197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1865 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2137  TonB-dependent receptor  99.65 
 
 		 1013 aa  1173    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255977  normal  0.143212 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1865  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 573 aa  1170    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2142  TonB-dependent receptor  40.88 
 
 		 1034 aa  388  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.0000142845  normal  0.0159239 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4006  TonB-dependent receptor  36.97 
 
 		 984 aa  343  7e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000010552  normal  0.168301 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3939  TonB-dependent receptor  34.39 
 
 		 1017 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.719926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2542  TonB-dependent receptor  29.15 
 
 		 1048 aa  183  6e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000765383  decreased coverage  0.00000552533 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  29.08 
 
 		 859 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  30.68 
 
 		 894 aa  139  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 951 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 951 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 951 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 927 aa  130  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3520  TonB-dependent receptor  32.92 
 
 		 957 aa  130  7.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 881 aa  128  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 929 aa  128  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 875 aa  127  5e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 915 aa  125  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  31.34 
 
 		 1097 aa  125  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  29.78 
 
 		 1109 aa  125  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3426  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 902 aa  122  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0666258  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 880 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 918 aa  118  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 885 aa  117  5e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 931 aa  117  6e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2079  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 994 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000280363  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 921 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 912 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  27.81 
 
 		 878 aa  115  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  27.81 
 
 		 878 aa  115  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  27.81 
 
 		 878 aa  115  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  30.54 
 
 		 958 aa  114  4.0000000000000004e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1289  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 978 aa  114  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.384181  normal  0.0181603 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  27.81 
 
 		 878 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 976 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 888 aa  113  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 892 aa  113  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2407  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 984 aa  112  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000117567  normal  0.325532 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1888  TonB-dependent receptor, plug  26.65 
 
 		 942 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 939 aa  111  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 939 aa  111  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1787  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 906 aa  111  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 908 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 908 aa  110  8.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0741  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 918 aa  110  8.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0701962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2288  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 940 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  26.65 
 
 		 940 aa  110  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  26.7 
 
 		 908 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  25.05 
 
 		 922 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 904 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 948 aa  108  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2995  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 933 aa  108  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 908 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2063  TonB-dependent receptor  31.41 
 
 		 945 aa  107  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  26.7 
 
 		 908 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  25.34 
 
 		 908 aa  107  8e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0181  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 911 aa  106  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  27.29 
 
 		 941 aa  106  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 934 aa  105  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0253  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 1011 aa  105  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0016718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 914 aa  104  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 887 aa  104  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 887 aa  103  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 874 aa  103  9e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 882 aa  103  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 874 aa  102  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 961 aa  101  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1018  outer membrane insertion C-terminal signal  27.42 
 
 		 918 aa  100  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 881 aa  100  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0887  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 1236 aa  99  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00309149  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1508  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 958 aa  97.8  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000651564  unclonable  0.0000000259897 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2242  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 950 aa  97.4  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1843  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 1083 aa  97.1  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  unclonable  0.0000000198025  decreased coverage  0.000327731 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 943 aa  95.9  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 869 aa  95.5  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0559  TonB dependent receptor-related protein  25.83 
 
 		 960 aa  95.5  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01579  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 889 aa  94.7  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.419044  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 943 aa  94.4  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 920 aa  94.4  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 874 aa  94.4  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 900 aa  94  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 880 aa  94  7e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 872 aa  93.2  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1315  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 988 aa  92.8  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243965 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  24.94 
 
 		 986 aa  92.8  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 870 aa  92  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1264  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 923 aa  92  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000254862  unclonable  0.0000000223641 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3880  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 901 aa  92.8  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000233231  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 888 aa  92.4  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 936 aa  92.8  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 936 aa  92.4  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 1036 aa  92  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01881  TonB-dependent receptor  23.24 
 
 		 1016 aa  92  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.529383  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 926 aa  91.3  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3075  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 988 aa  91.7  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179572 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1557  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 853 aa  91.3  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2123  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 925 aa  90.9  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.154655 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3638  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 993 aa  90.5  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000344146  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04960  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 842 aa  90.5  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143885  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 868 aa  90.1  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 868 aa  89  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>