More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3000 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3000  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 854 aa  1735    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.249213  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06835  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  37.88 
 
 		 914 aa  574  1.0000000000000001e-162  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0736  TonB-dependent receptor, plug  37.7 
 
 		 942 aa  550  1e-155  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.877946  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1414  hypothetical protein  37.67 
 
 		 871 aa  535  1e-150  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.530363 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1487  TonB-dependent receptor  35.6 
 
 		 958 aa  520  1e-146  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02635  hypothetical protein  24.36 
 
 		 954 aa  219  2e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0363772  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1168  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 		 939 aa  206  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0578  TonB-dependent receptor  23.04 
 
 		 903 aa  182  2e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 833 aa  161  6e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3424  TonB-dependent receptor  31.05 
 
 		 815 aa  126  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.053865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1588  TonB-dependent receptor  23.57 
 
 		 716 aa  122  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5636  TonB-dependent receptor  23.52 
 
 		 793 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.734932  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01505  putative TonB-dependent transmembrane receptor protein  21.31 
 
 		 803 aa  115  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1899  TonB-dependent receptor, putative  23.09 
 
 		 794 aa  100  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6547  TonB-dependent receptor  22.07 
 
 		 791 aa  99.4  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.32752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1311  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 		 720 aa  87  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0445  TonB-dependent receptor plug  32.65 
 
 		 1043 aa  85.9  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  32.12 
 
 		 1050 aa  84  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 836 aa  84  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  27.84 
 
 		 791 aa  80.9  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  22.76 
 
 		 757 aa  78.6  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  32.57 
 
 		 1038 aa  78.6  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  29.29 
 
 		 979 aa  78.6  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  27.96 
 
 		 1062 aa  78.2  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  37.2 
 
 		 1075 aa  76.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6166  TonB-dependent receptor plug  31.35 
 
 		 977 aa  76.6  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.679734  decreased coverage  0.00200292 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  32.75 
 
 		 1013 aa  75.9  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0236  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 		 958 aa  75.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1390  TonB-dependent receptor plug  29.94 
 
 		 1037 aa  75.9  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 866 aa  74.7  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2226  TonB-dependent receptor plug  32.95 
 
 		 1117 aa  75.1  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.377553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  29.89 
 
 		 1024 aa  74.7  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 874 aa  74.3  0.000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  26.05 
 
 		 833 aa  74.3  0.000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 1093 aa  73.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  30.68 
 
 		 1004 aa  72.8  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  32.07 
 
 		 1076 aa  73.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 828 aa  73.6  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 828 aa  72.8  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4131  TonB-dependent receptor plug  31.44 
 
 		 1027 aa  73.2  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28448  normal  0.339257 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  29.48 
 
 		 1082 aa  72.8  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  27.96 
 
 		 1115 aa  72  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  32.99 
 
 		 1063 aa  72  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1769  TonB-dependent receptor plug  28.75 
 
 		 1085 aa  72  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  30.72 
 
 		 1051 aa  72  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  32.9 
 
 		 1076 aa  71.6  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  27.38 
 
 		 1102 aa  71.6  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2785  TonB-dependent siderophore receptor  27.68 
 
 		 786 aa  71.6  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00424821  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2516  TonB-dependent receptor plug  27.57 
 
 		 772 aa  71.2  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  29.65 
 
 		 1046 aa  71.2  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3877  TonB-dependent receptor plug  29.32 
 
 		 1036 aa  71.2  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  26.86 
 
 		 1095 aa  71.2  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3993  TonB-dependent receptor plug  32.33 
 
 		 1081 aa  70.5  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356607  hitchhiker  0.00078443 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3755  tonB-linked outer membrane receptor P92  25.97 
 
 		 799 aa  70.9  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  30.93 
 
 		 1142 aa  70.5  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  30.35 
 
 		 1101 aa  70.1  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  30.37 
 
 		 1019 aa  70.9  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  29.14 
 
 		 1155 aa  70.1  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  32.37 
 
 		 1059 aa  69.7  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  24.71 
 
 		 848 aa  69.3  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5745  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 		 691 aa  69.3  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000026559  normal  0.448154 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  30.05 
 
 		 1024 aa  69.3  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  30.05 
 
 		 1028 aa  69.3  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  30.85 
 
 		 982 aa  68.9  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 1047 aa  69.3  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 1175 aa  68.6  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2854  TonB-dependent receptor plug  31.29 
 
 		 1138 aa  68.9  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.958759  normal  0.16457 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 1166 aa  68.9  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1659  TonB-dependent receptor plug  31.87 
 
 		 1113 aa  68.6  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  25.51 
 
 		 1060 aa  68.6  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  30.58 
 
 		 1038 aa  68.6  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  30.81 
 
 		 1033 aa  68.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1438  TonB-dependent receptor plug  26.56 
 
 		 999 aa  68.6  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.226679 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 1034 aa  68.2  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  29.67 
 
 		 1058 aa  68.2  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4255  TonB-dependent receptor, plug  34.13 
 
 		 1034 aa  67.8  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1136  TonB-dependent receptor  30.22 
 
 		 998 aa  67.4  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028233  normal  0.759049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  29.95 
 
 		 1079 aa  67.8  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2627  TonB-dependent receptor plug  30.77 
 
 		 1117 aa  67.4  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.454001  normal  0.67516 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3400  TonB-dependent receptor plug  28.11 
 
 		 1057 aa  67.4  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  29.12 
 
 		 1077 aa  67  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4523  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 998 aa  67.4  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0414328  normal  0.0764127 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4491  TonB-dependent receptor, plug  26.98 
 
 		 1129 aa  67.4  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  31.55 
 
 		 1188 aa  67  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  27.37 
 
 		 1165 aa  67  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4126  TonB-dependent receptor plug  31.43 
 
 		 1134 aa  67  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.504086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  29.82 
 
 		 1189 aa  67  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  30.36 
 
 		 1013 aa  66.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  29.02 
 
 		 986 aa  67  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4221  TonB-dependent siderophore receptor  27.59 
 
 		 795 aa  66.6  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2245  TonB-dependent receptor  32.45 
 
 		 1040 aa  67  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184688 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3310  TonB-dependent receptor  30.06 
 
 		 971 aa  66.6  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.183606 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  28.65 
 
 		 1041 aa  66.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0811  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 1016 aa  66.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000353149  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1014  TonB-dependent receptor, putative  22.29 
 
 		 760 aa  66.2  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4532  TonB-dependent receptor plug  27.75 
 
 		 1053 aa  65.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.171577  normal  0.0460383 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  30.41 
 
 		 1064 aa  65.9  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  30.54 
 
 		 1202 aa  66.2  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  31.35 
 
 		 1063 aa  66.2  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  27.38 
 
 		 1084 aa  65.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>