More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2678 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0468  TonB-dependent receptor  49.93 
 
 
700 aa  684    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1522  TonB-dependent receptor  62.71 
 
 
701 aa  916    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2941  TonB-dependent receptor  63.14 
 
 
701 aa  927    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.80569  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2678  TonB-dependent receptor  100 
 
 
704 aa  1442    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00160385  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1044  TonB-dependent receptor  44.33 
 
 
721 aa  575  1.0000000000000001e-162  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0401  TonB-dependent receptor  38.65 
 
 
723 aa  489  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000584805  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0977  TonB-dependent receptor  38.2 
 
 
718 aa  482  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0303  TonB-dependent receptor  37.5 
 
 
725 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017573  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0291  TonB-dependent receptor  37.5 
 
 
725 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000897487  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0298  TonB-dependent receptor  37.36 
 
 
725 aa  475  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000594671  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0286  TonB-dependent receptor  37.66 
 
 
723 aa  474  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000746849  unclonable  0.000000000233468 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0299  TonB-dependent receptor  37.48 
 
 
725 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00020356  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0286  TonB-dependent receptor  37.93 
 
 
723 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000335146  unclonable  0.000000000154672 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3733  TonB-dependent receptor  37.83 
 
 
723 aa  465  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000345554  unclonable  0.000038397 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2145  TonB-dependent receptor  39.2 
 
 
809 aa  439  9.999999999999999e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.085277  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06011  hypothetical protein  37.92 
 
 
713 aa  429  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0029  TonB-dependent receptor  34.26 
 
 
716 aa  390  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.241491  normal  0.0713753 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3918  TonB-dependent receptor  32.78 
 
 
728 aa  384  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.665207  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2840  TonB-dependent siderophore receptor  33.19 
 
 
849 aa  306  9.000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000068938  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1688  TonB-dependent receptor  31.05 
 
 
710 aa  279  1e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00738992  normal  0.0180451 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  30.21 
 
 
783 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0392  TonB-dependent receptor, plug  28.53 
 
 
717 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.829697  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1496  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 
716 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4213  putative ferric aerobactin receptor  29.73 
 
 
721 aa  260  5.0000000000000005e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2885  histidine kinase  30.13 
 
 
704 aa  252  1e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000018886  decreased coverage  0.000177766 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0558  TonB-dependent receptor plug  29.73 
 
 
817 aa  251  4e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000727933  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4423.1  ferric aerobactin receptor  42.06 
 
 
332 aa  250  7e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46640  siderophore receptor  30.27 
 
 
813 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.010692  hitchhiker  0.000000903307 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1820  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 
697 aa  249  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000291802  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4019  siderophore receptor  30.01 
 
 
816 aa  248  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.752702  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0587  hemin uptake system outer membrane receptor  28.33 
 
 
771 aa  239  2e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.75575  normal  0.678568 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5892  TonB-dependent siderophore receptor  29.71 
 
 
843 aa  237  5.0000000000000005e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1118  TonB-dependent siderophore receptor  29.04 
 
 
839 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220964  normal  0.940906 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1430  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 
738 aa  229  1e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1394  TonB-dependent receptor, plug  28.82 
 
 
713 aa  228  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0833322 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2402  TonB-dependent receptor, plug  28.67 
 
 
724 aa  228  4e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000227129  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01762  hypothetical protein  30.11 
 
 
714 aa  221  3e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4630  ferric aerobactin receptor IutA  28.34 
 
 
732 aa  219  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00873  ferric siderophore receptor outer membrane signal peptide protein  28.26 
 
 
812 aa  212  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193176  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0710  TonB-dependent siderophore receptor  28.66 
 
 
726 aa  208  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0782  TonB-dependent siderophore receptor  28.66 
 
 
726 aa  206  9e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0951  TonB-dependent siderophore receptor  28.02 
 
 
732 aa  206  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0194  TonB-dependent siderophore receptor  28.66 
 
