More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1472 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_5111  TonB-dependent receptor plug  88.62 
 
 		 733 aa  1247    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1310  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 704 aa  1402    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.475424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1472  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 704 aa  1402    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2804  outer membrane receptor protein  30.51 
 
 		 692 aa  209  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3901  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 734 aa  154  5e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.707047  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4063  TonB-dependent receptor plug  25.63 
 
 		 712 aa  150  7e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2922  putative outer membrane receptor signal peptide protein  25.24 
 
 		 699 aa  146  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6273  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 736 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000590633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01819  outer membrane receptor protein, most likely Fe transport  27.81 
 
 		 716 aa  139  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000492197  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04680  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 757 aa  139  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.868178  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5682  TonB-dependent receptor plug  26.58 
 
 		 672 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.252502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3038  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 740 aa  135  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5240  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 723 aa  132  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2413  TonB-dependent receptor, plug  26.08 
 
 		 718 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0232072  normal  0.0153197 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0345  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 678 aa  130  6e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2798  putative outer membrane receptor signal peptide protein  26.23 
 
 		 722 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.975651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1004  TonB-dependent receptor plug  25.42 
 
 		 689 aa  130  9.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.142326 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2180  TonB-dependent receptor, putative  27.27 
 
 		 765 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1015  tonB-dependent receptor  23.79 
 
 		 750 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0737  TonB-dependent receptor, putative  27.37 
 
 		 692 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3541  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 692 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4827  TonB-dependent receptor, plug  26.57 
 
 		 748 aa  118  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3944  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 689 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.677577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1720  TonB-dependent receptor plug  23.39 
 
 		 760 aa  117  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.864818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0692  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 678 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.218448  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6192  putative outer membrane receptor  24.11 
 
 		 765 aa  114  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.893416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3112  TonB-dependent receptor  29.16 
 
 		 687 aa  113  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.589119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1684  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 717 aa  108  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0676339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01572  TonB-dependent receptor, putative  25.51 
 
 		 686 aa  108  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2872  TonB-dependent receptor  23.79 
 
 		 676 aa  107  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1233  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 		 705 aa  105  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.345328  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3340  TonB-dependent receptor, putative  24.18 
 
 		 683 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2410  TonB-dependent receptor  23.54 
 
 		 683 aa  98.2  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1855  TonB-dependent receptor, putative  22.87 
 
 		 693 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0314757  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2550  TonB-dependent receptor plug  26.52 
 
 		 775 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182788  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  23.79 
 
 		 700 aa  80.9  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  23.79 
 
 		 700 aa  80.9  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  23.79 
 
 		 700 aa  80.5  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  23.79 
 
 		 700 aa  80.5  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  23.79 
 
 		 700 aa  80.5  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  23.61 
 
 		 700 aa  79  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  23.79 
 
 		 700 aa  79  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  24.4 
 
 		 721 aa  78.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 		 700 aa  79  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  23.61 
 
 		 700 aa  79  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  24.4 
 
 		 706 aa  78.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  24.4 
 
 		 706 aa  77.8  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  24.4 
 
 		 706 aa  77.4  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  24.4 
 
 		 706 aa  77.4  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  23.27 
 
 		 762 aa  75.9  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2896  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 		 686 aa  73.9  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148838 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2066  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 709 aa  71.2  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  24.47 
 
 		 653 aa  70.5  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3446  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.72 
 
 		 717 aa  70.5  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494808  decreased coverage  0.00031135 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1741  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.84 
 
 		 661 aa  69.7  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000016514  normal  0.0458944 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4681  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 704 aa  68.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0656736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  24.59 
 
 		 659 aa  67.8  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4448  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 678 aa  67.8  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.634501  normal  0.211596 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02129  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 		 667 aa  67.4  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.220582  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4390  TonB-dependent receptor  24.95 
 
 		 704 aa  67  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3269  TonB-dependent receptor  22.72 
 
 		 688 aa  67  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.35442 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  24.11 
 
 		 663 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  23.94 
 
 		 663 aa  66.2  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  24.11 
 
 		 663 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  23.94 
 
 		 663 aa  66.2  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  23.94 
 
 		 663 aa  66.2  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2795  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 701 aa  66.2  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  23.94 
 
 		 663 aa  66.2  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  24.33 
 
 		 641 aa  65.1  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1111  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.96 
 
 		 754 aa  63.9  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.192516 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  24.87 
 
 		 693 aa  63.9  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  30.14 
 
 		 650 aa  63.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  22.37 
 
 		 686 aa  62.8  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  29.45 
 
 		 650 aa  63.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  30.14 
 
 		 650 aa  63.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 635 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  30.14 
 
 		 650 aa  63.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  30.14 
 
 		 650 aa  63.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  42.98 
 
 		 619 aa  62.8  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2631  TonB-dependent receptor domain-containing protein  24.94 
 
 		 646 aa  62.8  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.221793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1328  TonB-dependent receptor  23.63 
 
 		 798 aa  62.4  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0322179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4030  TonB-dependent receptor:Lipocalin  34.5 
 
 		 713 aa  62.4  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  23.05 
 
 		 715 aa  62  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3176  TonB-dependent siderophore receptor  28.21 
 
 		 653 aa  62  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4857  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  26.04 
 
 		 660 aa  61.6  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.803267 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0621  TonB-dependent receptor plug  27.48 
 
 		 713 aa  61.6  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 653 aa  61.6  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3802  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  26.04 
 
 		 660 aa  61.2  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.241464 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  23.47 
 
 		 728 aa  61.2  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3472  TonB-dependent siderophore receptor  29.91 
 
 		 653 aa  60.8  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0503687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0121  TonB-dependent receptor  21.69 
 
 		 681 aa  60.1  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.138382 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1014  TonB-dependent receptor-related protein  24.23 
 
 		 647 aa  60.1  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1245  TonB-dependent receptor, plug  24.65 
 
 		 636 aa  60.5  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4029  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 719 aa  59.3  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  29.95 
 
 		 646 aa  59.3  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  23.93 
 
 		 705 aa  59.3  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1231  TonB-dependent receptor  23.24 
 
 		 678 aa  60.1  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3576  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 653 aa  59.7  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.313951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  32.56 
 
 		 634 aa  58.9  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  23.39 
 
 		 742 aa  58.5  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>