More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1927 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1927  TonB dependent receptor  100 
 
 		 725 aa  1508    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0622578  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1863  TonB-dependent receptor  63.76 
 
 		 781 aa  947    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.150075  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2258  TonB-dependent receptor  61.29 
 
 		 708 aa  890    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0901  TonB-dependent receptor  38.02 
 
 		 735 aa  457  1e-127  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1883  TonB-dependent receptor  36.88 
 
 		 702 aa  453  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.118236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1609  TonB-dependent receptor  37.88 
 
 		 684 aa  433  1e-120  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.952193  normal  0.492474 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03830  putative TonB-dependent receptor protein  37.7 
 
 		 670 aa  432  1e-119  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1896  Outer membrane receptor proteins mostly Fe transport-like  30.57 
 
 		 687 aa  300  5e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0390326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0909  putative TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 711 aa  260  7e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.622893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4090  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 705 aa  260  8e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0485  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 702 aa  231  3e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.517963  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2993  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 705 aa  228  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.162079  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 757 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4534  TonB-dependent receptor  23.39 
 
 		 779 aa  147  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.732299 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1061  TonB-dependent receptor, plug  23.86 
 
 		 691 aa  94  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  21.76 
 
 		 728 aa  90.1  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3112  TonB-dependent receptor  22.03 
 
 		 687 aa  88.2  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.589119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  22.34 
 
 		 706 aa  88.2  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4073  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.11 
 
 		 630 aa  87.8  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000943492  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0142  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.11 
 
 		 630 aa  87.8  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000593825  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0747  TonB-dependent receptor  21.98 
 
 		 683 aa  87.8  6e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.582563  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02035  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  22.35 
 
 		 705 aa  86.7  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  21.86 
 
 		 721 aa  85.1  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.58 
 
 		 631 aa  84.7  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  21.82 
 
 		 706 aa  84.3  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0836  TonB-dependent receptor for iron transport  21.12 
 
 		 683 aa  84  0.000000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0639266  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  33.95 
 
 		 631 aa  84  0.000000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  22.24 
 
 		 700 aa  83.6  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  22.54 
 
 		 694 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  21.98 
 
 		 700 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  21.69 
 
 		 706 aa  82.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09350  TonB-dependent siderophore receptor  23.01 
 
 		 704 aa  83.2  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  21.98 
 
 		 700 aa  83.2  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  21.98 
 
 		 700 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  22.55 
 
 		 700 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0279  TonB-dependent receptor  22.57 
 
 		 730 aa  83.2  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.874959  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  21.69 
 
 		 706 aa  83.2  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  21.98 
 
 		 700 aa  83.2  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  21.69 
 
 		 706 aa  82.4  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.11 
 
 		 631 aa  82.4  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  22.11 
 
 		 700 aa  81.6  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  21.98 
 
 		 700 aa  81.3  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  23.19 
 
 		 688 aa  81.6  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  22.7 
 
 		 700 aa  81.3  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0121  TonB-dependent receptor  21.41 
 
 		 681 aa  81.3  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.138382 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 		 742 aa  80.1  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.62 
 
 		 631 aa  78.2  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  19.61 
 
 		 828 aa  78.2  0.0000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2341  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 764 aa  77.8  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02129  TonB-dependent receptor  22.73 
 
 		 667 aa  78.2  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.220582  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  27.51 
 
 		 633 aa  76.6  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.31 
 
 		 615 aa  76.6  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  21.97 
 
 		 681 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  23.4 
 
 		 626 aa  75.1  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4020  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.72 
 
 		 615 aa  75.5  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000194494  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0865  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 700 aa  75.1  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0848071  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  35.15 
 
 		 628 aa  74.7  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1657  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 715 aa  74.7  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3340  TonB-dependent receptor, putative  20.33 
 
 		 683 aa  74.3  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  23.65 
 
 		 626 aa  73.9  0.000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.19 
 
 		 614 aa  73.6  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1377  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 713 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0560  TonB-dependent receptor, plug  29.61 
 
 		 623 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1382  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 717 aa  73.9  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530841  hitchhiker  0.000808374 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.94 
 
 		 623 aa  73.6  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4020  TonB-dependent vitamin B12 receptor  31.51 
 
 		 614 aa  73.2  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348064  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0525  B12 family TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 641 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4507  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.51 
 
 		 614 aa  73.2  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000315572  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4050  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.51 
 
 		 614 aa  73.2  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00780594  decreased coverage  0.000540594 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  23.32 
 
 		 776 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4200  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.51 
 
 		 614 aa  73.2  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101627  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2662  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 781 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3640  TonB-dependent siderophore receptor  27.51 
 
 		 708 aa  73.2  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168279  normal  0.0985281 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0571  TonB-dependent receptor plug  29.56 
 
 		 628 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5430  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.51 
 
 		 614 aa  72  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0043717  normal  0.0207602 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  22.18 
 
 		 710 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3720  TonB-dependent siderophore receptor  22.12 
 
 		 745 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00118596  normal  0.0278628 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  22.45 
 
 		 708 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4868  iron(III) dicitrate transport protein FecA  24.3 
 
 		 774 aa  71.6  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0299  TonB-dependent siderophore receptor  22.26 
 
 		 745 aa  71.6  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000445581  hitchhiker  0.000163743 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 649 aa  71.6  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  22.02 
 
 		 715 aa  70.9  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 611 aa  70.9  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0734  TonB-dependent receptor  22.87 
 
 		 736 aa  70.9  0.00000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1449  TonB-dependent receptor  23.32 
 
 		 740 aa  70.9  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.389596 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1186  TonB-dependent receptor  22.34 
 
 		 634 aa  70.1  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.874956  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5364  TonB-dependent receptor plug  31.55 
 
 		 729 aa  70.5  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0781  TonB-dependent receptor  23.76 
 
 		 757 aa  70.5  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.877086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0392  TonB-dependent receptor, plug  22.15 
 
 		 717 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.829697  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2631  TonB-dependent receptor domain-containing protein  29.79 
 
 		 646 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.221793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6535  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 694 aa  68.9  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.822423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3730  TonB-dependent receptor  34.07 
 
 		 637 aa  68.9  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0159073  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  23.12 
 
 		 825 aa  68.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2804  outer membrane receptor protein  23.11 
 
 		 692 aa  68.9  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2047  TonB-dependent siderophore receptor  23.74 
 
 		 716 aa  68.6  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977961 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2172  TonB-dependent receptor, plug  27.49 
 
 		 687 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  29.71 
 
 		 659 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002156  outer membrane vitamin B12 receptor BtuB  29.87 
 
 		 611 aa  68.2  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122091  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1559  TonB-dependent receptor plug  29.59 
 
 		 706 aa  67.8  0.0000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000264695  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2410  TonB-dependent receptor  19.61 
 
 		 683 aa  67.8  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>