123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3541 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0737  TonB-dependent receptor, putative  92.05 
 
 		 692 aa  1314    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01572  TonB-dependent receptor, putative  53.15 
 
 		 686 aa  699    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3541  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 692 aa  1409    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0692  TonB-dependent receptor  86.52 
 
 		 678 aa  1207    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.218448  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2798  putative outer membrane receptor signal peptide protein  45.67 
 
 		 722 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.975651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5240  TonB-dependent receptor  46.12 
 
 		 723 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2413  TonB-dependent receptor, plug  45.64 
 
 		 718 aa  524  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0232072  normal  0.0153197 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2922  putative outer membrane receptor signal peptide protein  45.55 
 
 		 699 aa  521  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3944  TonB-dependent receptor  43.4 
 
 		 689 aa  514  1e-144  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.677577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3038  TonB-dependent receptor  44.81 
 
 		 740 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4063  TonB-dependent receptor plug  44.53 
 
 		 712 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2872  TonB-dependent receptor  42.49 
 
 		 676 aa  502  1e-141  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5682  TonB-dependent receptor plug  42.57 
 
 		 672 aa  491  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.252502  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2180  TonB-dependent receptor, putative  40.61 
 
 		 765 aa  487  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1004  TonB-dependent receptor plug  43.43 
 
 		 689 aa  480  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.142326 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1233  TonB-dependent receptor  41.08 
 
 		 705 aa  478  1e-133  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.345328  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1684  TonB-dependent receptor  39.07 
 
 		 717 aa  464  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0676339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6192  putative outer membrane receptor  39.36 
 
 		 765 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.893416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0345  TonB-dependent receptor  36.73 
 
 		 678 aa  375  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1015  tonB-dependent receptor  31.27 
 
 		 750 aa  313  7.999999999999999e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1720  TonB-dependent receptor plug  30.89 
 
 		 760 aa  309  1.0000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.864818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3901  TonB-dependent receptor  32.4 
 
 		 734 aa  308  3e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.707047  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6273  TonB-dependent receptor  30.3 
 
 		 736 aa  303  5.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000590633  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04680  TonB-dependent receptor  32.29 
 
 		 757 aa  300  6e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.868178  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4827  TonB-dependent receptor, plug  31.03 
 
 		 748 aa  296  6e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1472  TonB-dependent receptor plug  27.31 
 
 		 704 aa  117  8.999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1310  TonB-dependent receptor plug  27.31 
 
 		 704 aa  117  8.999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.475424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5111  TonB-dependent receptor plug  26.64 
 
 		 733 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2804  outer membrane receptor protein  23.81 
 
 		 692 aa  74.3  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3112  TonB-dependent receptor  22.84 
 
 		 687 aa  74.3  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.589119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01819  outer membrane receptor protein, most likely Fe transport  24.88 
 
 		 716 aa  72  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000492197  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  25.09 
 
 		 700 aa  65.5  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 700 aa  64.7  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 700 aa  64.7  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 700 aa  64.3  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 700 aa  64.3  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 700 aa  63.9  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03378  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 798 aa  61.6  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0156374  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  24.37 
 
 		 700 aa  61.6  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  24.37 
 
 		 700 aa  61.6  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 700 aa  61.2  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  24.53 
 
 		 728 aa  60.1  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1841  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 743 aa  60.1  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000217461  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  24.2 
 
 		 706 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1794  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 744 aa  58.2  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000583553  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  23.95 
 
 		 706 aa  58.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2310  TonB-dependent receptor  22.65 
 
 		 732 aa  57.8  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0299343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  23.95 
 
 		 706 aa  57.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2484  TonB-dependent receptor  23.84 
 
 		 744 aa  57.4  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000223864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  24.61 
 
 		 705 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1802  TonB-dependent receptor  23.4 
 
 		 743 aa  57  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  23.62 
 
 		 706 aa  57  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2715  TonB-dependent receptor  22.35 
 
 		 733 aa  56.2  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  23.62 
 
 		 721 aa  56.6  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  23.62 
 
 		 706 aa  56.6  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1660  TonB-dependent receptor  22.94 
 
 		 729 aa  55.1  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000750921  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3465  TonB-dependent siderophore receptor  24.84 
 
 		 720 aa  55.5  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.47616  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3577  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  22.84 
 
 		 718 aa  54.7  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.601026  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  24.59 
 
 		 720 aa  54.7  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0485  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 702 aa  53.9  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.517963  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  26.16 
 
 		 721 aa  53.9  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 742 aa  53.5  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  26.13 
 
 		 707 aa  53.5  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  25.25 
 
 		 720 aa  53.1  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2953  TonB-dependent receptor  21.23 
 
 		 700 aa  52.4  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.191776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0815  TonB-dependent siderophore receptor  27.62 
 
 		 714 aa  52.4  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0155  TonB-dependent siderophore receptor  27.41 
 
 		 677 aa  52  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133249 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0815  TonB-dependent siderophore receptor  27.62 
 
 		 714 aa  52  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806497  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001284  putative iron(III) compound receptor  24.83 
 
 		 701 aa  52  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000165675  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 715 aa  51.2  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1080  TonB-dependent siderophore receptor  24.26 
 
 		 720 aa  50.8  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210628 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2380  TonB-dependent receptor  23.78 
 
 		 748 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.357323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2500  TonB-dependent receptor  23.78 
 
 		 757 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0249349  hitchhiker  0.00279942 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0089  TonB-dependent siderophore receptor  25.37 
 
 		 699 aa  50.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.26085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2881  TonB-dependent siderophore receptor  24.42 
 
 		 714 aa  50.1  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1828  TonB-dependent receptor  23.3 
 
 		 712 aa  50.4  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000226653  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  22.58 
 
 		 702 aa  50.1  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  22.58 
 
 		 702 aa  50.1  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1526  TonB-dependent receptor  21.7 
 
 		 733 aa  49.3  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208571  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2752  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 736 aa  49.3  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000933457  normal  0.355865 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1886  TonB-dependent receptor plug  25.24 
 
 		 729 aa  49.7  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.270024  normal  0.821548 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 715 aa  48.9  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  22.16 
 
 		 706 aa  48.9  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1440  TonB dependent, hydroxamate-type ferrisiderophore, outer membrane receptor  25.37 
 
 		 699 aa  48.5  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453975  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2662  TonB system receptor  22.62 
 
 		 680 aa  48.1  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0618091  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  24.59 
 
 		 723 aa  48.1  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 794 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  24.92 
 
 		 724 aa  47.8  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1735  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 713 aa  47.8  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00374581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  23.33 
 
 		 817 aa  47.8  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4276  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 		 798 aa  47  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  32.38 
 
 		 646 aa  47.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3258  TonB-dependent siderophore receptor  26.33 
 
 		 736 aa  47  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.875335  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  24.59 
 
 		 724 aa  47.4  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01762  hypothetical protein  24.25 
 
 		 714 aa  46.6  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  26.16 
 
 		 708 aa  46.6  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  24.52 
 
 		 828 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2678  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 704 aa  47  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00160385  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0523  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 803 aa  46.2  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  26.04 
 
 		 696 aa  46.6  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>