230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01881 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  59.06 
 
 		 1007 aa  1202    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2162  tonB dependent receptor-related protein  44.58 
 
 		 836 aa  710    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  46.59 
 
 		 940 aa  839    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0559  TonB dependent receptor-related protein  56.76 
 
 		 960 aa  1155    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1315  TonB-dependent receptor  58.62 
 
 		 988 aa  1190    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243965 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1888  TonB-dependent receptor, plug  46.39 
 
 		 942 aa  831    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1940  TonB-dependent receptor  68.09 
 
 		 1010 aa  1399    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  45.34 
 
 		 939 aa  835    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3075  TonB-dependent receptor  58.62 
 
 		 988 aa  1189    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179572 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  45.24 
 
 		 939 aa  832    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2288  TonB-dependent receptor  46.12 
 
 		 940 aa  848    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  45.06 
 
 		 941 aa  835    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  61.27 
 
 		 976 aa  1213    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01881  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1016 aa  2062    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.529383  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  35.78 
 
 		 959 aa  542  9.999999999999999e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12613  normal  0.0122478 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  31.75 
 
 		 908 aa  386  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4482  hypothetical protein  61.61 
 
 		 312 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  31.35 
 
 		 908 aa  379  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  31.35 
 
 		 908 aa  380  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  31.35 
 
 		 908 aa  379  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  30.62 
 
 		 908 aa  365  2e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1787  TonB-dependent receptor  31.09 
 
 		 906 aa  364  6e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  30.51 
 
 		 908 aa  357  3.9999999999999996e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  29.9 
 
 		 912 aa  354  4e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 921 aa  354  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  30.1 
 
 		 885 aa  351  5e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4091  outer membrane insertion C-terminal signal  29.46 
 
 		 919 aa  328  3e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2735  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 921 aa  310  5.9999999999999995e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.692321  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1018  outer membrane insertion C-terminal signal  28.57 
 
 		 918 aa  300  8e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0181  TonB-dependent receptor  30.23 
 
 		 911 aa  295  4e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2063  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 945 aa  276  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154815  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0993  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 946 aa  275  4.0000000000000004e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.609458  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 943 aa  271  4e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 915 aa  266  1e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02628  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 967 aa  261  4e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 961 aa  253  9.000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0696  hypothetical protein  26.14 
 
 		 970 aa  244  5e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000664901  unclonable  0.0000000149874 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 951 aa  241  6.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 951 aa  239  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 951 aa  238  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 904 aa  237  7e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 948 aa  231  4e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 919 aa  231  7e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3638  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 993 aa  230  8e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000344146  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 918 aa  230  1e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01879  TonB-dependent receptor  31.55 
 
 		 938 aa  229  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3880  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 901 aa  220  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000233231  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 1097 aa  219  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1508  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 958 aa  219  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000651564  unclonable  0.0000000259897 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0253  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 		 1011 aa  208  4e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0016718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 934 aa  207  9e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2502  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  25.05 
 
 		 968 aa  205  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0144507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2991  hypothetical protein  24.48 
 
 		 1013 aa  204  9e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000283322  hitchhiker  0.000000325565 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1888  TonB-dependent receptor  32.91 
 
 		 906 aa  196  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0505133  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  23.5 
 
 		 967 aa  195  5e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  24.1 
 
 		 994 aa  185  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  23.65 
 
 		 922 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 		 875 aa  180  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 		 927 aa  178  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3939  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 1017 aa  177  6e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.719926  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 845 aa  176  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  24.35 
 
 		 914 aa  176  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0321  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 934 aa  176  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0815676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1938  TonB-dependent receptor  35.28 
 
 		 971 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0886775  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  24.38 
 
 		 998 aa  174  5.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4286  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 1013 aa  172  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00048068  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0866  TonB-dependent receptor  33.53 
 
 		 924 aa  171  8e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0741  TonB-dependent receptor  22.46 
 
 		 918 aa  167  9e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0701962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3818  TonB-dependent receptor  31.97 
 
 		 974 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.003378  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  23.97 
 
 		 978 aa  163  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2720  TonB-dependent receptor  23.67 
 
 		 1009 aa  162  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.000000258905  normal  0.119134 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  23 
 
 		 892 aa  162  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3177  TonB-dependent receptor plug  23.15 
 
 		 998 aa  162  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0554366  normal  0.201208 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1213  TonB-dependent receptor plug  23.06 
 
 		 998 aa  162  4e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0027404  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 881 aa  161  6e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1180  TonB-dependent receptor plug  23.06 
 
 		 998 aa  161  7e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103368  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 894 aa  154  8e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3698  TonB-dependent receptor  23.22 
 
 		 961 aa  151  7e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  23.09 
 
 		 936 aa  148  5e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  23 
 
 		 936 aa  147  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  22.79 
 
 		 924 aa  145  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1125  TonB-dependent receptor plug  22.89 
 
 		 944 aa  143  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2065  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 963 aa  141  4.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3426  TonB-dependent receptor  23.26 
 
 		 902 aa  141  7e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0666258  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  30.21 
 
 		 986 aa  140  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 958 aa  140  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  23.05 
 
 		 945 aa  140  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2048  TonB-dependent receptor  22.67 
 
 		 944 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00100179  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  33.22 
 
 		 964 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2111  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 		 917 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2242  TonB-dependent receptor  23.42 
 
 		 950 aa  130  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 943 aa  129  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 1035 aa  127  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 859 aa  126  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  34.73 
 
 		 900 aa  126  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0887  TonB-dependent receptor  31 
 
 		 1236 aa  124  9e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00309149  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  28.65 
 
 		 1109 aa  123  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  36.63 
 
 		 882 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0952  ribosomal protein L17  28.06 
 
 		 906 aa  122  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000237948  hitchhiker  0.00000537684 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03792  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 982 aa  122  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>