More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_43940 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_43940  TonB-dependent receptor family  100 
 
 		 715 aa  1461    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.204907  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1728  TonB-dependent receptor  43.26 
 
 		 690 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322796  normal  0.420828 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1856  TonB-dependent receptor  43.79 
 
 		 688 aa  525  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405305  normal  0.0244044 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4137  outer membrane siderophore receptor, putative  43.26 
 
 		 690 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4581  TonB-dependent receptor  41.7 
 
 		 718 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2318  TonB-dependent receptor  40.43 
 
 		 708 aa  478  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2555  TonB-dependent receptor  39.35 
 
 		 702 aa  459  9.999999999999999e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3709  TonB-dependent receptor  32.55 
 
 		 681 aa  296  9e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4484  TonB-dependent receptor  33.04 
 
 		 726 aa  277  4e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.429644  normal  0.265878 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2019  TonB-dependent receptor  31.59 
 
 		 742 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850916  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3552  TonB-dependent receptor  31.34 
 
 		 737 aa  273  9e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0127436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22830  TonB-dependent receptor  32.18 
 
 		 678 aa  268  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0688062  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5609  putative TonB-dependent receptor protein  31.26 
 
 		 727 aa  261  4e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.195075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1868  TonB-dependent receptor  30.86 
 
 		 734 aa  260  6e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.155376  normal  0.191225 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2201  TonB-dependent receptor  30.71 
 
 		 736 aa  257  6e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.407628  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4674  TonB-dependent receptor  31.27 
 
 		 692 aa  249  9e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4246  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 		 698 aa  237  6e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4565  TonB-dependent receptor  30.29 
 
 		 733 aa  233  9e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.372815  normal  0.147883 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0808  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 714 aa  228  4e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131492 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2704  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 700 aa  224  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1377  TonB-dependent receptor  31.28 
 
 		 713 aa  223  8e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1382  TonB-dependent receptor  30.9 
 
 		 717 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530841  hitchhiker  0.000808374 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1657  TonB-dependent receptor  30.31 
 
 		 715 aa  221  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3267  putative outer membrane receptor for iron transport  29.06 
 
 		 712 aa  219  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.598995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2651  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 800 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6067  TonB-dependent receptor  30.52 
 
 		 716 aa  215  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.341799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1302  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 702 aa  208  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220115  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3065  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 786 aa  204  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.935063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0940  TonB-dependent receptor  30.42 
 
 		 706 aa  204  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1794  TonB-dependent receptor  29.57 
 
 		 664 aa  195  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3149  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 785 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2477  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 681 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0836  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 787 aa  180  9e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1449  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 740 aa  169  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.389596 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4534  putative TonB-dependent receptor protein  26.15 
 
 		 797 aa  119  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.38874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2688  TonB-dependent receptor  33.56 
 
 		 720 aa  107  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 675 aa  104  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1407  TonB-dependent siderophore receptor  26.16 
 
 		 705 aa  100  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4173  TonB-dependent receptor  32.32 
 
 		 739 aa  99.8  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  22.56 
 
 		 701 aa  99  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  24.02 
 
 		 728 aa  97.1  9e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 688 aa  94.7  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 		 720 aa  94.4  7e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1543  TonB-dependent receptor plug  26.79 
 
 		 712 aa  93.6  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0571  TonB-dependent receptor  23.33 
 
 		 778 aa  92.8  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2795  TonB-dependent receptor  23.12 
 
 		 701 aa  92.4  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5661  TonB-dependent receptor  24.18 
 
 		 769 aa  91.7  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 		 715 aa  90.1  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 678 aa  90.5  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 694 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  23.9 
 
 		 706 aa  89  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  23.9 
 
 		 721 aa  89  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  23.9 
 
 		 706 aa  88.6  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 700 aa  87.8  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 700 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 700 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  22.22 
 
 		 706 aa  87  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  23.76 
 
 		 706 aa  86.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  23.76 
 
 		 706 aa  86.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 700 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 700 aa  86.7  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 700 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  24.28 
 
 		 693 aa  85.5  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4090  TonB-dependent receptor  22.9 
 
 		 705 aa  85.5  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 700 aa  84.3  0.000000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3149  TonB-dependent receptor  23.24 
 
 		 776 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0958639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4567  TonB-dependent siderophore receptor  24.12 
 
 		 746 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.436524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  23.38 
 
 		 709 aa  83.6  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 688 aa  82.4  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0831  TonB-dependent receptor plug  25.59 
 
 		 721 aa  82.4  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.519524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3048  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 		 774 aa  81.6  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.20503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  24.47 
 
 		 710 aa  81.6  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3275  TonB-dependent siderophore receptor  25.49 
 
 		 742 aa  81.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2924  TonB-dependent receptor  23.53 
 
 		 776 aa  81.3  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.753718  normal  0.115907 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 705 aa  81.3  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2060  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 708 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.267326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0722  TonB-dependent siderophore receptor  24.88 
 
 		 675 aa  79.3  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0909  putative TonB-dependent receptor  22.93 
 
 		 711 aa  79.3  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.622893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3661  hypothetical protein  24.19 
 
 		 702 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2243  putative TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 720 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1853  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 721 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4534  TonB-dependent receptor  22.9 
 
 		 779 aa  79  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.732299 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 721 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43650  hypothetical protein  24.58 
 
 		 705 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00638923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  23.35 
 
 		 687 aa  76.6  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2786  TonB-dependent receptor  24.1 
 
 		 644 aa  76.6  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.934768  normal  0.0544871 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  22.28 
 
 		 728 aa  76.6  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4209  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 707 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0227  TonB-dependent siderophore receptor  23.91 
 
 		 738 aa  75.1  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0393  TonB-dependent receptor  21.97 
 
 		 670 aa  74.7  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.431607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0102  TonB-dependent siderophore receptor  24.02 
 
 		 755 aa  74.7  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.058066  normal  0.995779 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2752  TonB-dependent receptor  23.16 
 
 		 736 aa  74.7  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000933457  normal  0.355865 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12568  probable TonB-dependent receptor YncD precursor  24.09 
 
 		 762 aa  73.2  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2420  TonB-dependent siderophore receptor  24.74 
 
 		 728 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 851 aa  72.8  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 853 aa  72.8  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  21.51 
 
 		 690 aa  73.2  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  22.1 
 
 		 747 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  23.35 
 
 		 741 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  24.24 
 
 		 761 aa  71.6  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>