196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1543 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1543  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 712 aa  1404    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4173  TonB-dependent receptor  31.1 
 
 		 739 aa  261  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1449  TonB-dependent receptor  32.2 
 
 		 740 aa  261  3e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.389596 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3065  TonB-dependent receptor  29.62 
 
 		 786 aa  237  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.935063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3149  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 785 aa  237  7e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0836  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 787 aa  234  3e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4484  TonB-dependent receptor  29.93 
 
 		 726 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.429644  normal  0.265878 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1382  TonB-dependent receptor  30.18 
 
 		 717 aa  228  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530841  hitchhiker  0.000808374 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1377  TonB-dependent receptor  30.17 
 
 		 713 aa  228  3e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4565  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 733 aa  227  5.0000000000000005e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.372815  normal  0.147883 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1657  TonB-dependent receptor  29.88 
 
 		 715 aa  226  8e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1868  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 734 aa  224  4.9999999999999996e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.155376  normal  0.191225 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2201  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 736 aa  220  7.999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.407628  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2704  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 700 aa  216  8e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3552  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 737 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0127436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4246  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 698 aa  213  7e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3709  TonB-dependent receptor  30.69 
 
 		 681 aa  212  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1302  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 702 aa  211  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220115  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2019  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 742 aa  210  7e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850916  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0940  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 706 aa  210  8e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22830  TonB-dependent receptor  31.86 
 
 		 678 aa  209  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0688062  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6067  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 716 aa  203  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.341799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5609  putative TonB-dependent receptor protein  27.62 
 
 		 727 aa  200  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.195075 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0808  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 714 aa  197  6e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131492 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2688  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 		 720 aa  196  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2477  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 		 681 aa  187  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1856  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 688 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405305  normal  0.0244044 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1794  TonB-dependent receptor  30.61 
 
 		 664 aa  172  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4137  outer membrane siderophore receptor, putative  27.92 
 
 		 690 aa  169  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1728  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 690 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322796  normal  0.420828 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2318  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 708 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4581  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 718 aa  158  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3267  putative outer membrane receptor for iron transport  27.01 
 
 		 712 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.598995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2555  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 702 aa  147  9e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43940  TonB-dependent receptor family  25.07 
 
 		 715 aa  143  9e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.204907  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2651  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 800 aa  128  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4674  TonB-dependent receptor  30.51 
 
 		 692 aa  120  9e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 709 aa  107  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 675 aa  101  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  22.6 
 
 		 728 aa  95.9  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  23.72 
 
 		 700 aa  95.5  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 715 aa  94.7  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  23.12 
 
 		 700 aa  94  8e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  23.12 
 
 		 700 aa  94  9e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  23.12 
 
 		 700 aa  93.6  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  23.12 
 
 		 700 aa  93.6  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 731 aa  92.8  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  23.12 
 
 		 700 aa  92.8  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  23.12 
 
 		 700 aa  92.8  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  23.12 
 
 		 700 aa  91.7  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 		 700 aa  91.3  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0021  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 705 aa  88.2  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 705 aa  87.4  8e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1061  TonB-dependent receptor, plug  25.38 
 
 		 691 aa  87.4  9e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2188  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 680 aa  87  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  24.45 
 
 		 678 aa  85.5  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  21.99 
 
 		 706 aa  84.7  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 706 aa  84.3  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  21.99 
 
 		 706 aa  84.3  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  21.99 
 
 		 706 aa  84.3  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  21.85 
 
 		 706 aa  84  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  24.01 
 
 		 710 aa  84  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  21.99 
 
 		 721 aa  83.2  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  23.09 
 
 		 706 aa  83.2  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0733  tonB-dependent receptor  22.41 
 
 		 680 aa  83.2  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  23.89 
 
 		 681 aa  80.9  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1076  iron transporter  24.86 
 
 		 743 aa  80.1  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.337763 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0022  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 697 aa  79.7  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000255766 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1763  TonB-dependent receptor plug  24.07 
 
 		 703 aa  79  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0187171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3048  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 774 aa  77.8  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.20503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0571  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 		 778 aa  77  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0732  TonB-dependent receptor  22.55 
 
 		 688 aa  75.9  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.244967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2498  TonB-dependent receptor  22.22 
 
 		 770 aa  75.9  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.111731 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 688 aa  74.3  0.000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2598  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 723 aa  73.2  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00053771  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  33.97 
 
 		 703 aa  72.4  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 742 aa  71.6  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 694 aa  71.2  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1826  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 723 aa  70.1  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2795  TonB-dependent receptor  22.8 
 
 		 701 aa  70.1  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0609  TonB-dependent siderophore receptor  26.57 
 
 		 710 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1468  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 		 682 aa  70.1  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  28.25 
 
 		 726 aa  68.6  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03467  TonB-dependent outer membrane Receptor  24.48 
 
 		 712 aa  68.6  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4534  putative TonB-dependent receptor protein  33.51 
 
 		 797 aa  67.8  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.38874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  28.4 
 
 		 701 aa  67  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001068  vibrioferrin receptor PvuA  32.2 
 
 		 712 aa  67  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3149  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 776 aa  65.1  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0958639  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12568  probable TonB-dependent receptor YncD precursor  23.74 
 
 		 762 aa  64.3  0.000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2924  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 776 aa  63.9  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.753718  normal  0.115907 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3851  TonB-dependent siderophore receptor  28.45 
 
 		 711 aa  63.5  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3142  TonB-dependent siderophore receptor  30.05 
 
 		 688 aa  63.2  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09350  TonB-dependent siderophore receptor  28.02 
 
 		 704 aa  62  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1280  TonB-dependent siderophore receptor  39.05 
 
 		 731 aa  62  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0800812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3667  TonB-dependent receptor plug  27.55 
 
 		 624 aa  61.6  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  29.48 
 
 		 661 aa  60.5  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2953  TonB-dependent receptor  33.06 
 
 		 700 aa  58.9  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.191776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2902  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 791 aa  58.9  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.119413 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0781  TonB-dependent receptor  23.85 
 
 		 757 aa  57.4  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.877086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1025  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 791 aa  57.4  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>