More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4555 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013731  Slin_6730  TonB-dependent receptor  81.44 
 
 		 733 aa  1245    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.23656 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4555  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 734 aa  1502    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000444386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6129  TonB-dependent receptor plug  34.99 
 
 		 721 aa  399  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3092  TonB-dependent receptor, plug  32.57 
 
 		 726 aa  370  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0203  TonB-dependent receptor, plug  29.48 
 
 		 700 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.583502  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2818  TonB-dependent receptor, plug  27.41 
 
 		 691 aa  223  9e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2172  TonB-dependent receptor, plug  27.96 
 
 		 687 aa  212  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  27.02 
 
 		 760 aa  143  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  26.7 
 
 		 753 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2289  TonB-dependent receptor plug  27.29 
 
 		 719 aa  134  5e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.652188 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  24.63 
 
 		 748 aa  131  5.0000000000000004e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  23.57 
 
 		 750 aa  128  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 634 aa  126  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1678  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 751 aa  120  7e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0201195  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  25 
 
 		 639 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 613 aa  115  4.0000000000000004e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0569  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 		 778 aa  115  4.0000000000000004e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.147079 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 763 aa  112  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  26.6 
 
 		 848 aa  111  6e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  25.06 
 
 		 633 aa  109  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1511  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 772 aa  109  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124874  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0798  hypothetical protein  25.68 
 
 		 720 aa  106  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  24.1 
 
 		 653 aa  103  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3318  TonB-dependent receptor  23.17 
 
 		 720 aa  103  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000715438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0635  TonB-dependent receptor  23.02 
 
 		 720 aa  103  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00167095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  23.25 
 
 		 665 aa  102  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  23.25 
 
 		 665 aa  102  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  23.25 
 
 		 665 aa  102  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0249  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 688 aa  100  8e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  25.57 
 
 		 833 aa  100  9e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 665 aa  100  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3109  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 745 aa  98.2  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.87493 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  23.95 
 
 		 665 aa  97.1  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1506  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 707 aa  96.7  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1797  TonB-dependent receptor plug  24.88 
 
 		 647 aa  96.3  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5685  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 773 aa  95.9  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0785655  normal  0.623805 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3191  TonB-dependent receptor  22.64 
 
 		 720 aa  96.3  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0126534  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  23.92 
 
 		 680 aa  94.4  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  33.65 
 
 		 762 aa  94  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  20.61 
 
 		 659 aa  92.8  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 757 aa  92.8  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1451  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 		 668 aa  92.4  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1803  ribosome-binding factor A  26.01 
 
 		 656 aa  92.8  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 679 aa  92.8  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  24 
 
 		 652 aa  92.4  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  22.73 
 
 		 656 aa  93.2  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  22.22 
 
 		 663 aa  91.7  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  23.8 
 
 		 655 aa  91.7  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  22.22 
 
 		 663 aa  91.7  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  22.22 
 
 		 663 aa  91.3  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  22.22 
 
 		 663 aa  91.3  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  22.22 
 
 		 663 aa  91.3  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25 
 
 		 656 aa  91.3  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  22.22 
 
 		 663 aa  90.9  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1088  TonB-dependent receptor  22.16 
 
 		 679 aa  90.9  8e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  23.13 
 
 		 641 aa  90.5  9e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  23.11 
 
 		 743 aa  88.2  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2030  TonB-dependent receptor, plug  25.13 
 
 		 668 aa  87.8  7e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7217  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 707 aa  87.4  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  21.38 
 
 		 650 aa  87  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  23.77 
 
 		 650 aa  87  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  22.5 
 
 		 650 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_002950  PG1552  TonB-dependent receptor HmuR  24.89 
 
 		 646 aa  85.5  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  22.27 
 
 		 650 aa  84.7  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  22.27 
 
 		 650 aa  84.7  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0558  TonB-dependent receptor plug  30.26 
 
 		 817 aa  84.7  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000727933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  22.27 
 
 		 650 aa  84.7  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  23.46 
 
 		 652 aa  84.7  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1099  TonB-dependent receptor  21.33 
 
 		 664 aa  84.7  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  22.95 
 
 		 726 aa  84.3  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6723  TonB-dependent receptor  23.04 
 
 		 1128 aa  84  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  24.53 
 
 		 700 aa  84  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 635 aa  84  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1559  TonB-dependent receptor plug  22.32 
 
 		 706 aa  84  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000264695  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  24.31 
 
 		 695 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3294  TonB-dependent receptor, plug  24.05 
 
 		 676 aa  82.8  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 658 aa  82.8  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0847  ferric receptor CfrA  23.54 
 
 		 696 aa  82  0.00000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1486  TonB-dependent receptor, plug  22.62 
 
 		 677 aa  80.9  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.243313  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  23.06 
 
 		 653 aa  81.3  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  23.43 
 
 		 666 aa  80.9  0.00000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0993  TonB-dependent receptor  22.18 
 
 		 735 aa  80.5  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0663099  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  23.43 
 
 		 666 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  23.43 
 
 		 666 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3494  TonB-dependent receptor  21.74 
 
 		 715 aa  80.5  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6535  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 694 aa  80.1  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.822423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 757 aa  80.5  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3882  TonB-dependent receptor plug  27.68 
 
 		 1027 aa  79.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0857894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  22.27 
 
 		 661 aa  79.7  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1111  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.53 
 
 		 754 aa  79.3  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.192516 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1261  ferric receptor CfrA  23.31 
 
 		 702 aa  79.3  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2140  ferrichrome receptor precursor protein  29.26 
 
 		 740 aa  79  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  23.21 
 
 		 666 aa  79  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1274  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 861 aa  78.6  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  26.8 
 
 		 783 aa  78.2  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3089  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 758 aa  78.2  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.329983  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  23.77 
 
 		 663 aa  77.8  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1245  TonB-dependent receptor, plug  23.9 
 
 		 636 aa  77.8  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  23.43 
 
 		 666 aa  77.4  0.0000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1561  TonB-dependent receptor plug  29.94 
 
 		 681 aa  77.4  0.0000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000105774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>