267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2142 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2137  TonB-dependent receptor  39.18 
 
 		 1013 aa  664    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255977  normal  0.143212 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2142  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1034 aa  2115    Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.0000142845  normal  0.0159239 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3939  TonB-dependent receptor  38.26 
 
 		 1017 aa  635  1e-180  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.719926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4006  TonB-dependent receptor  31.12 
 
 		 984 aa  427  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000010552  normal  0.168301 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1865  TonB-dependent receptor  41.24 
 
 		 573 aa  394  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2542  TonB-dependent receptor  31.29 
 
 		 1048 aa  174  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000765383  decreased coverage  0.00000552533 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  34.84 
 
 		 859 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  32.94 
 
 		 881 aa  135  5e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  33.92 
 
 		 892 aa  132  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  30.95 
 
 		 931 aa  132  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  31.62 
 
 		 927 aa  131  8.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  32.83 
 
 		 900 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2288  peptidase M24A  36.24 
 
 		 927 aa  130  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000032845  unclonable  0.0000000380326 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2063  TonB-dependent receptor  39.51 
 
 		 945 aa  130  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  29.76 
 
 		 1109 aa  130  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  34.42 
 
 		 881 aa  129  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  33.94 
 
 		 870 aa  128  6e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  40.32 
 
 		 880 aa  127  9e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  30.32 
 
 		 943 aa  127  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  33.94 
 
 		 869 aa  127  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 882 aa  125  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  35.66 
 
 		 978 aa  125  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3318  Outer membrane receptor proteins mostly Fe transport-like  34.84 
 
 		 954 aa  124  7e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0120017  decreased coverage  0.00000382692 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02628  TonB-dependent receptor  32.06 
 
 		 967 aa  124  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3818  TonB-dependent receptor  35.97 
 
 		 974 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.003378  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  31.63 
 
 		 958 aa  123  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0559  TonB dependent receptor-related protein  31.17 
 
 		 960 aa  123  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2502  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  31.21 
 
 		 968 aa  123  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0144507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 912 aa  122  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 921 aa  122  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  31.09 
 
 		 894 aa  122  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  35.02 
 
 		 964 aa  120  9e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0181  TonB-dependent receptor  31.48 
 
 		 911 aa  120  9e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4286  TonB-dependent receptor  37 
 
 		 1013 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00048068  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  32.97 
 
 		 887 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1101  TonB-dependent receptor  37.57 
 
 		 1011 aa  119  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000197247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3426  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 902 aa  119  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0666258  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  32.27 
 
 		 922 aa  118  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01881  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 		 1016 aa  118  5e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.529383  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  29.97 
 
 		 1035 aa  118  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  30.03 
 
 		 908 aa  118  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 1097 aa  118  6.9999999999999995e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  35.5 
 
 		 936 aa  118  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  32.61 
 
 		 887 aa  118  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  35.5 
 
 		 936 aa  118  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1136  TonB-dependent receptor  36.51 
 
 		 892 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  37.57 
 
 		 945 aa  117  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1018  outer membrane insertion C-terminal signal  29.65 
 
 		 918 aa  117  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 943 aa  117  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  32.73 
 
 		 874 aa  117  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  31.07 
 
 		 1036 aa  117  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  32.85 
 
 		 874 aa  115  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1787  TonB-dependent receptor  32.7 
 
 		 906 aa  116  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  33.21 
 
 		 914 aa  115  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1938  TonB-dependent receptor  32.26 
 
 		 971 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0886775  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  33.48 
 
 		 875 aa  115  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  41.62 
 
 		 845 aa  115  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 967 aa  114  6e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  31.95 
 
 		 880 aa  114  9e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1843  TonB-dependent receptor  40.87 
 
 		 1083 aa  114  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  unclonable  0.0000000198025  decreased coverage  0.000327731 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1888  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 906 aa  114  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0505133  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1773  TonB-dependent receptor  36.22 
 
 		 1047 aa  114  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.133871  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1180  TonB-dependent receptor plug  34.33 
 
 		 998 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103368  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1213  TonB-dependent receptor plug  34.33 
 
 		 998 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0027404  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2242  TonB-dependent receptor  40.35 
 
 		 950 aa  114  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  32.78 
 
 		 888 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1508  TonB-dependent receptor  31.43 
 
 		 958 aa  113  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000651564  unclonable  0.0000000259897 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  30.62 
 
 		 908 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2610  TonB-dependent receptor  30.56 
 
 		 990 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1072  TonB-dependent receptor, plug  40.1 
 
 		 271 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2048  TonB-dependent receptor  37.5 
 
 		 944 aa  112  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00100179  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0741  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 918 aa  112  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0701962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3177  TonB-dependent receptor plug  33.91 
 
 		 998 aa  112  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0554366  normal  0.201208 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  32.78 
 
 		 874 aa  112  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 908 aa  112  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  34.57 
 
 		 964 aa  112  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  30.82 
 
 		 994 aa  111  7.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  31.93 
 
 		 986 aa  111  7.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  32.78 
 
 		 872 aa  111  7.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  30.03 
 
 		 948 aa  110  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1093  TonB-dependent receptor  35.02 
 
 		 1158 aa  110  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000168671  normal  0.12204 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  37.5 
 
 		 918 aa  110  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  34.68 
 
 		 951 aa  109  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  30.65 
 
 		 908 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2735  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 		 921 aa  110  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.692321  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 		 919 aa  109  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  34.68 
 
 		 951 aa  110  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  34.68 
 
 		 951 aa  110  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  30.65 
 
 		 908 aa  109  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1603  TonB-dependent receptor  37.38 
 
 		 990 aa  108  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  30.65 
 
 		 908 aa  108  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2162  tonB dependent receptor-related protein  28.32 
 
 		 836 aa  108  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1289  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 978 aa  108  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.384181  normal  0.0181603 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2123  TonB-dependent receptor  34.68 
 
 		 925 aa  108  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.154655 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1264  TonB-dependent receptor  35.39 
 
 		 923 aa  108  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000254862  unclonable  0.0000000223641 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 875 aa  108  7e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2995  TonB-dependent receptor  37.67 
 
 		 933 aa  107  9e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2079  TonB-dependent receptor  36.81 
 
 		 994 aa  107  9e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000280363  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  34.25 
 
 		 878 aa  107  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3520  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 957 aa  107  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>