More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0236 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4133  TonB-dependent receptor  42.11 
 
 		 850 aa  669    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.882317  normal  0.0172602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6142  TonB-dependent receptor  42.99 
 
 		 857 aa  681    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.283964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0236  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 958 aa  1967    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0821  TonB-dependent receptor  34.06 
 
 		 929 aa  535  1e-150  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5066  TonB-dependent receptor plug  33.79 
 
 		 1001 aa  495  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000778295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3725  TonB-dependent receptor  34.62 
 
 		 918 aa  493  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0163504  normal  0.0922435 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3882  TonB-dependent receptor plug  38.86 
 
 		 1027 aa  430  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0857894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4475  TonB-dependent receptor  32.56 
 
 		 955 aa  417  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3310  TonB-dependent receptor  33.22 
 
 		 971 aa  270  1e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.183606 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5117  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 801 aa  120  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.820743 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2201  TonB-dependent receptor  29.54 
 
 		 893 aa  110  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1769  TonB-dependent receptor plug  32.1 
 
 		 1085 aa  94.7  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  35.06 
 
 		 988 aa  92.8  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  30.57 
 
 		 1023 aa  87.4  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 757 aa  87  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  27.22 
 
 		 769 aa  86.7  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4534  TonB-dependent receptor  32.14 
 
 		 779 aa  86.3  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.732299 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  28.4 
 
 		 1047 aa  85.5  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  28.42 
 
 		 747 aa  84.7  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 759 aa  83.2  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  27.04 
 
 		 989 aa  83.6  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  32.54 
 
 		 1059 aa  83.2  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1518  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 854 aa  82.4  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  27.64 
 
 		 776 aa  82.8  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  32.4 
 
 		 999 aa  82.8  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  30.31 
 
 		 760 aa  82.4  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 1033 aa  82.4  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  27.6 
 
 		 795 aa  82.4  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  27.52 
 
 		 848 aa  81.3  0.00000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  29.01 
 
 		 1155 aa  80.5  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1567  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 780 aa  80.5  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615105  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  30.64 
 
 		 1070 aa  80.9  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  30.52 
 
 		 1046 aa  79.7  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  32.61 
 
 		 1026 aa  79.7  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  28.45 
 
 		 750 aa  80.5  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  29.51 
 
 		 1079 aa  80.1  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  33.49 
 
 		 1013 aa  80.1  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  30.74 
 
 		 1051 aa  78.6  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  32.13 
 
 		 1105 aa  78.2  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 1175 aa  78.6  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  31.33 
 
 		 1066 aa  77.8  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 873 aa  77.4  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  28.96 
 
 		 1058 aa  77  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  28.24 
 
 		 748 aa  76.6  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0569  TonB-dependent receptor  29.15 
 
 		 778 aa  77  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.147079 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  33.05 
 
 		 1064 aa  76.6  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  30.89 
 
 		 1014 aa  76.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  27.94 
 
 		 753 aa  77  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  29.29 
 
 		 1059 aa  75.9  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  31.33 
 
 		 1036 aa  75.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0356  TonB-dependent receptor plug  29.77 
 
 		 1128 aa  75.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.36308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  30.33 
 
 		 1050 aa  75.9  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  31.28 
 
 		 1130 aa  75.9  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3000  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 		 854 aa  75.9  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.249213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  28.26 
 
 		 1063 aa  75.9  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1887  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 848 aa  75.5  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  30.16 
 
 		 1023 aa  75.1  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 1060 aa  75.1  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  29.46 
 
 		 1024 aa  74.7  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6368  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 1065 aa  74.7  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2645  TonB-dependent receptor plug  31.34 
 
 		 1143 aa  74.3  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  29.34 
 
 		 1102 aa  74.3  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2079  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 1028 aa  73.9  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.297647 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  31.34 
 
 		 1161 aa  74.3  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  30.47 
 
 		 1107 aa  73.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  23.48 
 
 		 1081 aa  74.3  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  31.94 
 
 		 1033 aa  73.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0274  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 1083 aa  73.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.302704 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  30.4 
 
 		 1086 aa  73.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4474  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 855 aa  74.3  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.18025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  27.84 
 
 		 1059 aa  74.3  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 828 aa  73.2  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  30.47 
 
 		 1078 aa  73.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  30.55 
 
 		 1093 aa  73.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  32.99 
 
 		 1024 aa  72.8  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3400  TonB-dependent receptor plug  27.47 
 
 		 1057 aa  72.8  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7182  TonB-dependent receptor plug  29.96 
 
 		 1186 aa  72.8  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.893491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5636  TonB-dependent receptor  35.29 
 
 		 793 aa  72.8  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.734932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  30.4 
 
 		 1019 aa  72.8  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  28.84 
 
 		 1148 aa  72.4  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  29.96 
 
 		 1082 aa  72.4  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  26.25 
 
 		 833 aa  72.4  0.00000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  27.52 
 
 		 1103 aa  72.4  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  29.87 
 
 		 1008 aa  72  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4416  TonB-dependent receptor plug  29.55 
 
 		 996 aa  71.6  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000494503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 836 aa  72  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  26.43 
 
 		 812 aa  71.6  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1274  TonB-dependent receptor plug  27.98 
 
 		 861 aa  71.6  0.00000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 1076 aa  71.2  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  30.56 
 
 		 1080 aa  71.2  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  31.13 
 
 		 1202 aa  70.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0445  TonB-dependent receptor plug  25.81 
 
 		 1043 aa  70.5  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  29.6 
 
 		 1169 aa  70.9  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2250  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 851 aa  70.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  32.04 
 
 		 1028 aa  70.9  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5030  TonB-dependent receptor  33.09 
 
 		 680 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.602403  normal  0.598022 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 1058 aa  70.1  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  33.99 
 
 		 1051 aa  70.5  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  29.9 
 
 		 1037 aa  69.7  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  25.75 
 
 		 789 aa  70.5  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.609704 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>