More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0736 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0736  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 942 aa  1904    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.877946  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1487  TonB-dependent receptor  46.15 
 
 		 958 aa  810    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06835  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  48.96 
 
 		 914 aa  827    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3000  TonB-dependent receptor  37.7 
 
 		 854 aa  550  1e-155  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.249213  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1414  hypothetical protein  34.03 
 
 		 871 aa  442  9.999999999999999e-123  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.530363 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0578  TonB-dependent receptor  23.6 
 
 		 903 aa  156  1e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02635  hypothetical protein  24.5 
 
 		 954 aa  156  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0363772  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1168  TonB-dependent receptor  23.35 
 
 		 939 aa  134  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3424  TonB-dependent receptor  31.82 
 
 		 815 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.053865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 833 aa  121  7e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5636  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 793 aa  120  9e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.734932  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01505  putative TonB-dependent transmembrane receptor protein  29 
 
 		 803 aa  117  7.999999999999999e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1588  TonB-dependent receptor  31.12 
 
 		 716 aa  98.6  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6547  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 791 aa  97.8  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.32752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  26.94 
 
 		 795 aa  94.4  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5745  TonB-dependent receptor  30.85 
 
 		 691 aa  92  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000026559  normal  0.448154 
 
 
-
 
NC_002950  PG1899  TonB-dependent receptor, putative  28.64 
 
 		 794 aa  91.7  6e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0545  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 922 aa  89.7  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  30 
 
 		 874 aa  87.8  8e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4146  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 961 aa  87.8  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960595  normal  0.432652 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  25.42 
 
 		 776 aa  83.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2516  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 772 aa  82.4  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  30.52 
 
 		 1035 aa  82.4  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4255  TonB-dependent receptor, plug  37.57 
 
 		 1034 aa  81.6  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0445  TonB-dependent receptor plug  33.89 
 
 		 1043 aa  81.3  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  29.37 
 
 		 1068 aa  81.3  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  33.98 
 
 		 1038 aa  80.9  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 757 aa  80.5  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  32.46 
 
 		 1034 aa  79.7  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  30.82 
 
 		 1058 aa  79.3  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0821  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 		 929 aa  79  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  26.2 
 
 		 769 aa  78.2  0.0000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1311  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 720 aa  77.4  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  32.76 
 
 		 1166 aa  76.3  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 866 aa  76.6  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 962 aa  77  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  31 
 
 		 1019 aa  75.5  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  26.72 
 
 		 791 aa  75.5  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  30.58 
 
 		 994 aa  75.1  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1405  TonB-dependent receptor, plug  29.2 
 
 		 993 aa  74.7  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00000855387  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 1004 aa  74.3  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5648  TonB-dependent receptor plug  26.64 
 
 		 1041 aa  74.3  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  29.11 
 
 		 1023 aa  74.3  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  28.29 
 
 		 989 aa  73.9  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  29.65 
 
 		 1020 aa  73.6  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  28.28 
 
 		 1028 aa  73.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  28.73 
 
 		 1077 aa  73.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0277  TonB-dependent receptor plug  27.4 
 
 		 1096 aa  72.4  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.97163  normal  0.971813 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  33 
 
 		 986 aa  72.8  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4234  TonB-dependent receptor, plug  32.64 
 
 		 1047 aa  72.8  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 836 aa  72.4  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 828 aa  72.8  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0593  TonB-dependent receptor plug  29.78 
 
 		 1135 aa  72  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0125278 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  31.98 
 
 		 979 aa  72  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  30.34 
 
 		 1003 aa  71.6  0.00000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 1093 aa  71.6  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  35.39 
 
 		 1049 aa  71.2  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0628  TonB-dependent receptor plug  29.46 
 
 		 975 aa  71.2  0.00000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4532  TonB-dependent receptor plug  29.33 
 
 		 1053 aa  71.2  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.171577  normal  0.0460383 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  28.57 
 
 		 788 aa  71.2  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  32.02 
 
 		 1025 aa  71.2  0.00000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  30.71 
 
 		 1105 aa  71.2  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  31.82 
 
 		 996 aa  71.2  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 1189 aa  71.2  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  31.14 
 
 		 646 aa  70.5  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  29.57 
 
 		 1063 aa  70.5  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  28.68 
 
 		 1101 aa  69.7  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  28.15 
 
 		 1082 aa  70.1  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  29.69 
 
 		 1008 aa  70.1  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2894  TonB-dependent receptor, plug  30.3 
 
 		 1237 aa  70.5  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.403551  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  28.87 
 
 		 1002 aa  70.1  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  30.53 
 
 		 1066 aa  70.1  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  27.13 
 
 		 1065 aa  70.1  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01250  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 882 aa  70.1  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0569  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 778 aa  69.3  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.147079 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01815  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 927 aa  68.9  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4814  TonB-dependent receptor, plug  28.79 
 
 		 1095 aa  68.9  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212605  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1535  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 972 aa  68.9  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.39302  normal  0.5632 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1274  TonB-dependent receptor plug  26.19 
 
 		 861 aa  68.9  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2476  TonB-dependent receptor plug  25.92 
 
 		 1095 aa  68.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263017  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  30.04 
 
 		 1080 aa  68.2  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  30.15 
 
 		 1059 aa  68.6  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  30.14 
 
 		 1202 aa  68.6  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2810  TonB-dependent receptor plug  31.82 
 
 		 1048 aa  68.2  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2444  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 1001 aa  68.2  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  27.56 
 
 		 1059 aa  67.8  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0915  TonB-dependent receptor plug  32.6 
 
 		 1075 aa  67.8  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0830  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 933 aa  67.8  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.926876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7182  TonB-dependent receptor plug  29.53 
 
 		 1186 aa  67.4  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.893491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  29.83 
 
 		 1023 aa  67.4  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  27.71 
 
 		 1102 aa  67  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  24.72 
 
 		 1062 aa  67.4  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1659  TonB-dependent receptor plug  25.88 
 
 		 1113 aa  67  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 1175 aa  67.4  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4559  TonB-dependent receptor, plug  33.87 
 
 		 1010 aa  67.4  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  28.74 
 
 		 638 aa  66.6  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  31.38 
 
 		 1030 aa  67  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0274  TonB-dependent receptor  31.33 
 
 		 1083 aa  66.6  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.302704 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4329  TonB-dependent receptor, plug  37.31 
 
 		 1005 aa  66.6  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4491  TonB-dependent receptor, plug  33.55 
 
 		 1129 aa  67  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>