261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0733 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0733  tonB-dependent receptor  100 
 
 		 680 aa  1408    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0732  TonB-dependent receptor  51.92 
 
 		 688 aa  634  1e-180  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.244967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1468  TonB-dependent receptor  47.77 
 
 		 682 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1763  TonB-dependent receptor plug  39.48 
 
 		 703 aa  420  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0187171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5774  TonB-dependent receptor plug  35.54 
 
 		 690 aa  378  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.872771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2498  TonB-dependent receptor  31.48 
 
 		 770 aa  254  5.000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.111731 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12568  probable TonB-dependent receptor YncD precursor  25.98 
 
 		 762 aa  210  8e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0423  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 696 aa  205  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1567  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 780 aa  175  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615105  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  23.09 
 
 		 688 aa  148  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  23.52 
 
 		 675 aa  139  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2188  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 680 aa  137  5e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  23.59 
 
 		 731 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1377  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 713 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  23.02 
 
 		 694 aa  122  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  23.82 
 
 		 715 aa  120  7e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  23 
 
 		 706 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  23 
 
 		 706 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  23 
 
 		 706 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  23 
 
 		 721 aa  119  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  23 
 
 		 706 aa  118  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1061  TonB-dependent receptor, plug  23.63 
 
 		 691 aa  118  3.9999999999999997e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  22.32 
 
 		 700 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  22.85 
 
 		 700 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  22.17 
 
 		 700 aa  114  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  22.17 
 
 		 700 aa  114  6e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  22.17 
 
 		 700 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 720 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  22.17 
 
 		 700 aa  112  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1382  TonB-dependent receptor  23.49 
 
 		 717 aa  112  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530841  hitchhiker  0.000808374 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1657  TonB-dependent receptor  23.39 
 
 		 715 aa  112  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.818594 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  22.02 
 
 		 700 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  22.02 
 
 		 700 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1302  TonB-dependent receptor  22.86 
 
 		 702 aa  108  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220115  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  21.88 
 
 		 700 aa  108  5e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6067  TonB-dependent receptor  22.82 
 
 		 716 aa  105  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.341799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3267  putative outer membrane receptor for iron transport  25.2 
 
 		 712 aa  105  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.598995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  23.29 
 
 		 681 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  21.88 
 
 		 705 aa  102  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2598  TonB-dependent receptor  23.34 
 
 		 723 aa  102  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00053771  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0021  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 705 aa  100  7e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4674  TonB-dependent receptor  22.46 
 
 		 692 aa  98.6  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0808  TonB-dependent receptor  21.05 
 
 		 714 aa  96.3  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131492 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  21.83 
 
 		 742 aa  93.2  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3709  TonB-dependent receptor  22.87 
 
 		 681 aa  93.2  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2704  TonB-dependent receptor  23.67 
 
 		 700 aa  91.7  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 709 aa  91.7  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4246  TonB-dependent receptor  22.85 
 
 		 698 aa  86.7  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 706 aa  87  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  26.46 
 
 		 728 aa  86.3  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0940  TonB-dependent receptor  21.87 
 
 		 706 aa  85.1  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2795  TonB-dependent receptor  23.11 
 
 		 701 aa  84  0.000000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0909  putative TonB-dependent receptor  21.77 
 
 		 711 aa  82.8  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.622893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 678 aa  80.5  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1856  TonB-dependent receptor  23.42 
 
 		 688 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405305  normal  0.0244044 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  24.14 
 
 		 726 aa  78.6  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  29.21 
 
 		 701 aa  78.2  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2477  TonB-dependent receptor  21.65 
 
 		 681 aa  77.4  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4137  outer membrane siderophore receptor, putative  22.49 
 
 		 690 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3353  TonB-dependent receptor plug  22.59 
 
 		 736 aa  77  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130298  normal  0.417052 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1728  TonB-dependent receptor  22.33 
 
 		 690 aa  75.9  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322796  normal  0.420828 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2902  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 791 aa  74.7  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.119413 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5609  putative TonB-dependent receptor protein  28.95 
 
 		 727 aa  74.3  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.195075 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4484  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 726 aa  73.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.429644  normal  0.265878 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22830  TonB-dependent receptor  23.48 
 
 		 678 aa  73.2  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0688062  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1025  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 791 aa  72  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 706 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0022  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 697 aa  72  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000255766 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4173  TonB-dependent receptor  22.01 
 
 		 739 aa  71.2  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4534  putative TonB-dependent receptor protein  27.19 
 
 		 797 aa  70.9  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.38874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2688  TonB-dependent receptor  21.84 
 
 		 720 aa  70.5  0.00000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4565  TonB-dependent receptor  29.78 
 
 		 733 aa  70.5  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.372815  normal  0.147883 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1994  TonB-dependent receptor  31.94 
 
 		 698 aa  69.7  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  24.81 
 
 		 710 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1826  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 723 aa  69.3  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1076  iron transporter  25.59 
 
 		 743 aa  68.9  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.337763 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4581  TonB-dependent receptor  20.4 
 
 		 718 aa  68.2  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03467  TonB-dependent outer membrane Receptor  27.59 
 
 		 712 aa  67  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2631  TonB-dependent receptor domain-containing protein  34.72 
 
 		 646 aa  66.6  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.221793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 753 aa  65.1  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  20.71 
 
 		 715 aa  64.7  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1868  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 734 aa  63.2  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.155376  normal  0.191225 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1449  TonB-dependent receptor  21.17 
 
 		 740 aa  62.4  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.389596 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2555  TonB-dependent receptor  21.61 
 
 		 702 aa  62.8  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3149  TonB-dependent receptor  21.79 
 
 		 785 aa  62  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2924  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 776 aa  62  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.753718  normal  0.115907 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3149  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 776 aa  62  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0958639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2201  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 736 aa  61.6  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.407628  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 679 aa  62  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2953  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 700 aa  60.8  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.191776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2019  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 742 aa  60.5  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850916  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1543  TonB-dependent receptor plug  29.36 
 
 		 712 aa  60.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1458  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 694 aa  60.5  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.552636  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3048  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 774 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.20503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1280  TonB-dependent siderophore receptor  24.07 
 
 		 731 aa  60.1  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0800812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43940  TonB-dependent receptor family  21.52 
 
 		 715 aa  60.5  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.204907  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3090  ferric vibrioferrin receptor  21.59 
 
 		 690 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0290295  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0713  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 729 aa  58.9  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000508975  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4090  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 		 705 aa  58.5  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  21.72 
 
 		 757 aa  57.4  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>