 
726 aa  206  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0233266 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0587  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 
753 aa  201  5e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.210295 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0918  TonB-dependent siderophore receptor  27.85 
 
 
746 aa  199  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0582  TonB-dependent receptor, plug  25.39 
 
 
709 aa  196  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000470025  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3178  ferric aerobactin receptor IutA  27.25 
 
 
733 aa  195  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.911837 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61850  putative TonB-dependent receptor  28.25 
 
 
742 aa  192  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00865386 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5381  putative TonB-dependent receptor  28.5 
 
 
764 aa  190  7e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0304  TonB-dependent siderophore receptor  26.25 
 
 
745 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0244305  normal  0.816396 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3720  TonB-dependent siderophore receptor  26.58 
 
 
745 aa  183  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00118596  normal  0.0278628 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3260  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 
739 aa  182  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3089  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 
758 aa  181  4.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.329983  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0075  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 
751 aa  179  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.612436  normal  0.5792 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0299  TonB-dependent siderophore receptor  25.79 
 
 
745 aa  179  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000445581  hitchhiker  0.000163743 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0279  ferric aerobactin receptor precursor  25.4 
 
 
723 aa  171  5e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.652222  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000078  aerobactin siderophore receptor iutA  25.94 
 
 
723 aa  166  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.709087  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1106  TonB-dependent receptor, plug  25.34 
 
 
755 aa  166  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3544  TonB-dependent siderophore receptor  26.6 
 
 
808 aa  157  9e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1817  TonB-dependent siderophore receptor  25.28 
 
 
808 aa  154  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.673878  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1056  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 
698 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2193  TonB-dependent siderophore receptor  32.05 
 
 
817 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.819603  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4090  TonB-dependent receptor  23.89 
 
 
705 aa  94  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  30.97 
 
 
646 aa  75.9  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2276  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 
751 aa  74.7  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1064  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 
661 aa  73.9  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00188221  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001068  vibrioferrin receptor PvuA  23.65 
 
 
712 aa  71.2  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  33.17 
 
 
639 aa  70.9  0.00000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1262  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 
651 aa  69.7  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.612585  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2341  TonB-dependent receptor  34.71 
 
 
764 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0570  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  25.81 
 
 
675 aa  69.3  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.168599  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  32.7 
 
 
633 aa  68.9  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  23.05 
 
 
697 aa  67.4  0.0000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1006  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  28.34 
 
 
759 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  28.74 
 
 
862 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2280  TonB-dependent siderophore receptor  22.84 
 
 
742 aa  67  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  27.95 
 
 
862 aa  67  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  31.67 
 
 
743 aa  66.6  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  35.64 
 
 
762 aa  66.6  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  22.45 
 
 
698 aa  65.5  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  22.45 
 
 
698 aa  65.5  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  22.45 
 
 
698 aa  65.5  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 
845 aa  65.1  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 
698 aa  65.1  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1486  TonB-dependent receptor, plug  32.39 
 
 
677 aa  65.5  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.243313  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  37.18 
 
 
665 aa  65.5  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1115  TonB-dependent receptor  31.84 
 
 
649 aa  65.1  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.95294  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1459  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 
647 aa  64.7  0.000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.208108  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1014  TonB-dependent receptor-related protein  24.17 
 
 
647 aa  64.7  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  28.34 
 
 
862 aa  64.3  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  22.69 
 
 
675 aa  64.7  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2889  outer membrane receptor FepA  35.53 
 
 
724 aa  63.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3075  outer membrane receptor FepA  35.53 
 
 
724 aa  63.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203578  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2919  outer membrane receptor FepA  32.26 
 
 
724 aa  63.9  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.91274  normal  0.0854265 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2953  outer membrane receptor FepA  35.53 
 
 
724 aa  63.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246738  hitchhiker  0.000000000736095 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  32.47 
 
 
618 aa  62.8  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  22.4 
 
 
726 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3964  outer membrane receptor FepA  32.39 
 
 
746 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364367  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 
736 aa  63.2  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  28.17 
 
 
634 aa  62.8  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>