220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1843 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1843  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1083 aa  2219    Caulobacter sp. K31  Bacteria  unclonable  0.0000000198025  decreased coverage  0.000327731 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2720  TonB-dependent receptor  39.21 
 
 		 1009 aa  727    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.000000258905  normal  0.119134 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1093  TonB-dependent receptor  35.98 
 
 		 1158 aa  629  1e-179  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000168671  normal  0.12204 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1289  TonB-dependent receptor  38.41 
 
 		 978 aa  594  1e-168  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.384181  normal  0.0181603 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2502  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  32.59 
 
 		 968 aa  434  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0144507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 880 aa  269  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 894 aa  229  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 915 aa  201  5e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  25.98 
 
 		 940 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2079  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 994 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000280363  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1386  hypothetical protein  24.49 
 
 		 1046 aa  186  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000408374  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 994 aa  181  5.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 1007 aa  174  9e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  30.05 
 
 		 881 aa  168  5.9999999999999996e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1508  TonB-dependent receptor  35.99 
 
 		 958 aa  159  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000651564  unclonable  0.0000000259897 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2137  TonB-dependent receptor  35.1 
 
 		 1013 aa  159  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255977  normal  0.143212 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  23.84 
 
 		 959 aa  155  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12613  normal  0.0122478 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  39.21 
 
 		 922 aa  152  5e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2288  peptidase M24A  41.04 
 
 		 927 aa  149  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000032845  unclonable  0.0000000380326 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  30.38 
 
 		 888 aa  142  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0914  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 987 aa  142  3.9999999999999997e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  34.98 
 
 		 951 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3318  Outer membrane receptor proteins mostly Fe transport-like  35 
 
 		 954 aa  139  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0120017  decreased coverage  0.00000382692 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  34.33 
 
 		 936 aa  139  4e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  34.33 
 
 		 936 aa  138  4e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  33.64 
 
 		 964 aa  137  8e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2242  TonB-dependent receptor  38.24 
 
 		 950 aa  137  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  34.86 
 
 		 951 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1838  TonB-dependent receptor  32.46 
 
 		 979 aa  136  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.534381  hitchhiker  0.00298176 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  36.69 
 
 		 927 aa  136  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  33.79 
 
 		 951 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 908 aa  135  5e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  41.08 
 
 		 945 aa  134  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  38.16 
 
 		 881 aa  134  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  33.56 
 
 		 961 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2048  TonB-dependent receptor  39.18 
 
 		 944 aa  132  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00100179  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  32.12 
 
 		 964 aa  132  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0696  hypothetical protein  31.27 
 
 		 970 aa  131  5.0000000000000004e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000664901  unclonable  0.0000000149874 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  37.84 
 
 		 900 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0741  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 918 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0701962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3638  TonB-dependent receptor  41.35 
 
 		 993 aa  129  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000344146  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  36.36 
 
 		 882 aa  128  5e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  33.23 
 
 		 948 aa  128  5e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  27.82 
 
 		 1109 aa  128  7e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 958 aa  128  7e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  35.68 
 
 		 874 aa  126  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 1035 aa  126  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2995  TonB-dependent receptor  32.8 
 
 		 933 aa  126  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 934 aa  125  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  36.79 
 
 		 870 aa  125  6e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  34.57 
 
 		 880 aa  124  7e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1018  outer membrane insertion C-terminal signal  28.88 
 
 		 918 aa  124  9e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0559  TonB dependent receptor-related protein  23.84 
 
 		 960 aa  124  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1862  TonB-dependent receptor plug  27.12 
 
 		 947 aa  124  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.248067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2065  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 963 aa  124  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  32.69 
 
 		 859 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 912 aa  122  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 921 aa  122  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 976 aa  122  3.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  31.88 
 
 		 914 aa  121  9e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 967 aa  121  9e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1603  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 990 aa  120  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  35.51 
 
 		 874 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 		 931 aa  120  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  36.54 
 
 		 869 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  34.68 
 
 		 892 aa  119  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 885 aa  119  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  31.02 
 
 		 918 aa  119  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  36.67 
 
 		 872 aa  119  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1773  TonB-dependent receptor  29.08 
 
 		 1047 aa  119  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.133871  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 1097 aa  119  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  36.19 
 
 		 888 aa  119  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 868 aa  118  5e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  30.98 
 
 		 875 aa  118  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 1036 aa  118  6e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 868 aa  118  6.9999999999999995e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2831  TonB-dependent receptor  32.37 
 
 		 1017 aa  118  6.9999999999999995e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312768  hitchhiker  0.00196838 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 845 aa  118  7.999999999999999e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3520  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 		 957 aa  117  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  36.04 
 
 		 887 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  34.27 
 
 		 874 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2652  3-dehydroquinate synthase  29.14 
 
 		 1210 aa  115  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000360118  normal  0.0199769 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 904 aa  116  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  28.36 
 
 		 878 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  28.36 
 
 		 878 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  28.36 
 
 		 878 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  35.53 
 
 		 887 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2123  TonB-dependent receptor  36.84 
 
 		 925 aa  115  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.154655 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2063  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 945 aa  115  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 924 aa  115  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0952  ribosomal protein L17  31.49 
 
 		 906 aa  114  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000237948  hitchhiker  0.00000537684 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  34.02 
 
 		 986 aa  114  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03867  TonB-dependent receptor  31.44 
 
 		 977 aa  114  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2142  TonB-dependent receptor  40.87 
 
 		 1034 aa  114  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.0000142845  normal  0.0159239 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0532  TonB-dependent receptor  31.18 
 
 		 936 aa  114  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0904706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  28.07 
 
 		 878 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2407  TonB-dependent receptor  31.78 
 
 		 984 aa  112  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000117567  normal  0.325532 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3650  TonB-dependent receptor  31.8 
 
 		 1012 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000400327  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4091  outer membrane insertion C-terminal signal  33.49 
 
 		 919 aa  111  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2542  TonB-dependent receptor  39.64 
 
 		 1048 aa  111  6e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000765383  decreased coverage  0.00000552533 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>