134  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  28.29 
 
 		 878 aa  134  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2991  hypothetical protein  23.72 
 
 		 1013 aa  132  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000283322  hitchhiker  0.000000325565 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  32.48 
 
 		 964 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  32.16 
 
 		 892 aa  129  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3650  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 1012 aa  127  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000400327  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  35.74 
 
 		 869 aa  127  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  32.41 
 
 		 1036 aa  126  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1136  TonB-dependent receptor  42.42 
 
 		 892 aa  125  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0253  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 1011 aa  124  9e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0016718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0952  ribosomal protein L17  32.98 
 
 		 906 aa  124  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000237948  hitchhiker  0.00000537684 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1940  TonB-dependent receptor  22.45 
 
 		 1010 aa  124  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0559  TonB dependent receptor-related protein  22.33 
 
 		 960 aa  122  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  30.3 
 
 		 908 aa  122  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  31.72 
 
 		 874 aa  122  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  22.28 
 
 		 941 aa  122  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  34.98 
 
 		 888 aa  121  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 887 aa  121  6e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1072  TonB-dependent receptor, plug  43.23 
 
 		 271 aa  121  6e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  33.56 
 
 		 870 aa  121  7e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  31.58 
 
 		 874 aa  121  7e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 887 aa  120  9e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1838  TonB-dependent receptor  29.57 
 
 		 979 aa  120  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.534381  hitchhiker  0.00298176 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  32.84 
 
 		 872 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>