More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5117 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5117  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 801 aa  1625    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.820743 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2201  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 893 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0821  TonB-dependent receptor  23.25 
 
 		 929 aa  176  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3882  TonB-dependent receptor plug  25.08 
 
 		 1027 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0857894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5066  TonB-dependent receptor plug  24.02 
 
 		 1001 aa  144  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000778295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3310  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 971 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.183606 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4475  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 955 aa  127  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3725  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 918 aa  123  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0163504  normal  0.0922435 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4133  TonB-dependent receptor  21.51 
 
 		 850 aa  120  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.882317  normal  0.0172602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0236  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 958 aa  120  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 757 aa  114  8.000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6142  TonB-dependent receptor  32.43 
 
 		 857 aa  107  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.283964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  24.7 
 
 		 769 aa  100  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3416  TonB-dependent receptor plug  25.1 
 
 		 684 aa  97.4  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.717717  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  24.11 
 
 		 747 aa  96.3  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05847  hypothetical protein  28.37 
 
 		 718 aa  87.8  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 828 aa  87.4  9e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1274  TonB-dependent receptor plug  30.26 
 
 		 861 aa  85.5  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0769  TonB-dependent receptor, plug  22.77 
 
 		 687 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0439  hypothetical protein  31.84 
 
 		 670 aa  85.1  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.447441 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  22.32 
 
 		 666 aa  85.1  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  30.93 
 
 		 833 aa  83.2  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4008  TonB-dependent receptor, plug  23.37 
 
 		 680 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0777  TonB-dependent receptor plug  23.34 
 
 		 645 aa  83.2  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0666  TonB-dependent receptor, plug  22.41 
 
 		 615 aa  82.8  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 836 aa  82.4  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  26.12 
 
 		 918 aa  82.4  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2372  TonB-dependent receptor, plug  30.2 
 
 		 642 aa  81.6  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286336 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  21.57 
 
 		 663 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  29.13 
 
 		 748 aa  79.3  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2844  TonB-dependent siderophore receptor  25.91 
 
 		 782 aa  78.6  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350592  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  24.08 
 
 		 656 aa  78.2  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1992  TonB-dependent receptor, plug  31.61 
 
 		 671 aa  77  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.643758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1561  TonB-dependent receptor plug  21.86 
 
 		 681 aa  77  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000105774  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0816  TonB-dependent receptor  21.99 
 
 		 816 aa  76.6  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0936  TonB-dependent receptor  22.53 
 
 		 715 aa  76.6  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.613823  hitchhiker  0.00136124 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0569  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 778 aa  76.3  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.147079 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  34.48 
 
 		 732 aa  75.5  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 828 aa  75.1  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1535  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 972 aa  75.5  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.39302  normal  0.5632 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0975  TonB-dependent siderophore receptor  26.98 
 
 		 806 aa  75.1  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.608799  normal  0.162482 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 763 aa  75.1  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 1004 aa  75.1  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1669  TonB-dependent receptor, plug  31.51 
 
 		 676 aa  75.1  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164954  normal  0.124245 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  23.22 
 
 		 744 aa  74.3  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0132  TonB-dependent receptor  30.25 
 
 		 679 aa  72.8  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.691558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1099  TonB-dependent receptor  29.68 
 
 		 643 aa  73.2  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 613 aa  73.2  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4555  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 734 aa  73.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000444386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1088  TonB-dependent receptor  24.11 
 
 		 679 aa  72.8  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1506  TonB-dependent receptor  21.97 
 
 		 707 aa  72.8  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2310  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 815 aa  73.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0199  TonB-dependent siderophore receptor  25.6 
 
 		 810 aa  72.8  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  26.11 
 
 		 750 aa  72.4  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 759 aa  72.4  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 681 aa  72.4  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  28 
 
 		 809 aa  72.4  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  24.31 
 
 		 665 aa  71.2  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2276  TonB-dependent receptor  22.67 
 
 		 751 aa  71.2  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  26.04 
 
 		 848 aa  70.9  0.00000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  20.87 
 
 		 650 aa  71.2  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  23.78 
 
 		 795 aa  70.9  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1552  TonB-dependent receptor HmuR  24.1 
 
 		 646 aa  70.1  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0176  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 763 aa  70.5  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  27.31 
 
 		 753 aa  70.5  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 845 aa  70.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0131  TonB-dependent receptor, plug  27.56 
 
 		 677 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0123  TonB-dependent receptor plug  26.88 
 
 		 670 aa  69.3  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0182279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1366  tonB-linked outer membrane receptor  27.78 
 
 		 811 aa  69.3  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.351505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4010  TonB-dependent receptor, plug  27.27 
 
 		 678 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  29.88 
 
 		 655 aa  69.7  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2461  TonB-dependent receptor, plug  28.96 
 
 		 662 aa  68.6  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.160214  normal  0.0971358 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  31.64 
 
 		 679 aa  68.6  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  28.39 
 
 		 633 aa  68.2  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  26.37 
 
 		 776 aa  68.2  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2030  TonB-dependent receptor, plug  30.29 
 
 		 668 aa  68.2  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  21.78 
 
 		 757 aa  68.2  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0993  TonB-dependent receptor plug  29.65 
 
 		 826 aa  67.8  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  30.38 
 
 		 743 aa  67.8  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  29.85 
 
 		 663 aa  67  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  29.85 
 
 		 663 aa  67  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6730  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 		 733 aa  67  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.23656 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  28.96 
 
 		 665 aa  67  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  29.85 
 
 		 663 aa  67  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  29.85 
 
 		 663 aa  67  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  29.85 
 
 		 663 aa  67  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0558  TonB-dependent receptor plug  26.21 
 
 		 817 aa  67.4  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000727933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  29.85 
 
 		 663 aa  67  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4534  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 779 aa  67  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.732299 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  29.85 
 
 		 641 aa  67  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  30.68 
 
 		 646 aa  66.6  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3767  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 653 aa  66.2  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3302  TonB-dependent siderophore receptor  27.22 
 
 		 653 aa  66.6  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00384842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0651  TonB-dependent siderophore receptor  27.22 
 
 		 653 aa  66.6  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.68611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  29.85 
 
 		 659 aa  66.6  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  22.74 
 
 		 640 aa  66.2  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  31.49 
 
 		 1028 aa  65.9  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4450  TonB-dependent receptor plug  31.03 
 
 		 767 aa  65.9  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 736 aa  65.9  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0089  TonB-dependent receptor, plug  31.03 
 
 		 707 aa  65.9  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>