More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3269 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0121  TonB-dependent receptor  59.4 
 
 		 681 aa  808    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.138382 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3269  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 688 aa  1411    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.35442 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2410  TonB-dependent receptor  43.56 
 
 		 683 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3340  TonB-dependent receptor, putative  42.65 
 
 		 683 aa  524  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2896  TonB-dependent receptor  41.6 
 
 		 686 aa  511  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148838 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1855  TonB-dependent receptor, putative  42.45 
 
 		 693 aa  511  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0314757  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2066  TonB-dependent receptor  40.41 
 
 		 709 aa  483  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4448  TonB-dependent receptor  40.24 
 
 		 678 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.634501  normal  0.211596 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0747  TonB-dependent receptor  36.77 
 
 		 683 aa  426  1e-118  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.582563  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0836  TonB-dependent receptor for iron transport  36.62 
 
 		 683 aa  424  1e-117  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0639266  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02129  TonB-dependent receptor  38.44 
 
 		 667 aa  419  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.220582  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3112  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 687 aa  144  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.589119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4624  TonB-dependent siderophore receptor  24.07 
 
 		 797 aa  105  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185618  decreased coverage  0.0000000123032 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4755  TonB-dependent siderophore receptor  23.3 
 
 		 797 aa  104  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.251254  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  23.82 
 
 		 707 aa  102  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4761  TonB-dependent siderophore receptor  23.18 
 
 		 797 aa  101  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  22.64 
 
 		 710 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 705 aa  98.6  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3280  TonB-dependent siderophore receptor  30.86 
 
 		 707 aa  96.7  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0713327  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  22.78 
 
 		 770 aa  94  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  22.5 
 
 		 710 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  22.81 
 
 		 681 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  22.74 
 
 		 706 aa  90.5  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  23.01 
 
 		 742 aa  90.1  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  25.05 
 
 		 728 aa  89.4  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  22.89 
 
 		 710 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  23.34 
 
 		 694 aa  88.6  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  24.95 
 
 		 706 aa  87.4  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  25.14 
 
 		 706 aa  86.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  25.14 
 
 		 706 aa  87  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  25.14 
 
 		 721 aa  87  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  25.14 
 
 		 706 aa  87  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03467  TonB-dependent outer membrane Receptor  24.04 
 
 		 712 aa  85.9  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  22.85 
 
 		 715 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 709 aa  84.7  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1526  TonB-dependent siderophore receptor  22.87 
 
 		 724 aa  84.3  0.000000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.970314  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2804  outer membrane receptor protein  23.24 
 
 		 692 aa  83.6  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  24.38 
 
 		 706 aa  82.4  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0022  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 		 697 aa  82.8  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000255766 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3417  TonB dependent outer membrane ferrichrome-iron receptor  24.53 
 
 		 715 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  24.38 
 
 		 706 aa  82.4  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  23.86 
 
 		 675 aa  83.2  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 715 aa  82.4  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1061  TonB-dependent receptor, plug  24.47 
 
 		 691 aa  82  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09350  TonB-dependent siderophore receptor  22.82 
 
 		 704 aa  80.9  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3062  TonB-dependent siderophore receptor  24.61 
 
 		 715 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.173013 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  25.08 
 
 		 711 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  23.61 
 
 		 755 aa  79  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  24.05 
 
 		 707 aa  79  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  22.11 
 
 		 817 aa  78.2  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2060  TonB-dependent siderophore receptor  22.41 
 
 		 708 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.267326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  24.6 
 
 		 708 aa  77.8  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1931  TonB-dependent siderophore receptor  24.76 
 
 		 723 aa  77.8  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  22.76 
 
 		 700 aa  77.8  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3731  putative ferrisiderophore receptor  26.07 
 
 		 728 aa  77.8  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4363  TonB-dependent siderophore receptor  21.47 
 
 		 706 aa  77.8  0.0000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000323777  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4307  TonB-dependent siderophore receptor  21.47 
 
 		 706 aa  77.4  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000234699  hitchhiker  0.000000000225287 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  22.5 
 
 		 688 aa  77.4  0.0000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  25.61 
 
 		 709 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  22.87 
 
 		 700 aa  77  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  22.66 
 
 		 700 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  22.87 
 
 		 700 aa  77  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2047  TonB-dependent siderophore receptor  23.76 
 
 		 716 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977961 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2053  TonB-dependent siderophore receptor  24.05 
 
 		 719 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  23.21 
 
 		 700 aa  75.5  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  22.19 
 
 		 700 aa  75.5  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  22.19 
 
 		 700 aa  75.5  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2054  TonB-dependent siderophore receptor  23.84 
 
 		 703 aa  75.5  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.314681  normal  0.98162 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  22.56 
 
 		 828 aa  75.1  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22830  TonB-dependent receptor  23.41 
 
 		 678 aa  75.1  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0688062  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  24.92 
 
 		 708 aa  75.1  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  22.61 
 
 		 726 aa  74.3  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  23.28 
 
 		 731 aa  74.3  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  24.07 
 
 		 706 aa  74.7  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  21.66 
 
 		 836 aa  74.3  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  25.72 
 
 		 694 aa  74.3  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0537  TonB-dependent siderophore receptor  22.43 
 
 		 749 aa  73.9  0.000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0190971  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  23.03 
 
 		 700 aa  73.6  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4504  TonB-dependent siderophore receptor  21.41 
 
 		 703 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000141313  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  23.35 
 
 		 782 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  23.03 
 
 		 700 aa  73.6  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3709  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 681 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  26.12 
 
 		 730 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3640  TonB-dependent siderophore receptor  21.23 
 
 		 708 aa  73.2  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168279  normal  0.0985281 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3090  ferric vibrioferrin receptor  23.75 
 
 		 690 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0290295  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4362  TonB-dependent siderophore receptor  21.33 
 
 		 706 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000023504  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  23.86 
 
 		 792 aa  73.9  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2795  TonB-dependent receptor  24.95 
 
 		 701 aa  73.6  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0576  catecholate siderophore receptor Fiu  22.32 
 
 		 754 aa  73.2  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000714833  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3657  TonB-dependent receptor  23.44 
 
 		 735 aa  73.2  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.558128  normal  0.251953 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25.47 
 
 		 711 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  23.35 
 
 		 782 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  22.97 
 
 		 774 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  22.03 
 
 		 720 aa  72.8  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4740  TonB-dependent siderophore receptor  22.79 
 
 		 726 aa  72  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.58513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3953  TonB-dependent siderophore receptor  21.95 
 
 		 701 aa  72  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000731032  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2473  putative TonB-dependent siderophore receptor  21.12 
 
 		 788 aa  72  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.805537 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5111  TonB-dependent receptor plug  23.87 
 
 		 733 aa  72  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  23.12 
 
 		 695 aa  71.6  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4674  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 		 692 aa  72  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>