More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0821 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0821  TonB-dependent receptor  100 
 
 
929 aa  1905    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3725  TonB-dependent receptor  39.81 
 
 
918 aa  602  1e-170  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0163504  normal  0.0922435 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0236  TonB-dependent receptor  34.06 
 
 
958 aa  529  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3882  TonB-dependent receptor plug  34.37 
 
 
1027 aa  525  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0857894  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5066  TonB-dependent receptor plug  35.21 
 
 
1001 aa  519  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000778295  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4475  TonB-dependent receptor  32.19 
 
 
955 aa  417  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6142  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 
857 aa  384  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.283964  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4133  TonB-dependent receptor  30.44 
 
 
850 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.882317  normal  0.0172602 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3310  TonB-dependent receptor  33.86 
 
 
971 aa  298  5e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.183606 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5117  TonB-dependent receptor  23.25 
 
 
801 aa  175  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.820743 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2201  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 
893 aa  108  7e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  29.26 
 
 
989 aa  92.4  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  28.89 
 
 
1058 aa  90.5  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  29.31 
 
 
1082 aa  89.7  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  27.39 
 
 
874 aa  88.2  6e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  26.64 
 
 
747 aa  87.8  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  33.47 
 
 
1035 aa  87.4  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 
1008 aa  87.4  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  31.68 
 
 
760 aa  87.4  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  28.94 
 
 
1021 aa  86.3  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4474  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 
855 aa  86.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.18025  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  30.33 
 
 
1004 aa  85.5  0.000000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01250  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 
882 aa  85.5  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1887  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 
848 aa  85.9  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5648  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 
1041 aa  85.5  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11498  putative outer membrane protein  31.2 
 
 
1018 aa  85.1  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  28.79 
 
 
1059 aa  85.1  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  29.79 
 
 
1025 aa  84.3  0.000000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  30.74 
 
 
1030 aa  84  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  29.52 
 
 
1074 aa  84.3  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  29.6 
 
 
1046 aa  83.2  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 
873 aa  83.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  30.38 
 
 
1062 aa  83.2  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  29.64 
 
 
1008 aa  83.6  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  30.21 
 
 
1002 aa  82.4  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1518  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 
854 aa  81.6  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  27.65 
 
 
1019 aa  81.6  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1702  TonB-dependent receptor plug  28.61 
 
 
1016 aa  81.3  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.784403 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0274  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 
1083 aa  81.3  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.302704 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0277  TonB-dependent receptor plug  31.42 
 
 
1096 aa  80.9  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.97163  normal  0.971813 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  29.88 
 
 
1064 aa  80.9  0.00000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04165  outer membrane protein  31.01 
 
 
1071 aa  79.7  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4760  TonB-dependent receptor plug  27.78 
 
 
1100 aa  80.1  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  28.14 
 
 
1064 aa  80.1  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  28 
 
 
1041 aa  80.1  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  31.12 
 
 
1040 aa  80.1  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3946  TonB-dependent receptor plug  27.8 
 
 
1043 aa  79  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2020  TonB-dependent receptor, plug  28.97 
 
 
1005 aa  79  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  28.68 
 
 
1081 aa  79  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4814  TonB-dependent receptor, plug  29.92 
 
 
1095 aa  79  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212605  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  30.68 
 
 
1056 aa  79  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 
1019 aa  78.6  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  28.63 
 
 
1164 aa  78.6  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  30.77 
 
 
1148 aa  78.6  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  31.48 
 
 
1142 aa  78.6  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0736  TonB-dependent receptor, plug  29.89 
 
 
942 aa  78.6  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.877946  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2250  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 
851 aa  78.2  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1074  TonB-dependent receptor plug  26.29 
 
 
1114 aa  77.8  0.0000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0628  TonB-dependent receptor plug  27.04 
 
 
975 aa  77.8  0.0000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  26.97 
 
 
753 aa  77  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 
735 aa  76.6  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  30.43 
 
 
1107 aa  76.6  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  31.45 
 
 
1028 aa  76.6  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  29.46 
 
 
1011 aa  76.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4329  TonB-dependent receptor, plug  27.56 
 
 
1005 aa  76.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  26.92 
 
 
1079 aa  77  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  29.67 
 
 
1063 aa  76.6  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  29.61 
 
 
1080 aa  75.9  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4977  TonB-dependent receptor plug  28.52 
 
 
1031 aa  75.9  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000497416  normal  0.504247 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  27.68 
 
 
1023 aa  75.9  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 
1033 aa  75.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  27.56 
 
 
1138 aa  76.3  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  30.19 
 
 
1189 aa  76.3  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  30.47 
 
 
1036 aa  75.5  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  28.47 
 
 
1102 aa  75.9  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  26.73 
 
 
1146 aa  75.5  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  28.11 
 
 
1038 aa  75.1  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  29.71 
 
 
1038 aa  75.1  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1487  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 
958 aa  75.1  0.000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  27.98 
 
 
999 aa  75.1  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 
1063 aa  75.1  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  26.5 
 
 
750 aa  74.7  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  31.36 
 
 
1043 aa  74.7  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0269  TonB-dependent receptor plug  27.24 
 
 
1018 aa  74.7  0.000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4255  TonB-dependent receptor, plug  30.3 
 
 
1034 aa  74.3  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 
1086 aa  74.3  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  28.14 
 
 
1038 aa  73.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4555  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 
734 aa  73.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000444386  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  27.53 
 
 
1059 aa  74.3  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  31.16 
 
 
1008 aa  74.3  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6129  TonB-dependent receptor plug  28.94 
 
 
721 aa  73.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  27.98 
 
 
1065 aa  74.3  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3390  TonB-dependent receptor plug  31.13 
 
 
1150 aa  73.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.532087  normal  0.341167 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 
828 aa  74.3  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  30.8 
 
 
1076 aa  74.3  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 
1026 aa  73.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  30.74 
 
 
1127 aa  73.9  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  28.09 
 
 
1043 aa  73.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 
887 aa  73.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  30.83 
 
 
1068 aa  73.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>