More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3882 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5066  TonB-dependent receptor plug  58.58 
 
 		 1001 aa  1169    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000778295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3882  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1027 aa  2087    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0857894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3725  TonB-dependent receptor  48.01 
 
 		 918 aa  590  1e-167  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0163504  normal  0.0922435 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3310  TonB-dependent receptor  42.52 
 
 		 971 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.183606 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0821  TonB-dependent receptor  33.53 
 
 		 929 aa  538  1e-151  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0236  TonB-dependent receptor  38.21 
 
 		 958 aa  417  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4475  TonB-dependent receptor  40 
 
 		 955 aa  419  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6142  TonB-dependent receptor  35.54 
 
 		 857 aa  340  5.9999999999999996e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.283964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4133  TonB-dependent receptor  33.97 
 
 		 850 aa  324  5e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.882317  normal  0.0172602 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5117  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 801 aa  166  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.820743 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2201  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 893 aa  97.8  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  30.2 
 
 		 1074 aa  95.9  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  28.82 
 
 		 1058 aa  89  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  29.26 
 
 		 1107 aa  88.6  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 		 757 aa  88.6  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  30.04 
 
 		 1046 aa  87.4  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 873 aa  87  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  23.95 
 
 		 747 aa  86.7  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4474  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 855 aa  87  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.18025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 759 aa  86.3  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  28.69 
 
 		 753 aa  85.9  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  29.17 
 
 		 1064 aa  85.1  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  29.24 
 
 		 1079 aa  85.1  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  27.54 
 
 		 1082 aa  84  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1518  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 854 aa  83.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1769  TonB-dependent receptor plug  28.22 
 
 		 1085 aa  82.4  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  28.45 
 
 		 769 aa  81.6  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0277  TonB-dependent receptor plug  28.83 
 
 		 1096 aa  80.5  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.97163  normal  0.971813 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  33.49 
 
 		 1177 aa  79.7  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4555  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 734 aa  79.7  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000444386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  30.71 
 
 		 1036 aa  78.6  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  30.56 
 
 		 1063 aa  78.6  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1567  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 780 aa  78.6  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615105  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4534  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 779 aa  78.2  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.732299 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  30.71 
 
 		 1041 aa  78.2  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  32.84 
 
 		 1148 aa  78.2  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0274  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 1083 aa  77.8  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.302704 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5030  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 680 aa  77.8  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.602403  normal  0.598022 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  29.1 
 
 		 1019 aa  77.4  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  30.98 
 
 		 1102 aa  77  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  29.46 
 
 		 1070 aa  77  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6451  TonB-dependent receptor plug  29.31 
 
 		 1062 aa  77  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.402176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  28.09 
 
 		 1059 aa  76.3  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  30.58 
 
 		 1019 aa  75.9  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1887  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 848 aa  75.9  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6730  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 733 aa  75.9  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.23656 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  27.85 
 
 		 1023 aa  75.9  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2645  TonB-dependent receptor plug  27.07 
 
 		 1143 aa  75.5  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  27.54 
 
 		 1006 aa  75.5  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2627  TonB-dependent receptor plug  31.36 
 
 		 1117 aa  75.5  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.454001  normal  0.67516 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4532  TonB-dependent receptor plug  28.96 
 
 		 1053 aa  75.5  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.171577  normal  0.0460383 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7182  TonB-dependent receptor plug  29.51 
 
 		 1186 aa  75.1  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.893491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1552  TonB-dependent receptor plug  31.65 
 
 		 1028 aa  75.5  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  29.55 
 
 		 1164 aa  74.7  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  30.08 
 
 		 1060 aa  74.7  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 		 1144 aa  74.3  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4298  TonB-dependent siderophore receptor  22.3 
 
 		 824 aa  74.3  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.742577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  26.05 
 
 		 748 aa  73.2  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  24.39 
 
 		 1041 aa  73.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  24.6 
 
 		 1062 aa  73.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5648  TonB-dependent receptor plug  28.22 
 
 		 1041 aa  73.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6566  TonB-dependent receptor plug  31.7 
 
 		 1160 aa  73.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00225282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  22.66 
 
 		 776 aa  73.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  25.49 
 
 		 1030 aa  72.8  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 1080 aa  72.8  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  26.89 
 
 		 1071 aa  72.8  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4175  TonB-dependent receptor plug  30.04 
 
 		 1099 aa  72.8  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000931261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 1033 aa  72.4  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 		 1014 aa  72  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4416  TonB-dependent receptor plug  27.53 
 
 		 996 aa  72  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000494503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  30.19 
 
 		 1103 aa  72.4  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  28.7 
 
 		 1137 aa  72  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  28.51 
 
 		 986 aa  72  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  28.44 
 
 		 1114 aa  71.6  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 1063 aa  71.6  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  27.69 
 
 		 1038 aa  71.6  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  30.74 
 
 		 1029 aa  71.6  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3424  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 815 aa  71.6  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.053865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  32.43 
 
 		 1097 aa  71.2  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  29.8 
 
 		 1008 aa  71.2  0.00000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  25.33 
 
 		 848 aa  70.9  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07040  ferrichrome-iron receptor  26.18 
 
 		 808 aa  70.9  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  32.27 
 
 		 1137 aa  70.5  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05065  hypothetical protein  33.33 
 
 		 979 aa  70.9  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  27.09 
 
 		 1169 aa  70.5  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  23.67 
 
 		 795 aa  70.9  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0593  TonB-dependent receptor plug  27.78 
 
 		 1135 aa  70.5  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0125278 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  31.39 
 
 		 1148 aa  71.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  28.75 
 
 		 1036 aa  70.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  27.45 
 
 		 1059 aa  70.5  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  28.05 
 
 		 1024 aa  69.7  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  28.93 
 
 		 989 aa  70.1  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 1105 aa  70.5  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4561  TonB-dependent receptor  23.23 
 
 		 824 aa  70.5  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0251417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3400  TonB-dependent receptor plug  26.72 
 
 		 1057 aa  70.1  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  28.02 
 
 		 1028 aa  69.7  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0403  TonB-dependent receptor, plug  29.2 
 
 		 1083 aa  69.7  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  27.73 
 
 		 1038 aa  69.7  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  31.08 
 
 		 1081 aa  69.3  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  30.42 
 
 		 1053 aa  69.7  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>