245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2312 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  50.74 
 
 		 976 aa  882    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  47.89 
 
 		 1007 aa  885    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  84.29 
 
 		 940 aa  1648    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2162  tonB dependent receptor-related protein  92.84 
 
 		 836 aa  1600    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0559  TonB dependent receptor-related protein  47.75 
 
 		 960 aa  846    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1888  TonB-dependent receptor, plug  81.14 
 
 		 942 aa  1590    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2288  TonB-dependent receptor  90.76 
 
 		 940 aa  1773    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3075  TonB-dependent receptor  49.36 
 
 		 988 aa  872    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179572 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1940  TonB-dependent receptor  48.38 
 
 		 1010 aa  884    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01881  TonB-dependent receptor  45.06 
 
 		 1016 aa  827    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.529383  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1315  TonB-dependent receptor  49.36 
 
 		 988 aa  872    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243965 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  96.71 
 
 		 939 aa  1855    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  96.81 
 
 		 939 aa  1857    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  100 
 
 		 941 aa  1911    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  37.9 
 
 		 959 aa  575  1.0000000000000001e-162  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12613  normal  0.0122478 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4482  hypothetical protein  94.59 
 
 		 312 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  33.98 
 
 		 908 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  33.98 
 
 		 908 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  33.88 
 
 		 908 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  33.91 
 
 		 908 aa  426  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1787  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 906 aa  424  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  32.42 
 
 		 921 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  32.32 
 
 		 912 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  32.92 
 
 		 885 aa  400  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  32.22 
 
 		 908 aa  398  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4091  outer membrane insertion C-terminal signal  32.88 
 
 		 919 aa  380  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1018  outer membrane insertion C-terminal signal  30.68 
 
 		 918 aa  371  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  30.91 
 
 		 908 aa  353  1e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2735  TonB-dependent receptor  30.4 
 
 		 921 aa  341  4e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.692321  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  30.5 
 
 		 943 aa  340  5e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01879  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 938 aa  335  2e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0866  TonB-dependent receptor  30.15 
 
 		 924 aa  329  1.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2063  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 945 aa  330  1.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154815  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0993  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 		 946 aa  320  7.999999999999999e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.609458  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1888  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 906 aa  310  9e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0505133  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0181  TonB-dependent receptor  29.86 
 
 		 911 aa  306  1.0000000000000001e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02628  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 967 aa  300  1e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 915 aa  285  2.0000000000000002e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1938  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 971 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0886775  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 894 aa  282  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 904 aa  278  3e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3880  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 901 aa  262  2e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000233231  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 961 aa  250  7e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 951 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 918 aa  246  1.9999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 951 aa  244  5e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 951 aa  243  9e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1508  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 958 aa  238  3e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000651564  unclonable  0.0000000259897 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2502  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  28.32 
 
 		 968 aa  238  3e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0144507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2991  hypothetical protein  26.54 
 
 		 1013 aa  238  6e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000283322  hitchhiker  0.000000325565 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 948 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0696  hypothetical protein  27.22 
 
 		 970 aa  232  3e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000664901  unclonable  0.0000000149874 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 875 aa  228  3e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0253  TonB-dependent receptor  25.02 
 
 		 1011 aa  213  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0016718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 922 aa  212  3e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4006  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 984 aa  211  4e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000010552  normal  0.168301 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 964 aa  210  9e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1386  hypothetical protein  24.71 
 
 		 1046 aa  209  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000408374  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 845 aa  208  4e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 881 aa  208  5e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 929 aa  205  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 859 aa  204  7e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2079  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 994 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000280363  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 880 aa  202  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  27.08 
 
 		 878 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2720  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 1009 aa  201  7e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.000000258905  normal  0.119134 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3638  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 993 aa  200  7.999999999999999e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000344146  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  26.98 
 
 		 878 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 900 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2995  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 933 aa  199  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 882 aa  197  8.000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  25.39 
 
 		 986 aa  197  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 931 aa  197  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  24.23 
 
 		 994 aa  195  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2137  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 1013 aa  195  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255977  normal  0.143212 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 887 aa  195  4e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0741  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 918 aa  194  6e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0701962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 881 aa  192  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1289  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 978 aa  191  5e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.384181  normal  0.0181603 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 887 aa  191  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 874 aa  191  8e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 967 aa  187  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 919 aa  185  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3818  TonB-dependent receptor  35.2 
 
 		 974 aa  181  4.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.003378  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3939  TonB-dependent receptor  25.05 
 
 		 1017 aa  181  7e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.719926  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2159  TonB domain-containing protein  86.87 
 
 		 99 aa  180  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 1097 aa  179  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2542  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 1048 aa  179  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000765383  decreased coverage  0.00000552533 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 892 aa  178  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 958 aa  178  5e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  23.49 
 
 		 927 aa  175  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  24.09 
 
 		 998 aa  173  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0532  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 936 aa  173  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0904706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3520  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 957 aa  172  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2407  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 984 aa  172  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000117567  normal  0.325532 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0321  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 934 aa  169  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0815676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 868 aa  169  2.9999999999999998e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03792  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 982 aa  169  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03790  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 982 aa  169  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 868 aa  168  4e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>