83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01572 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3541  TonB-dependent receptor  53.15 
 
 		 692 aa  699    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0737  TonB-dependent receptor, putative  53.82 
 
 		 692 aa  696    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0692  TonB-dependent receptor  51.25 
 
 		 678 aa  682    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.218448  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01572  TonB-dependent receptor, putative  100 
 
 		 686 aa  1399    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2922  putative outer membrane receptor signal peptide protein  42.77 
 
 		 699 aa  484  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5240  TonB-dependent receptor  42.02 
 
 		 723 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2798  putative outer membrane receptor signal peptide protein  41.37 
 
 		 722 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.975651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3038  TonB-dependent receptor  42.55 
 
 		 740 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1233  TonB-dependent receptor  41.73 
 
 		 705 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.345328  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2872  TonB-dependent receptor  40.87 
 
 		 676 aa  464  1e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4063  TonB-dependent receptor plug  42.24 
 
 		 712 aa  456  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2413  TonB-dependent receptor, plug  41.2 
 
 		 718 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0232072  normal  0.0153197 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3944  TonB-dependent receptor  38.86 
 
 		 689 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.677577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5682  TonB-dependent receptor plug  39.45 
 
 		 672 aa  438  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.252502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1004  TonB-dependent receptor plug  40.25 
 
 		 689 aa  422  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.142326 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1684  TonB-dependent receptor  38.39 
 
 		 717 aa  413  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0676339  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2180  TonB-dependent receptor, putative  36.83 
 
 		 765 aa  397  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6192  putative outer membrane receptor  36.38 
 
 		 765 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.893416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0345  TonB-dependent receptor  33.93 
 
 		 678 aa  322  1.9999999999999998e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1720  TonB-dependent receptor plug  34.4 
 
 		 760 aa  315  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.864818  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04680  TonB-dependent receptor  34.11 
 
 		 757 aa  295  2e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.868178  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4827  TonB-dependent receptor, plug  31.94 
 
 		 748 aa  291  2e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1015  tonB-dependent receptor  30.62 
 
 		 750 aa  286  8e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6273  TonB-dependent receptor  30.28 
 
 		 736 aa  280  9e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000590633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3901  TonB-dependent receptor  30.47 
 
 		 734 aa  276  7e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.707047  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1310  TonB-dependent receptor plug  25.31 
 
 		 704 aa  108  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.475424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1472  TonB-dependent receptor plug  25.31 
 
 		 704 aa  108  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5111  TonB-dependent receptor plug  26.67 
 
 		 733 aa  106  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2804  outer membrane receptor protein  25.14 
 
 		 692 aa  100  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01819  outer membrane receptor protein, most likely Fe transport  24.24 
 
 		 716 aa  80.9  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000492197  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1439  TonB-dependent receptor protein  25.67 
 
 		 688 aa  59.3  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2066  TonB-dependent receptor  22.53 
 
 		 709 aa  57  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2896  TonB-dependent receptor  23.37 
 
 		 686 aa  53.9  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148838 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  24.46 
 
 		 617 aa  53.5  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3142  TonB-dependent siderophore receptor  22.22 
 
 		 688 aa  52.8  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  33.12 
 
 		 703 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3260  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 739 aa  52.4  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  22.68 
 
 		 821 aa  52.4  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 688 aa  52  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3112  TonB-dependent receptor  23.51 
 
 		 687 aa  51.6  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.589119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  23.59 
 
 		 702 aa  51.2  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  23.59 
 
 		 702 aa  51.2  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  21.11 
 
 		 695 aa  51.2  0.00007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2580  iron(III) compound receptor  25.18 
 
 		 718 aa  50.8  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000113666  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2380  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 748 aa  50.4  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.357323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  22.52 
 
 		 817 aa  50.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  25.26 
 
 		 712 aa  49.3  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2500  TonB-dependent receptor  23.67 
 
 		 757 aa  49.7  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0249349  hitchhiker  0.00279942 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  33.75 
 
 		 703 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 742 aa  48.5  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.22 
 
 		 623 aa  48.5  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  25.27 
 
 		 701 aa  48.5  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0537  TonB-dependent siderophore receptor  22.99 
 
 		 749 aa  48.5  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0190971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1526  TonB-dependent receptor  21.73 
 
 		 733 aa  47.8  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208571  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003567  ferrichrome-iron receptor  22.71 
 
 		 740 aa  47.4  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4098  TonB-dependent siderophore receptor  25.26 
 
 		 754 aa  47.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3046  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 722 aa  47.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.770987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001284  putative iron(III) compound receptor  23.25 
 
 		 701 aa  47  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000165675  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  23.1 
 
 		 690 aa  47  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1886  TonB-dependent receptor plug  20.96 
 
 		 729 aa  47.4  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.270024  normal  0.821548 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3577  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  31.43 
 
 		 718 aa  47  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.601026  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  27.27 
 
 		 734 aa  46.6  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  23.4 
 
 		 706 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 690 aa  46.2  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4276  TonB-dependent receptor  22.96 
 
 		 798 aa  46.6  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.78 
 
 		 615 aa  45.8  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  26.22 
 
 		 613 aa  45.8  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0535  hypothetical protein  24.29 
 
 		 730 aa  45.8  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47140  putative TonB-dependent receptor  25 
 
 		 732 aa  45.8  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01762  hypothetical protein  25.69 
 
 		 714 aa  45.4  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05640  hypothetical protein  23.82 
 
 		 730 aa  45.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  34.58 
 
 		 710 aa  45.4  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2744  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 686 aa  45.1  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.339912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2779  TonB-dependent siderophore receptor  23.51 
 
 		 863 aa  45.4  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  24.59 
 
 		 707 aa  45.1  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  29.09 
 
 		 709 aa  44.7  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  24.06 
 
 		 701 aa  45.1  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 		 750 aa  44.7  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3269  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 688 aa  44.3  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.35442 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1735  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 713 aa  44.3  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00374581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  23.72 
 
 		 799 aa  44.3  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2840  TonB-dependent siderophore receptor  33.88 
 
 		 849 aa  43.9  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000068938  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1496  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 		 716 aa  43.9  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>