More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4448 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0747  TonB-dependent receptor  52.95 
 
 		 683 aa  700    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.582563  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3340  TonB-dependent receptor, putative  50.75 
 
 		 683 aa  664    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2410  TonB-dependent receptor  49.2 
 
 		 683 aa  652    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4448  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 678 aa  1345    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.634501  normal  0.211596 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0836  TonB-dependent receptor for iron transport  53.4 
 
 		 683 aa  705    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0639266  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2896  TonB-dependent receptor  66.57 
 
 		 686 aa  911    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148838 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02129  TonB-dependent receptor  58.23 
 
 		 667 aa  748    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.220582  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2066  TonB-dependent receptor  65.98 
 
 		 709 aa  902    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1855  TonB-dependent receptor, putative  48.29 
 
 		 693 aa  620  1e-176  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0314757  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0121  TonB-dependent receptor  44.56 
 
 		 681 aa  501  1e-140  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.138382 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3269  TonB-dependent receptor  40.24 
 
 		 688 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.35442 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3112  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 687 aa  125  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.589119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2804  outer membrane receptor protein  26.95 
 
 		 692 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2598  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 723 aa  92  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00053771  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0729  TonB-dependent receptor, plug  24.47 
 
 		 656 aa  87  9e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000181168  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09350  TonB-dependent siderophore receptor  23.32 
 
 		 704 aa  82  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2631  TonB-dependent receptor domain-containing protein  24.33 
 
 		 646 aa  79  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.221793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  24.19 
 
 		 706 aa  77.4  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2688  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 		 720 aa  76.6  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 709 aa  76.6  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2477  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 681 aa  77  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0663  TonB-dependent receptor  22.22 
 
 		 652 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136044  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1383  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 702 aa  76.3  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00790883  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  23.66 
 
 		 706 aa  76.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  23.85 
 
 		 706 aa  75.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2605  OM receptor TonB  23.15 
 
 		 787 aa  75.5  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0978096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 		 700 aa  75.1  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 		 700 aa  75.1  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 		 700 aa  74.7  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 688 aa  74.7  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  23.8 
 
 		 689 aa  74.7  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  23.85 
 
 		 706 aa  74.7  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3559  TonB-dependent receptor  23.85 
 
 		 665 aa  74.3  0.000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00145171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  23.38 
 
 		 721 aa  73.9  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 700 aa  73.9  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3709  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 681 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  24.82 
 
 		 700 aa  72.8  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  24.82 
 
 		 700 aa  72.8  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  23.67 
 
 		 688 aa  72.8  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3472  TonB-dependent siderophore receptor  21.9 
 
 		 653 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0503687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2201  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 736 aa  72.4  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.407628  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 		 675 aa  71.6  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 700 aa  71.6  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  21.7 
 
 		 799 aa  71.6  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  23.86 
 
 		 728 aa  70.9  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01819  outer membrane receptor protein, most likely Fe transport  24.83 
 
 		 716 aa  70.9  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000492197  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0651  TonB-dependent siderophore receptor  21.82 
 
 		 653 aa  70.9  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.68611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  21.05 
 
 		 701 aa  70.5  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  21.39 
 
 		 733 aa  69.7  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1868  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 734 aa  69.3  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.155376  normal  0.191225 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0021  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 705 aa  69.3  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  22.35 
 
 		 653 aa  69.7  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3552  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 737 aa  69.7  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0127436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1657  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 715 aa  68.9  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3302  TonB-dependent siderophore receptor  21.82 
 
 		 653 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00384842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 700 aa  68.2  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0815  TonB-dependent receptor domain-containing protein  21.54 
 
 		 653 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43940  TonB-dependent receptor family  23.62 
 
 		 715 aa  67.8  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.204907  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2019  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 742 aa  67.8  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850916  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6273  TonB-dependent receptor  22.56 
 
 		 736 aa  67.4  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000590633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3576  TonB-dependent receptor  23.28 
 
 		 653 aa  67.4  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.313951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  23.03 
 
 		 694 aa  67.4  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1061  TonB-dependent receptor, plug  26.67 
 
 		 691 aa  67.4  0.0000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  25.34 
 
 		 726 aa  66.6  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  26.67 
 
 		 701 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2188  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 680 aa  66.2  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3736  TonB-dependent siderophore receptor  21.14 
 
 		 735 aa  66.2  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 715 aa  65.9  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3644  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 653 aa  66.2  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388894  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3176  TonB-dependent siderophore receptor  24.66 
 
 		 653 aa  65.9  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 731 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2473  putative TonB-dependent siderophore receptor  21.09 
 
 		 788 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.805537 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5111  TonB-dependent receptor plug  23.96 
 
 		 733 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3901  TonB-dependent receptor  19.28 
 
 		 734 aa  65.5  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.707047  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1382  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 717 aa  65.5  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530841  hitchhiker  0.000808374 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22830  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 678 aa  65.5  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0688062  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3767  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 653 aa  65.5  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  22.8 
 
 		 720 aa  64.7  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  22.74 
 
 		 706 aa  65.1  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  26.67 
 
 		 701 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  22.5 
 
 		 659 aa  64.7  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  23.82 
 
 		 782 aa  64.7  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1472  TonB-dependent receptor plug  23.9 
 
 		 704 aa  64.3  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1310  TonB-dependent receptor plug  23.9 
 
 		 704 aa  64.3  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.475424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0901  TonB-dependent receptor  20.55 
 
 		 735 aa  64.3  0.000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1076  iron transporter  24.9 
 
 		 743 aa  64.3  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.337763 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3280  TonB-dependent siderophore receptor  26.87 
 
 		 707 aa  63.9  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0713327  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  26.33 
 
 		 701 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  22.69 
 
 		 817 aa  62.4  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 742 aa  63.2  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  22.91 
 
 		 646 aa  62.4  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2990  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 656 aa  62.8  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1863  TonB-dependent receptor  21.8 
 
 		 781 aa  62.4  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.150075  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  23.5 
 
 		 709 aa  62.4  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  24.17 
 
 		 791 aa  62  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0734  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 736 aa  62.4  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  22.78 
 
 		 779 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 705 aa  61.6  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2993  TonB-dependent receptor  21.1 
 
 		 705 aa  62  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.162079  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4030  TonB-dependent receptor:Lipocalin  22.19 
 
 		 713 aa  61.6  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>