262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4827 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4827  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 748 aa  1541    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04680  TonB-dependent receptor  43.09 
 
 		 757 aa  624  1e-177  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.868178  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6273  TonB-dependent receptor  44.84 
 
 		 736 aa  625  1e-177  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000590633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3901  TonB-dependent receptor  46.1 
 
 		 734 aa  625  1e-177  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.707047  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1720  TonB-dependent receptor plug  46.54 
 
 		 760 aa  577  1.0000000000000001e-163  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.864818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1015  tonB-dependent receptor  45.82 
 
 		 750 aa  538  1e-151  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2872  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 676 aa  326  1e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4063  TonB-dependent receptor plug  33.07 
 
 		 712 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3038  TonB-dependent receptor  30.99 
 
 		 740 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5682  TonB-dependent receptor plug  32.76 
 
 		 672 aa  304  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.252502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1004  TonB-dependent receptor plug  33.18 
 
 		 689 aa  304  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.142326 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2922  putative outer membrane receptor signal peptide protein  30.46 
 
 		 699 aa  302  1e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2413  TonB-dependent receptor, plug  30.77 
 
 		 718 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0232072  normal  0.0153197 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6192  putative outer membrane receptor  30.77 
 
 		 765 aa  300  6e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.893416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5240  TonB-dependent receptor  30.28 
 
 		 723 aa  298  3e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3541  TonB-dependent receptor  31.03 
 
 		 692 aa  296  7e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3944  TonB-dependent receptor  29.94 
 
 		 689 aa  296  1e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.677577  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0737  TonB-dependent receptor, putative  31.14 
 
 		 692 aa  293  1e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01572  TonB-dependent receptor, putative  31.94 
 
 		 686 aa  291  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2180  TonB-dependent receptor, putative  29.66 
 
 		 765 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2798  putative outer membrane receptor signal peptide protein  30.96 
 
 		 722 aa  280  6e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.975651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0692  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 678 aa  276  9e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.218448  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1233  TonB-dependent receptor  30.38 
 
 		 705 aa  252  2e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.345328  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1684  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 717 aa  245  3e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0676339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0345  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 678 aa  230  6e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1472  TonB-dependent receptor plug  26.57 
 
 		 704 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1310  TonB-dependent receptor plug  26.57 
 
 		 704 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.475424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5111  TonB-dependent receptor plug  25.6 
 
 		 733 aa  107  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2804  outer membrane receptor protein  26.45 
 
 		 692 aa  102  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01819  outer membrane receptor protein, most likely Fe transport  24.45 
 
 		 716 aa  87  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000492197  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3112  TonB-dependent receptor  23.48 
 
 		 687 aa  83.6  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.589119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3196  TonB-dependent receptor plug  33.64 
 
 		 1099 aa  72.4  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  25.4 
 
 		 693 aa  71.6  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  29.47 
 
 		 1077 aa  70.9  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5636  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 793 aa  65.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.734932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  28.33 
 
 		 1038 aa  64.3  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  26.71 
 
 		 728 aa  62  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  29.83 
 
 		 1030 aa  61.6  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1274  TonB-dependent receptor plug  27.49 
 
 		 861 aa  60.8  0.00000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0736  TonB-dependent receptor, plug  27.23 
 
 		 942 aa  60.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.877946  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  27.24 
 
 		 1006 aa  60.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  28.92 
 
 		 1181 aa  60.1  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  25.44 
 
 		 1059 aa  59.7  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1769  TonB-dependent receptor plug  28.41 
 
 		 1085 aa  58.9  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  28.07 
 
 		 1010 aa  58.9  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4020  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.66 
 
 		 615 aa  58.5  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000194494  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1855  TonB-dependent receptor, putative  30 
 
 		 693 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0314757  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4175  TonB-dependent receptor plug  28.31 
 
 		 1099 aa  58.2  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000931261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3000  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 854 aa  58.2  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.249213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0593  TonB-dependent receptor plug  28.84 
 
 		 1135 aa  57.8  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0125278 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  29.55 
 
 		 1063 aa  57.8  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1166  TonB-dependent receptor plug  33.11 
 
 		 1084 aa  57.8  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.689476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3424  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 815 aa  57  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.053865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2476  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 1095 aa  57  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263017  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7234  TonB-dependent receptor plug  27.98 
 
 		 1119 aa  57.4  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.507309  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05065  hypothetical protein  28.22 
 
 		 979 aa  57.4  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0801  TonB-dependent receptor plug  29.48 
 
 		 1116 aa  57.4  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383306  normal  0.353517 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0274  TonB-dependent receptor  23.79 
 
 		 1083 aa  56.6  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.302704 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  28.5 
 
 		 1150 aa  56.6  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4131  TonB-dependent receptor plug  25.45 
 
 		 1027 aa  56.6  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28448  normal  0.339257 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  25.62 
 
 		 1081 aa  56.2  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  28.09 
 
 		 1082 aa  56.6  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0121  TonB-dependent receptor  22.62 
 
 		 681 aa  56.2  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.138382 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1259  TonB-dependent receptor plug  27.46 
 
 		 1106 aa  55.5  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.394544 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4812  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 1018 aa  55.1  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000883537  unclonable  0.000000000000117998 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  24.75 
 
 		 628 aa  55.1  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3258  TonB-dependent receptor plug  31.58 
 
 		 1099 aa  55.1  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363911  normal  0.0250929 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1487  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 958 aa  54.7  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 1040 aa  54.7  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 873 aa  54.7  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4389  TonB-dependent receptor plug  28.64 
 
 		 775 aa  54.7  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0212821 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  30.14 
 
 		 979 aa  54.7  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.01 
 
 		 614 aa  54.7  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.01 
 
 		 614 aa  54.7  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  26.01 
 
 		 1138 aa  54.3  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.01 
 
 		 614 aa  54.7  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.01 
 
 		 614 aa  54.3  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.01 
 
 		 614 aa  54.3  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1654  hypothetical protein  24.66 
 
 		 879 aa  54.3  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  28.21 
 
 		 1127 aa  53.5  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  28.5 
 
 		 638 aa  53.5  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3633  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 1010 aa  53.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1702  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1016 aa  53.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.784403 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 1020 aa  52.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3031  TonB-dependent receptor plug  26.7 
 
 		 1022 aa  53.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  28.1 
 
 		 1042 aa  53.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  25.7 
 
 		 1106 aa  52.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 1056 aa  52.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0553  TonB-dependent receptor plug  24.24 
 
 		 1036 aa  52.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0963  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 614 aa  52.4  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0445  TonB-dependent receptor plug  22.11 
 
 		 1043 aa  52.4  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  24.73 
 
 		 1021 aa  52.4  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4559  TonB-dependent receptor, plug  26.79 
 
 		 1010 aa  52.4  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  29.25 
 
 		 1138 aa  52.4  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0640  TonB-dependent receptor plug  27.2 
 
 		 1125 aa  52.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.138421 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  27.06 
 
 		 1027 aa  52.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  27.33 
 
 		 1094 aa  52  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6368  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 1065 aa  52  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  27.93 
 
 		 634 aa  52  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11498  putative outer membrane protein  28.65 
 
 		 1018 aa  51.6  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>