More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6142 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6142  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 857 aa  1747    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.283964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0236  TonB-dependent receptor  42.99 
 
 		 958 aa  670    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4133  TonB-dependent receptor  52.82 
 
 		 850 aa  925    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.882317  normal  0.0172602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3725  TonB-dependent receptor  31.49 
 
 		 918 aa  396  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0163504  normal  0.0922435 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0821  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 929 aa  384  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3882  TonB-dependent receptor plug  35.54 
 
 		 1027 aa  341  4e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0857894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4475  TonB-dependent receptor  30.79 
 
 		 955 aa  323  9.999999999999999e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5066  TonB-dependent receptor plug  34.41 
 
 		 1001 aa  315  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000778295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3310  TonB-dependent receptor  31.4 
 
 		 971 aa  224  4e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.183606 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5117  TonB-dependent receptor  32.43 
 
 		 801 aa  107  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.820743 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2201  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 		 893 aa  88.6  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  31.11 
 
 		 736 aa  67.4  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0439  hypothetical protein  29.58 
 
 		 670 aa  67  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.447441 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5030  TonB-dependent receptor  35.29 
 
 		 680 aa  67  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.602403  normal  0.598022 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 737 aa  65.9  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  30.72 
 
 		 750 aa  65.5  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2845  putative TonB-dependent receptor  30.06 
 
 		 715 aa  65.1  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1571  TonB-dependent receptor  31.37 
 
 		 804 aa  64.3  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.579738  normal  0.0739696 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  33.1 
 
 		 748 aa  64.3  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1110  TonB-dependent receptor domain-containing protein  27.6 
 
 		 716 aa  63.5  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1648  ferric receptor CfrA  27.22 
 
 		 696 aa  63.2  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1522  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2036  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 687 aa  62.4  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3176  TonB-dependent siderophore receptor  27.75 
 
 		 653 aa  62.4  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0132  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 679 aa  62  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.691558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3573  TonB-dependent receptor plug  31.47 
 
 		 758 aa  62.4  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1099  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 643 aa  62.4  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3416  TonB-dependent receptor plug  27.03 
 
 		 684 aa  62  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.717717  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0815  TonB-dependent receptor domain-containing protein  27.68 
 
 		 653 aa  61.2  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  28.09 
 
 		 760 aa  60.8  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  28.24 
 
 		 659 aa  60.8  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  31.58 
 
 		 753 aa  60.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2631  TonB-dependent siderophore receptor  26.11 
 
 		 770 aa  60.5  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3505  outer membrane insertion C-terminal signal  30.77 
 
 		 758 aa  60.1  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1506  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 707 aa  59.7  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3157  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 714 aa  60.1  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0104  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 678 aa  60.1  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.479806  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4468  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 671 aa  59.7  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659683  normal  0.254173 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2855  TonB-dependent siderophore receptor  26.11 
 
 		 747 aa  60.1  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3576  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 653 aa  59.7  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.313951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1797  TonB-dependent receptor plug  33.57 
 
 		 647 aa  59.7  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0745  TonB-dependent receptor, plug  30.77 
 
 		 758 aa  60.1  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  25.93 
 
 		 747 aa  60.1  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  31.25 
 
 		 776 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3695  outer membrane insertion C-terminal signal  30.77 
 
 		 758 aa  60.1  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.122908 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 742 aa  59.7  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  29.9 
 
 		 693 aa  59.3  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2952  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 645 aa  59.7  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.771516  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4602  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 699 aa  59.3  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.696133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2400  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 1004 aa  59.7  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.204664 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3767  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 653 aa  59.3  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3294  TonB-dependent receptor, plug  30 
 
 		 676 aa  59.3  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3302  TonB-dependent siderophore receptor  28.25 
 
 		 653 aa  58.9  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00384842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0651  TonB-dependent siderophore receptor  28.25 
 
 		 653 aa  58.9  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.68611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 759 aa  58.5  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  26.72 
 
 		 639 aa  58.5  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  27.78 
 
 		 732 aa  58.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3559  TonB-dependent receptor  30.41 
 
 		 665 aa  58.5  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00145171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  31.21 
 
 		 698 aa  58.2  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3644  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 653 aa  58.2  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388894  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1407  TonB-dependent siderophore receptor  26.09 
 
 		 705 aa  58.5  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0663  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 652 aa  58.5  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136044  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3531  TonB-dependent receptor plug  29.63 
 
 		 678 aa  58.2  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0790413  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0227  TonB-dependent siderophore receptor  30.83 
 
 		 738 aa  58.2  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 713 aa  58.2  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1968  TonB-dependent heme receptor  23.83 
 
 		 690 aa  57.8  0.0000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0847  ferric receptor CfrA  25.56 
 
 		 696 aa  57.8  0.0000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  28.67 
 
 		 795 aa  57.8  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1552  TonB-dependent receptor HmuR  31.4 
 
 		 646 aa  57.4  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  24.86 
 
 		 656 aa  57  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2754  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 747 aa  57  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 619 aa  57.4  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4010  TonB-dependent receptor, plug  24.42 
 
 		 678 aa  57  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0123  TonB-dependent receptor plug  26.36 
 
 		 670 aa  57  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0182279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3472  TonB-dependent siderophore receptor  27.68 
 
 		 653 aa  57.4  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0503687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0993  TonB-dependent receptor plug  28.87 
 
 		 826 aa  57  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05847  hypothetical protein  26.35 
 
 		 718 aa  56.6  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 700 aa  56.2  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0028  TonB-dependent receptor  31.62 
 
 		 641 aa  56.2  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 764 aa  56.2  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0700  TonB-dependent siderophore receptor  27.55 
 
 		 776 aa  56.6  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0376627  normal  0.580851 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 626 aa  56.6  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0552  TonB-dependent receptor, plug  28 
 
 		 653 aa  57  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4232  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 747 aa  57  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 626 aa  56.6  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1518  TonB-dependent receptor plug  27.82 
 
 		 727 aa  56.6  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0273  TonB-dependent receptor  31.33 
 
 		 602 aa  56.6  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0292443  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  24.6 
 
 		 646 aa  55.8  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0769  TonB-dependent receptor, plug  25.57 
 
 		 687 aa  55.8  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1261  ferric receptor CfrA  25.32 
 
 		 702 aa  55.8  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2751  TonB-dependent receptor plug  27.82 
 
 		 722 aa  56.2  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.930878  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  34.01 
 
 		 619 aa  55.5  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  25 
 
 		 704 aa  55.5  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  26.78 
 
 		 633 aa  55.5  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  22.84 
 
 		 690 aa  55.5  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  29.86 
 
 		 661 aa  55.5  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  22.84 
 
 		 690 aa  55.5  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0883  ferric enterobactin receptor, putative  32.82 
 
 		 627 aa  55.5  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.277897  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01896  tonb-dependent receptor signal peptide protein  29.21 
 
 		 652 aa  55.5  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.156126  normal  0.62904 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1786  TonB-dependent heme receptor  24.12 
 
 		 718 aa  55.5  0.000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2077  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 742 aa  55.5  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>