113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6192 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3038  TonB-dependent receptor  52.78 
 
 		 740 aa  733    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2413  TonB-dependent receptor, plug  51.63 
 
 		 718 aa  725    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0232072  normal  0.0153197 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6192  putative outer membrane receptor  100 
 
 		 765 aa  1568    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.893416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4063  TonB-dependent receptor plug  50.82 
 
 		 712 aa  702    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5240  TonB-dependent receptor  54.02 
 
 		 723 aa  746    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1004  TonB-dependent receptor plug  47.61 
 
 		 689 aa  639    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.142326 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5682  TonB-dependent receptor plug  52.39 
 
 		 672 aa  707    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.252502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2798  putative outer membrane receptor signal peptide protein  45.37 
 
 		 722 aa  597  1e-169  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.975651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3944  TonB-dependent receptor  44.82 
 
 		 689 aa  546  1e-154  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.677577  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2922  putative outer membrane receptor signal peptide protein  46.37 
 
 		 699 aa  543  1e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1233  TonB-dependent receptor  43.17 
 
 		 705 aa  544  1e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.345328  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2872  TonB-dependent receptor  41.55 
 
 		 676 aa  514  1e-144  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2180  TonB-dependent receptor, putative  35.76 
 
 		 765 aa  474  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1684  TonB-dependent receptor  38.81 
 
 		 717 aa  462  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0676339  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0737  TonB-dependent receptor, putative  39.94 
 
 		 692 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3541  TonB-dependent receptor  39.36 
 
 		 692 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0692  TonB-dependent receptor  38.34 
 
 		 678 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.218448  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01572  TonB-dependent receptor, putative  36.38 
 
 		 686 aa  389  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0345  TonB-dependent receptor  34.33 
 
 		 678 aa  344  5e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4827  TonB-dependent receptor, plug  30.77 
 
 		 748 aa  300  8e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1015  tonB-dependent receptor  31.03 
 
 		 750 aa  294  3e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6273  TonB-dependent receptor  30.46 
 
 		 736 aa  291  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000590633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1720  TonB-dependent receptor plug  30.34 
 
 		 760 aa  288  2.9999999999999996e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.864818  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04680  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 757 aa  284  4.0000000000000003e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.868178  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3901  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 734 aa  271  2.9999999999999997e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.707047  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1310  TonB-dependent receptor plug  24.11 
 
 		 704 aa  114  9e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.475424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1472  TonB-dependent receptor plug  24.11 
 
 		 704 aa  114  9e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5111  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 733 aa  111  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3112  TonB-dependent receptor  22.91 
 
 		 687 aa  74.3  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.589119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2804  outer membrane receptor protein  23.58 
 
 		 692 aa  69.3  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01819  outer membrane receptor protein, most likely Fe transport  24.46 
 
 		 716 aa  64.3  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000492197  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4534  putative TonB-dependent receptor protein  31.03 
 
 		 797 aa  62.4  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.38874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6080  putative TonB-dependent receptor  28.86 
 
 		 690 aa  60.8  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5430  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.91 
 
 		 614 aa  58.2  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0043717  normal  0.0207602 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6079  putative TonB-dependent receptor  30.56 
 
 		 680 aa  56.2  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0972806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2902  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 791 aa  55.8  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.119413 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1339  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 714 aa  55.8  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.368228 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  30.14 
 
 		 680 aa  54.3  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  32.86 
 
 		 634 aa  53.9  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4020  TonB-dependent vitamin B12 receptor  28.67 
 
 		 614 aa  53.5  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348064  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  33.91 
 
 		 628 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4200  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.67 
 
 		 614 aa  53.5  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101627  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4507  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.67 
 
 		 614 aa  53.5  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000315572  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  32.33 
 
 		 665 aa  52.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4050  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.67 
 
 		 614 aa  53.5  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00780594  decreased coverage  0.000540594 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28 
 
 		 614 aa  53.1  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  31.61 
 
 		 650 aa  52.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  31.61 
 
 		 650 aa  52.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  31.61 
 
 		 650 aa  52.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  31.61 
 
 		 650 aa  52.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  33.33 
 
 		 663 aa  52.8  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 663 aa  52.8  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0721  Outer membrane cobalamin receptor protein-like  30.41 
 
 		 640 aa  52.4  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1025  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 791 aa  52.8  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  33.33 
 
 		 663 aa  52.8  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  33.33 
 
 		 663 aa  52.8  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  33.33 
 
 		 663 aa  52.8  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  33.33 
 
 		 641 aa  52.4  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  33.33 
 
 		 663 aa  52.8  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  31.61 
 
 		 650 aa  52.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  33.33 
 
 		 659 aa  52.8  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2165  TonB-dependent vitamin B12 receptor  29.26 
 
 		 616 aa  51.6  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2621  TonB-dependent receptor, plug  26.44 
 
 		 695 aa  51.6  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  31.37 
 
 		 656 aa  51.6  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  26.49 
 
 		 613 aa  50.8  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4020  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.74 
 
 		 615 aa  50.4  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000194494  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 642 aa  49.7  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0142  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.92 
 
 		 630 aa  49.7  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000593825  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4073  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.92 
 
 		 630 aa  49.7  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000943492  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1926  TonB-dependent receptor  31.21 
 
 		 627 aa  49.3  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.201933  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  32.64 
 
 		 617 aa  48.9  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0963  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 614 aa  48.1  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.57 
 
 		 614 aa  47.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.57 
 
 		 614 aa  47.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2389  TonB-dependent receptor plug  29.73 
 
 		 615 aa  47.8  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000607441  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.57 
 
 		 614 aa  47.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2720  iron complex outermembrane recepter protein  26.98 
 
 		 631 aa  47.8  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83965  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.95 
 
 		 631 aa  47.8  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.57 
 
 		 614 aa  47.8  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.14 
 
 		 614 aa  47.8  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2219  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 692 aa  47  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1830  TonB-dependent receptor plug  28.19 
 
 		 616 aa  47  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821839 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.22 
 
 		 623 aa  47  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  32.71 
 
 		 628 aa  47.4  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3743  outer membrane receptor FepA  28.41 
 
 		 766 aa  47.4  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.325826  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00550  iron-enterobactin outer membrane transporter  28.14 
 
 		 746 aa  46.2  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000104738  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  30.56 
 
 		 682 aa  46.2  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.89 
 
 		 631 aa  46.2  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52230  outer membrane receptor FepA  30.51 
 
 		 742 aa  46.6  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.267722 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4579  outer membrane receptor FepA  30.51 
 
 		 742 aa  46.6  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0633  outer membrane receptor FepA  28.14 
 
 		 746 aa  46.2  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0603  outer membrane receptor FepA  28.14 
 
 		 746 aa  46.2  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00539  hypothetical protein  28.14 
 
 		 746 aa  46.2  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000136629  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3061  outer membrane receptor FepA  28.14 
 
 		 746 aa  46.2  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00912473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0602  outer membrane receptor FepA  28.14 
 
 		 746 aa  46.2  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0485  outer membrane receptor FepA  28.14 
 
 		 746 aa  46.2  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0667  outer membrane receptor FepA  28.14 
 
 		 746 aa  46.2  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0057  TonB-dependent receptor plug  34.69 
 
 		 1014 aa  46.2  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  28.17 
 
 		 646 aa  45.8  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3097  TonB-dependent receptor, plug  33.05 
 
 		 671 aa  45.8  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>