More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3901 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1720  TonB-dependent receptor plug  49.67 
 
 		 760 aa  711    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.864818  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04680  TonB-dependent receptor  51.16 
 
 		 757 aa  761    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.868178  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3901  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 734 aa  1510    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.707047  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6273  TonB-dependent receptor  60.92 
 
 		 736 aa  933    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000590633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4827  TonB-dependent receptor, plug  45.73 
 
 		 748 aa  630  1e-179  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1015  tonB-dependent receptor  43.89 
 
 		 750 aa  588  1e-166  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4063  TonB-dependent receptor plug  34.77 
 
 		 712 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2872  TonB-dependent receptor  33.48 
 
 		 676 aa  328  3e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2798  putative outer membrane receptor signal peptide protein  33.44 
 
 		 722 aa  328  3e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.975651  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2180  TonB-dependent receptor, putative  31.52 
 
 		 765 aa  327  6e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5682  TonB-dependent receptor plug  33.95 
 
 		 672 aa  321  3e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.252502  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2922  putative outer membrane receptor signal peptide protein  30.86 
 
 		 699 aa  311  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3038  TonB-dependent receptor  31.16 
 
 		 740 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0737  TonB-dependent receptor, putative  32.45 
 
 		 692 aa  311  4e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3944  TonB-dependent receptor  31.41 
 
 		 689 aa  310  5.9999999999999995e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.677577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3541  TonB-dependent receptor  32.4 
 
 		 692 aa  308  3e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5240  TonB-dependent receptor  31.5 
 
 		 723 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1233  TonB-dependent receptor  32.65 
 
 		 705 aa  295  2e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.345328  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0692  TonB-dependent receptor  30.2 
 
 		 678 aa  294  3e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.218448  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2413  TonB-dependent receptor, plug  30.99 
 
 		 718 aa  292  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0232072  normal  0.0153197 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1004  TonB-dependent receptor plug  33.44 
 
 		 689 aa  292  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.142326 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01572  TonB-dependent receptor, putative  30.47 
 
 		 686 aa  276  7e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6192  putative outer membrane receptor  29.23 
 
 		 765 aa  271  4e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.893416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0345  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 678 aa  263  1e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1684  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 717 aa  253  9.000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0676339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5111  TonB-dependent receptor plug  28.36 
 
 		 733 aa  153  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1472  TonB-dependent receptor plug  25.63 
 
 		 704 aa  152  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1310  TonB-dependent receptor plug  25.63 
 
 		 704 aa  152  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.475424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2804  outer membrane receptor protein  24.59 
 
 		 692 aa  107  6e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3112  TonB-dependent receptor  23.18 
 
 		 687 aa  91.7  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.589119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  27.53 
 
 		 1077 aa  75.5  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01819  outer membrane receptor protein, most likely Fe transport  23.02 
 
 		 716 aa  74.3  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000492197  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0274  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 		 1083 aa  69.7  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.302704 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7234  TonB-dependent receptor plug  30.3 
 
 		 1119 aa  67.8  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.507309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4448  TonB-dependent receptor  19.28 
 
 		 678 aa  65.9  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.634501  normal  0.211596 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  28.33 
 
 		 1063 aa  64.7  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2066  TonB-dependent receptor  21.25 
 
 		 709 aa  64.7  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06835  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  25.75 
 
 		 914 aa  64.3  0.000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0121  TonB-dependent receptor  20.36 
 
 		 681 aa  63.5  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.138382 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  25.39 
 
 		 1146 aa  63.5  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4491  TonB-dependent receptor, plug  26.58 
 
 		 1129 aa  63.5  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  29.33 
 
 		 1038 aa  63.9  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  23.39 
 
 		 696 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1274  TonB-dependent receptor plug  25.42 
 
 		 861 aa  62.8  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  27.18 
 
 		 1020 aa  62.4  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0815  TonB-dependent siderophore receptor  25.09 
 
 		 714 aa  62  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3258  TonB-dependent receptor plug  30.65 
 
 		 1099 aa  61.6  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363911  normal  0.0250929 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3424  TonB-dependent receptor  30.8 
 
 		 815 aa  61.6  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.053865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0136  TonB-dependent receptor plug  28.23 
 
 		 1108 aa  61.2  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  25.34 
 
 		 1107 aa  61.2  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  24.31 
 
 		 1059 aa  60.8  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  23.31 
 
 		 788 aa  60.8  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 757 aa  60.8  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0736  TonB-dependent receptor, plug  25.27 
 
 		 942 aa  60.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.877946  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0815  TonB-dependent siderophore receptor  24.73 
 
 		 714 aa  60.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806497  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 1045 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1057  TonB-dependent siderophore receptor  24.63 
 
 		 719 aa  59.7  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  25.53 
 
 		 1172 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0155  TonB-dependent siderophore receptor  24.37 
 
 		 677 aa  60.1  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133249 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  28.87 
 
 		 1127 aa  58.5  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3148  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 1119 aa  58.2  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0277  TonB-dependent receptor plug  23.2 
 
 		 1096 aa  58.2  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.97163  normal  0.971813 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  22.58 
 
 		 696 aa  58.2  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  22.08 
 
 		 701 aa  58.5  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12568  probable TonB-dependent receptor YncD precursor  24.22 
 
 		 762 aa  57.8  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  23.4 
 
 		 713 aa  58.2  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3196  TonB-dependent receptor plug  29.5 
 
 		 1099 aa  57.8  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  23.11 
 
 		 769 aa  57.8  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4329  TonB-dependent receptor, plug  26.42 
 
 		 1005 aa  57.8  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  23.05 
 
 		 713 aa  57.4  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  27.75 
 
 		 1056 aa  57  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4992  TonB-dependent receptor plug  29.14 
 
 		 1033 aa  57  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00275317  normal  0.224873 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3164  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 1093 aa  57.4  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5636  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 793 aa  56.6  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.734932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2667  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 1093 aa  57  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0190872  normal  0.932221 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2844  TonB-dependent siderophore receptor  25.49 
 
 		 782 aa  57.4  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 1019 aa  56.6  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  22.56 
 
 		 724 aa  57  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  24.86 
 
 		 1082 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3340  TonB-dependent receptor, putative  23.33 
 
 		 683 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  25.26 
 
 		 1094 aa  56.2  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3400  TonB-dependent receptor plug  29.34 
 
 		 1057 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04165  outer membrane protein  25.31 
 
 		 1071 aa  56.2  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  27.47 
 
 		 996 aa  56.2  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  29.35 
 
 		 1070 aa  56.6  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4175  TonB-dependent receptor plug  26.05 
 
 		 1099 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000931261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1601  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 1055 aa  56.6  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.709185 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2410  TonB-dependent receptor  19.79 
 
 		 683 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2896  TonB-dependent receptor  21.7 
 
 		 686 aa  56.6  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148838 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1855  TonB-dependent receptor, putative  19.74 
 
 		 693 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0314757  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  25.36 
 
 		 1059 aa  55.5  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  27.61 
 
 		 628 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1744  TonB-dependent receptor plug  27.55 
 
 		 1092 aa  55.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.196303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  25.98 
 
 		 1042 aa  55.5  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0784  TonB-dependent receptor plug  28.32 
 
 		 1013 aa  55.5  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 996 aa  55.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  23.79 
 
 		 1081 aa  55.1  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 1050 aa  55.5  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  26.89 
 
 		 1059 aa  55.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  25.97 
 
 		 1024 aa  55.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>