84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2180 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2180  TonB-dependent receptor, putative  100 
 
 		 765 aa  1587    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2872  TonB-dependent receptor  49.33 
 
 		 676 aa  669    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2798  putative outer membrane receptor signal peptide protein  44.67 
 
 		 722 aa  570  1e-161  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.975651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3944  TonB-dependent receptor  42.84 
 
 		 689 aa  550  1e-155  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.677577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1233  TonB-dependent receptor  40.67 
 
 		 705 aa  520  1e-146  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.345328  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5240  TonB-dependent receptor  41.41 
 
 		 723 aa  515  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4063  TonB-dependent receptor plug  42.52 
 
 		 712 aa  502  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2413  TonB-dependent receptor, plug  41.19 
 
 		 718 aa  500  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0232072  normal  0.0153197 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5682  TonB-dependent receptor plug  42.19 
 
 		 672 aa  498  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.252502  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2922  putative outer membrane receptor signal peptide protein  41.42 
 
 		 699 aa  488  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3541  TonB-dependent receptor  40.61 
 
 		 692 aa  487  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3038  TonB-dependent receptor  39.78 
 
 		 740 aa  488  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0692  TonB-dependent receptor  40.72 
 
 		 678 aa  484  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.218448  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6192  putative outer membrane receptor  37.79 
 
 		 765 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.893416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1684  TonB-dependent receptor  38.04 
 
 		 717 aa  466  9.999999999999999e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0676339  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0737  TonB-dependent receptor, putative  40.24 
 
 		 692 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1004  TonB-dependent receptor plug  39.75 
 
 		 689 aa  458  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.142326 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01572  TonB-dependent receptor, putative  36.83 
 
 		 686 aa  397  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0345  TonB-dependent receptor  36.28 
 
 		 678 aa  392  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04680  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 757 aa  332  1e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.868178  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3901  TonB-dependent receptor  31.52 
 
 		 734 aa  327  6e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.707047  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6273  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 736 aa  316  9e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000590633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1015  tonB-dependent receptor  30.37 
 
 		 750 aa  303  1e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1720  TonB-dependent receptor plug  30.1 
 
 		 760 aa  301  4e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.864818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4827  TonB-dependent receptor, plug  29.66 
 
 		 748 aa  290  5.0000000000000004e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1472  TonB-dependent receptor plug  27.27 
 
 		 704 aa  127  6e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1310  TonB-dependent receptor plug  27.27 
 
 		 704 aa  127  6e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.475424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5111  TonB-dependent receptor plug  26.76 
 
 		 733 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2804  outer membrane receptor protein  24.47 
 
 		 692 aa  100  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01819  outer membrane receptor protein, most likely Fe transport  23.79 
 
 		 716 aa  75.1  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000492197  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1855  TonB-dependent receptor, putative  21.31 
 
 		 693 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0314757  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3340  TonB-dependent receptor, putative  21.08 
 
 		 683 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2410  TonB-dependent receptor  21.27 
 
 		 683 aa  60.8  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3112  TonB-dependent receptor  21.88 
 
 		 687 aa  57.8  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.589119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2591  TonB-dependent siderophore receptor  24.55 
 
 		 797 aa  56.2  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0363  TonB-dependent receptor plug  29.86 
 
 		 649 aa  55.1  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0350  TonB-dependent receptor  29.86 
 
 		 651 aa  54.7  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.513607  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0336  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 		 649 aa  54.3  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  24.29 
 
 		 638 aa  54.3  0.000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5430  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.95 
 
 		 614 aa  53.1  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0043717  normal  0.0207602 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2066  TonB-dependent receptor  21.84 
 
 		 709 aa  51.2  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0721  Outer membrane cobalamin receptor protein-like  28.19 
 
 		 640 aa  51.2  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2477  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 681 aa  51.2  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2053  TonB-dependent siderophore receptor  24.69 
 
 		 719 aa  51.2  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 642 aa  50.8  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3272  TonB-dependent siderophore receptor  24.69 
 
 		 750 aa  50.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46801  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 762 aa  49.7  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  23.94 
 
 		 634 aa  50.1  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  24.4 
 
 		 689 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.37 
 
 		 614 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4050  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.16 
 
 		 614 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00780594  decreased coverage  0.000540594 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4020  TonB-dependent vitamin B12 receptor  30.16 
 
 		 614 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348064  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4507  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.16 
 
 		 614 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000315572  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4200  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.16 
 
 		 614 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101627  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  24.84 
 
 		 616 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2165  TonB-dependent vitamin B12 receptor  29.23 
 
 		 616 aa  48.9  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4484  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 726 aa  48.9  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.429644  normal  0.265878 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  26.8 
 
 		 617 aa  48.1  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4119  TonB-dependent vitamin B12 receptor  24.84 
 
 		 616 aa  47.8  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  22.61 
 
 		 734 aa  47.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03467  TonB-dependent outer membrane Receptor  20.86 
 
 		 712 aa  47.4  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1926  TonB-dependent receptor  30.15 
 
 		 627 aa  47.4  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.201933  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 682 aa  47  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  31.63 
 
 		 628 aa  46.6  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2005  TonB-dependent siderophore receptor  21.27 
 
 		 724 aa  46.2  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.22147  normal  0.931942 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 665 aa  46.6  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  26.14 
 
 		 628 aa  45.8  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1459  TonB-dependent receptor  19.35 
 
 		 647 aa  45.4  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.208108  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  23.25 
 
 		 614 aa  45.4  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.68 
 
 		 614 aa  45.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.68 
 
 		 614 aa  45.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.68 
 
 		 614 aa  45.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.68 
 
 		 614 aa  45.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  21.74 
 
 		 738 aa  45.4  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2896  TonB-dependent receptor  22 
 
 		 686 aa  45.1  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148838 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.69 
 
 		 631 aa  45.1  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.68 
 
 		 614 aa  45.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4827  TonB-dependent siderophore receptor  22.52 
 
 		 690 aa  44.7  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497518 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0621  TonB-dependent receptor plug  27.54 
 
 		 713 aa  44.7  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1961  TonB-dependent siderophore receptor  21.9 
 
 		 705 aa  44.7  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.353089 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2282  TonB-dependent siderophore receptor  20.95 
 
 		 724 aa  44.3  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.217728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 715 aa  44.3  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2735  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 641 aa  43.9  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00964506  normal  0.0993289 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5609  putative TonB-dependent receptor protein  26.35 
 
 		 727 aa  43.9  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.195075 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>