More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4375 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 998 aa  2023    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03792  TonB-dependent receptor  57.68 
 
 		 982 aa  1165    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03790  TonB-dependent receptor  57.68 
 
 		 982 aa  1165    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  38.81 
 
 		 967 aa  678    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1397  TonB-dependent receptor  73.31 
 
 		 1008 aa  1529    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0795822  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2610  TonB-dependent receptor  36.67 
 
 		 990 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  36.5 
 
 		 994 aa  594  1e-168  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1144  TonB-dependent receptor  36.54 
 
 		 998 aa  543  1e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.503724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3177  TonB-dependent receptor plug  35.97 
 
 		 998 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0554366  normal  0.201208 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1180  TonB-dependent receptor plug  35.78 
 
 		 998 aa  534  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103368  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1213  TonB-dependent receptor plug  35.78 
 
 		 998 aa  532  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0027404  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  35.05 
 
 		 986 aa  523  1e-147  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02805  TonB-dependent receptor  35.34 
 
 		 984 aa  520  1e-146  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  35.47 
 
 		 978 aa  516  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2831  TonB-dependent receptor  34.27 
 
 		 1017 aa  511  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312768  hitchhiker  0.00196838 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1603  TonB-dependent receptor  34.11 
 
 		 990 aa  501  1e-140  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2694  TonB-dependent receptor  34.04 
 
 		 945 aa  491  1e-137  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00189695  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4286  TonB-dependent receptor  34.29 
 
 		 1013 aa  491  1e-137  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00048068  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1125  TonB-dependent receptor plug  34.97 
 
 		 944 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  34.24 
 
 		 920 aa  482  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  33.56 
 
 		 1097 aa  481  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  32.97 
 
 		 924 aa  473  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3698  TonB-dependent receptor  34.06 
 
 		 961 aa  457  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0914  TonB-dependent receptor  33.14 
 
 		 987 aa  458  1e-127  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3278  TonB-dependent receptor  33.49 
 
 		 1006 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000542759  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  32.48 
 
 		 1035 aa  444  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  33.69 
 
 		 943 aa  438  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  32.69 
 
 		 958 aa  437  1e-121  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  31.97 
 
 		 1109 aa  431  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02198  TonB-dependent receptor  30.95 
 
 		 1048 aa  416  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  30.65 
 
 		 914 aa  395  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1101  TonB-dependent receptor  30.17 
 
 		 1011 aa  390  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000197247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 919 aa  371  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2407  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 984 aa  348  3e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000117567  normal  0.325532 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03903  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 1074 aa  342  1e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 951 aa  290  1e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 951 aa  287  7e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  28.56 
 
 		 948 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 951 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 894 aa  265  4e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 961 aa  263  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 859 aa  254  7e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 915 aa  240  9e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1264  TonB-dependent receptor  36.45 
 
 		 923 aa  239  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000254862  unclonable  0.0000000223641 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01879  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 938 aa  224  9e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 927 aa  201  5e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2079  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 994 aa  194  5e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000280363  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02628  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 967 aa  193  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0952  ribosomal protein L17  26.14 
 
 		 906 aa  192  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000237948  hitchhiker  0.00000537684 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0321  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 934 aa  189  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0815676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2502  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  24.43 
 
 		 968 aa  189  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0144507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  26.11 
 
 		 908 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  26.19 
 
 		 908 aa  185  4.0000000000000006e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 908 aa  184  6e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  24.57 
 
 		 940 aa  184  7e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  26.08 
 
 		 908 aa  183  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  34.8 
 
 		 934 aa  182  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04315  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 838 aa  179  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3880  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 901 aa  179  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000233231  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2288  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 940 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 		 939 aa  178  6e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 		 939 aa  177  6e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 922 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3520  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 957 aa  174  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  24.09 
 
 		 941 aa  173  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 945 aa  172  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3318  Outer membrane receptor proteins mostly Fe transport-like  23.88 
 
 		 954 aa  171  5e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0120017  decreased coverage  0.00000382692 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01881  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 		 1016 aa  171  6e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.529383  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 908 aa  171  6e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4091  outer membrane insertion C-terminal signal  24.53 
 
 		 919 aa  169  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 976 aa  165  4.0000000000000004e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1940  TonB-dependent receptor  23.42 
 
 		 1010 aa  164  8.000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  34.2 
 
 		 875 aa  161  5e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  32.76 
 
 		 892 aa  161  7e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2652  3-dehydroquinate synthase  32.48 
 
 		 1210 aa  158  5.0000000000000005e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000360118  normal  0.0199769 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  38.89 
 
 		 882 aa  158  6e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  23.18 
 
 		 904 aa  157  8e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  22.67 
 
 		 1007 aa  157  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2162  tonB dependent receptor-related protein  24.06 
 
 		 836 aa  156  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  39.66 
 
 		 887 aa  156  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  32.74 
 
 		 869 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  39.24 
 
 		 887 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  37.02 
 
 		 900 aa  155  5e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  38.31 
 
 		 870 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  38.03 
 
 		 881 aa  154  8.999999999999999e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1966  TonB-dependent receptor  31.06 
 
 		 1240 aa  154  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00321927  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  32.7 
 
 		 964 aa  152  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  33.23 
 
 		 874 aa  150  8e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  32.81 
 
 		 888 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  38.37 
 
 		 872 aa  150  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  32.47 
 
 		 874 aa  150  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2288  peptidase M24A  22.71 
 
 		 927 aa  149  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000032845  unclonable  0.0000000380326 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0559  TonB dependent receptor-related protein  22.36 
 
 		 960 aa  149  4.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1136  TonB-dependent receptor  41.63 
 
 		 892 aa  148  5e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  32.3 
 
 		 964 aa  148  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  36.99 
 
 		 874 aa  147  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 880 aa  147  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1773  TonB-dependent receptor  31.15 
 
 		 1047 aa  147  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.133871  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1072  TonB-dependent receptor, plug  41.63 
 
 		 271 aa  146  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1888  TonB-dependent receptor  23.57 
 
 		 906 aa  145  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0505133  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>