More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4071 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1669  TonB-dependent receptor plug  43.27 
 
 		 823 aa  656    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.306127 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4071  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 792 aa  1614    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3755  tonB-linked outer membrane receptor P92  33.92 
 
 		 799 aa  397  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4269  TonB-dependent receptor, plug  32.36 
 
 		 797 aa  395  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  32.92 
 
 		 798 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0259  TonB-linked outer membrane receptor  33.59 
 
 		 782 aa  377  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2516  TonB-dependent receptor plug  32.83 
 
 		 772 aa  376  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  30.79 
 
 		 791 aa  372  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0621  TonB-dependent receptor plug  33.52 
 
 		 713 aa  352  1e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  30.5 
 
 		 788 aa  314  3.9999999999999997e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0688  TonB-dependent receptor plug  28.61 
 
 		 1117 aa  288  2.9999999999999996e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3315  TonB-dependent receptor, plug  29.47 
 
 		 781 aa  276  1.0000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5346  TonB-dependent receptor plug  27.74 
 
 		 763 aa  265  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04095  putative TonB-linked outer membrane receptor  26.75 
 
 		 767 aa  244  6e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.221249  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2028  TonB family protein  25.71 
 
 		 960 aa  241  4e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.38309 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  26.97 
 
 		 750 aa  87.4  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3613  TonB-dependent receptor plug  26.44 
 
 		 664 aa  86.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659898  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3545  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 666 aa  86.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3462  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 668 aa  84  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 760 aa  83.2  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  29.63 
 
 		 795 aa  79.7  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 		 757 aa  79.3  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  27.8 
 
 		 753 aa  78.6  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  30.47 
 
 		 814 aa  78.6  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  27.5 
 
 		 848 aa  77.8  0.0000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  28.94 
 
 		 613 aa  77.4  0.0000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  29.32 
 
 		 988 aa  77.4  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4648  TonB-dependent receptor  35.04 
 
 		 653 aa  75.5  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  27.98 
 
 		 783 aa  75.9  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2398  TonB-dependent receptor plug  27.03 
 
 		 932 aa  74.3  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  31.76 
 
 		 597 aa  73.9  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  32.64 
 
 		 736 aa  73.6  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  24.18 
 
 		 748 aa  73.9  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 987 aa  73.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  27.56 
 
 		 776 aa  72.8  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  32.62 
 
 		 628 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  27.54 
 
 		 614 aa  72  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2165  TonB-dependent vitamin B12 receptor  31.91 
 
 		 616 aa  71.2  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.63 
 
 		 631 aa  70.5  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1826  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 621 aa  70.1  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568285  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 763 aa  70.5  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  29.87 
 
 		 642 aa  70.1  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0744  TonB-dependent receptor plug  30.1 
 
 		 1088 aa  69.7  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  34.12 
 
 		 638 aa  68.9  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.27 
 
 		 631 aa  68.9  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0558  TonB-dependent receptor plug  26.64 
 
 		 817 aa  69.3  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000727933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  30.77 
 
 		 617 aa  68.9  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  29.6 
 
 		 1028 aa  68.6  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  28.38 
 
 		 1082 aa  68.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  29.22 
 
 		 620 aa  67.8  0.0000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0790  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 		 614 aa  67  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.270148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0963  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 614 aa  67  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  27.78 
 
 		 646 aa  66.2  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0336  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 649 aa  66.2  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  23.48 
 
 		 1023 aa  66.6  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2789  TonB-dependent receptor  31.79 
 
 		 698 aa  66.2  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.973502 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  23.05 
 
 		 1004 aa  66.6  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  33.1 
 
 		 743 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  30 
 
 		 697 aa  66.2  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 836 aa  65.5  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0363  TonB-dependent receptor plug  24.56 
 
 		 649 aa  65.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  27.42 
 
 		 1059 aa  65.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3320  TonB-dependent siderophore receptor  25.51 
 
 		 807 aa  65.9  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.23 
 
 		 631 aa  65.9  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  29.75 
 
 		 673 aa  65.1  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6077  TonB-dependent receptor plug  31.13 
 
 		 656 aa  65.5  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 624 aa  65.1  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4020  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.94 
 
 		 615 aa  65.1  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000194494  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  30.58 
 
 		 804 aa  65.1  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4119  TonB-dependent vitamin B12 receptor  25.16 
 
 		 616 aa  64.7  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7219  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 698 aa  64.7  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1905  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 713 aa  64.7  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.86655  normal  0.425592 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  28.83 
 
 		 638 aa  64.7  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  32.06 
 
 		 618 aa  64.7  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 619 aa  64.3  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2720  iron complex outermembrane recepter protein  24.43 
 
 		 631 aa  64.3  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83965  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  25.68 
 
 		 1081 aa  64.3  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0635  TonB-dependent receptor  30.23 
 
 		 720 aa  64.3  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00167095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0569  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 		 778 aa  64.3  0.000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.147079 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  23.66 
 
 		 791 aa  64.3  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1797  TonB-dependent receptor plug  29.03 
 
 		 647 aa  63.5  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2621  TonB-dependent receptor, plug  25.78 
 
 		 695 aa  63.5  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3318  TonB-dependent receptor  29.46 
 
 		 720 aa  63.9  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000715438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0350  TonB-dependent receptor  23.6 
 
 		 651 aa  63.5  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.513607  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  22.69 
 
 		 616 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  26.04 
 
 		 617 aa  63.9  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3191  TonB-dependent receptor  32.11 
 
 		 720 aa  63.9  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0126534  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5776  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 779 aa  62.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  28.41 
 
 		 1051 aa  62.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6730  TonB-dependent receptor  21.33 
 
 		 733 aa  62.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.23656 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2402  putative TonB dependent vitamin B12 outer membrane receptor  30.71 
 
 		 611 aa  63.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  24.42 
 
 		 653 aa  62.8  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 682 aa  63.2  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  28.35 
 
 		 1169 aa  62.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  29.71 
 
 		 702 aa  63.5  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  30.11 
 
 		 732 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1065  TonB-dependent receptor  30.71 
 
 		 611 aa  63.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.362217 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  31.01 
 
 		 830 aa  63.5  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  27.08 
 
 		 805 aa  63.2  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  29.31 
 
 		 1168 aa  63.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>