60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1654 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1654  hypothetical protein  100 
 
 		 879 aa  1794    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648752  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0441  hypothetical protein  25.14 
 
 		 877 aa  203  9.999999999999999e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.177581 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1485  hypothetical protein  30.9 
 
 		 895 aa  109  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10578  hypothetical protein  31.69 
 
 		 915 aa  108  5e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392635  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1493  hypothetical protein  29.2 
 
 		 891 aa  99  4e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.208362 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2379  hypothetical protein  29.79 
 
 		 921 aa  90.9  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3443  hypothetical protein  27 
 
 		 952 aa  90.5  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0241  hypothetical protein  26.7 
 
 		 929 aa  87.8  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0416678  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0696  hypothetical protein  27.11 
 
 		 961 aa  84.3  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1136  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 998 aa  84  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028233  normal  0.759049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2202  hypothetical protein  27.59 
 
 		 872 aa  82.4  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898839  hitchhiker  0.0000000204657 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4088  hypothetical protein  33.33 
 
 		 847 aa  81.6  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715502 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0733  hypothetical protein  29.21 
 
 		 904 aa  80.9  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1715  hypothetical protein  27.14 
 
 		 887 aa  78.2  0.0000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1397  hypothetical protein  28.88 
 
 		 995 aa  77.8  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0243953 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2796  hypothetical protein  27.59 
 
 		 936 aa  77.4  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03085  hypothetical protein  26.63 
 
 		 924 aa  77.4  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882894  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5348  hypothetical protein  25.54 
 
 		 946 aa  76.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1880  hypothetical protein  23.28 
 
 		 920 aa  74.7  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0095  hypothetical protein  25 
 
 		 944 aa  70.1  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0205  hypothetical protein  24.69 
 
 		 930 aa  63.2  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6640  hypothetical protein  29.66 
 
 		 946 aa  61.6  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5762  hypothetical protein  26.98 
 
 		 965 aa  59.7  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  26.42 
 
 		 806 aa  58.2  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2270  hypothetical protein  25.74 
 
 		 929 aa  57.8  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 798 aa  55.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2981  TonB-dependent receptor plug  25.33 
 
 		 816 aa  55.1  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.733063 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0821  TonB-dependent receptor  32.41 
 
 		 929 aa  54.7  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4827  TonB-dependent receptor, plug  24.66 
 
 		 748 aa  54.3  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  29.1 
 
 		 1063 aa  54.3  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2584  hypothetical protein  25.63 
 
 		 926 aa  53.9  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323052  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  26.26 
 
 		 804 aa  53.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  30.32 
 
 		 1074 aa  52.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01250  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 		 882 aa  52.4  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 822 aa  51.2  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  24.5 
 
 		 805 aa  50.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6368  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 		 1065 aa  50.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  26.44 
 
 		 818 aa  50.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2516  TonB-dependent receptor plug  23.39 
 
 		 772 aa  49.3  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5130  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 810 aa  48.5  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  29.14 
 
 		 952 aa  48.5  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  26.29 
 
 		 788 aa  48.1  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4856  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 		 819 aa  48.1  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163752 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6466  TonB-dependent receptor plug  27.52 
 
 		 1147 aa  47.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000431216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0330  TonB-dependent outer membrane receptor precursor  26.43 
 
 		 1041 aa  47  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000673436  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  27.56 
 
 		 1063 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  24.12 
 
 		 814 aa  47  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3601  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 		 1090 aa  47  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000169408  hitchhiker  0.00028286 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0815  hypothetical protein  28.8 
 
 		 457 aa  46.6  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0109394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  23.33 
 
 		 817 aa  46.2  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4975  TonB-dependent receptor plug  26.47 
 
 		 1055 aa  45.8  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.416467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1572  TonB-dependent receptor  31.43 
 
 		 780 aa  45.8  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0693034  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0004  TonB-dependent receptor plug  26.14 
 
 		 1130 aa  45.4  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  27.54 
 
 		 988 aa  45.4  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  34.83 
 
 		 1139 aa  45.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2894  TonB-dependent receptor, plug  26.09 
 
 		 1237 aa  45.1  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.403551  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  23.28 
 
 		 805 aa  45.1  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7043  TonB-dependent receptor plug  27.81 
 
 		 1189 aa  45.1  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2740  TonB-dependent receptor plug  29.7 
 
 		 725 aa  44.7  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  28.93 
 
 		 1040 aa  44.3  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>