More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0121 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0121  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 681 aa  1400    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.138382 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3269  TonB-dependent receptor  58.2 
 
 		 688 aa  813    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.35442 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3340  TonB-dependent receptor, putative  43.98 
 
 		 683 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2410  TonB-dependent receptor  43.33 
 
 		 683 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2066  TonB-dependent receptor  42.38 
 
 		 709 aa  517  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2896  TonB-dependent receptor  42.11 
 
 		 686 aa  515  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148838 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1855  TonB-dependent receptor, putative  43.09 
 
 		 693 aa  509  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0314757  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4448  TonB-dependent receptor  44.56 
 
 		 678 aa  501  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.634501  normal  0.211596 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02129  TonB-dependent receptor  41.15 
 
 		 667 aa  461  9.999999999999999e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.220582  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0836  TonB-dependent receptor for iron transport  37.79 
 
 		 683 aa  439  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0639266  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0747  TonB-dependent receptor  37.93 
 
 		 683 aa  438  1e-121  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.582563  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3112  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 687 aa  138  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.589119  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  23.49 
 
 		 711 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  25 
 
 		 721 aa  95.9  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 700 aa  94.7  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 700 aa  95.1  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 700 aa  95.1  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  24.23 
 
 		 782 aa  94.7  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  24.85 
 
 		 706 aa  94.7  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  24.85 
 
 		 706 aa  94  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0923  TonB-dependent siderophore receptor  24.51 
 
 		 777 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  24.85 
 
 		 706 aa  93.6  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  24.85 
 
 		 706 aa  93.6  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  23.21 
 
 		 728 aa  92.4  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  23.05 
 
 		 681 aa  93.2  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  22.55 
 
 		 726 aa  91.7  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2804  outer membrane receptor protein  24.53 
 
 		 692 aa  91.7  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 		 700 aa  91.3  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02035  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  22.12 
 
 		 705 aa  91.3  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2605  OM receptor TonB  23.22 
 
 		 787 aa  91.3  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0978096  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  24.2 
 
 		 700 aa  90.9  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  21.89 
 
 		 706 aa  91.3  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  21.89 
 
 		 706 aa  91.3  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  24.2 
 
 		 700 aa  90.9  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 		 700 aa  90.9  7e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  23.6 
 
 		 774 aa  90.5  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  24.2 
 
 		 782 aa  90.5  8e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  25.29 
 
 		 708 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  23.45 
 
 		 774 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 700 aa  89  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  22.58 
 
 		 708 aa  88.2  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  23.03 
 
 		 710 aa  87.8  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 700 aa  87  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3280  TonB-dependent siderophore receptor  25.62 
 
 		 707 aa  85.9  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0713327  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  22.54 
 
 		 711 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 709 aa  84.7  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  23.87 
 
 		 715 aa  84  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6273  TonB-dependent receptor  22.2 
 
 		 736 aa  83.2  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000590633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  22.52 
 
 		 706 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3657  TonB-dependent receptor  22.84 
 
 		 735 aa  82.4  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.558128  normal  0.251953 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  25.47 
 
 		 695 aa  82  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  22.43 
 
 		 707 aa  82  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1927  TonB dependent receptor  21.41 
 
 		 725 aa  81.3  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0622578  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  23.72 
 
 		 694 aa  81.3  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  24.66 
 
 		 709 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  25.16 
 
 		 696 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  22.31 
 
 		 710 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  21.17 
 
 		 706 aa  78.2  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01528  TonB-dependent receptor  21.81 
 
 		 720 aa  78.6  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5169  TonB-dependent siderophore receptor  23.33 
 
 		 723 aa  77.8  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  24.81 
 
 		 696 aa  77.4  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2473  putative TonB-dependent siderophore receptor  22.07 
 
 		 788 aa  77  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.805537 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  23.17 
 
 		 713 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  23.26 
 
 		 710 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1061  TonB-dependent receptor, plug  23.55 
 
 		 691 aa  75.9  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  27.35 
 
 		 709 aa  75.9  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  23.02 
 
 		 713 aa  75.5  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3442  TonB-dependent siderophore receptor  22.2 
 
 		 713 aa  75.5  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.827795  normal  0.101631 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  27.14 
 
 		 724 aa  74.7  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  24.07 
 
 		 682 aa  74.7  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1931  TonB-dependent siderophore receptor  22.09 
 
 		 723 aa  73.9  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1204  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  23.27 
 
 		 784 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.814963  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3267  putative outer membrane receptor for iron transport  29.1 
 
 		 712 aa  73.2  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.598995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  23.18 
 
 		 710 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  25.87 
 
 		 694 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  23.18 
 
 		 770 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  24.29 
 
 		 689 aa  72  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3297  TonB-dependent siderophore receptor  23.24 
 
 		 733 aa  72.4  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01819  outer membrane receptor protein, most likely Fe transport  22.29 
 
 		 716 aa  72.4  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000492197  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  25.35 
 
 		 715 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  23.31 
 
 		 742 aa  72  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  20.84 
 
 		 709 aa  71.6  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09970  type I ferripyoverdine receptor, FpvB  28.44 
 
 		 802 aa  71.6  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4743  TonB-dependent receptor, putative  23.77 
 
 		 690 aa  71.2  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4868  iron(III) dicitrate transport protein FecA  22.95 
 
 		 774 aa  70.9  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2477  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 		 681 aa  71.2  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3417  TonB dependent outer membrane ferrichrome-iron receptor  27.37 
 
 		 715 aa  70.9  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3062  TonB-dependent siderophore receptor  27.37 
 
 		 715 aa  70.9  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.173013 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  24.75 
 
 		 710 aa  70.5  0.00000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5111  TonB-dependent receptor plug  23.8 
 
 		 733 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  22.51 
 
 		 720 aa  70.5  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  22.94 
 
 		 791 aa  70.1  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  20.84 
 
 		 757 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  20.18 
 
 		 690 aa  70.5  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4640  TonB-dependent siderophore receptor  23.08 
 
 		 719 aa  69.7  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0269226  normal  0.305736 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2876  TonB-dependent siderophore receptor  22.25 
 
 		 751 aa  69.3  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2453  TonB-dependent siderophore receptor  22.96 
 
 		 720 aa  69.7  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1808  TonB-dependent siderophore receptor  24.75 
 
 		 739 aa  68.6  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  20.21 
 
 		 690 aa  68.9  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4681  TonB-dependent receptor  23.09 
 
 		 704 aa  68.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0656736  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>